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2012-2013年深圳市呼吸道合胞病毒流行规律及分子变异分析 被引量:8
1
作者 吴春利 +3 位作者 阳帆 黄达娜 李玥 张仁利 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期737-741,共5页
目的:初步了解深圳市呼吸道合胞病毒的流行规律及分子变异特点。方法荧光RT-PCR对流感样病例样本进行初筛后,通过巢式RT-PCR对病毒G蛋白基因C端的可变区进行扩增,利用MEGA等软件进行分子变异分析。结果呼吸道合胞病毒在深圳的流行较... 目的:初步了解深圳市呼吸道合胞病毒的流行规律及分子变异特点。方法荧光RT-PCR对流感样病例样本进行初筛后,通过巢式RT-PCR对病毒G蛋白基因C端的可变区进行扩增,利用MEGA等软件进行分子变异分析。结果呼吸道合胞病毒在深圳的流行较为普遍,流行高峰一般出现在春季和夏秋季;流行的病毒有A、B两个亚型, NA1和BAⅨ分别是其流行株系的基因型;病毒G蛋白C端的变异位点较为散乱,少数变异导致了病毒糖基化位点消失。一株包含24个氨基酸插入序列的新型重组毒株出现在2013年,此重组株很有可能是由国外传入我国。结论呼吸道合胞病毒在深圳存在持续而广泛的流行,而且病毒仍处在不断的进化和变异之中。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 流行规律 分子变异
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广西壮族人群HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1高分辨等位基因多态性和单倍型的研究 被引量:6
2
作者 裴永峰 余梅 +2 位作者 黄惠妮 李恒聪 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期1397-1405,共9页
目的:分析广西壮族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型的特点。方法:采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT),对广... 目的:分析广西壮族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型的特点。方法:采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT),对广西地区350名壮族非亲缘个体进行HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1测序分析,使用Arlequin软件(3.5.2.2)计算HLA等位基因频率、单倍型频率,使用MEGA v6.0软件构建系统发生树和用SPSS软件做主成分分析。结果:该人群5个位点,只有HLA-A和DRB1位点的等位基因分布偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。总共检出19种HLA-A等位基因,42种HLA-B等位基因,22种HLA-C等位基因,25种HLA-DRB1等位基因和15种HLA-DQB1等位基因。等位基因频率最高的分别是A*11:01(28.57%)、B*46:01(14.00%)、C*01:02(18.43%)、DRB1*16:02(15.71%)和DQB1*05:02(35.00%),最常见的5位点单倍型是A*33:03-C*03:02-B*58:01-DRB1*03:01-DQB1*02:01(6.86%),系统发生树结果表明该人群与南方汉族人群亲缘关系较近。结论:广西壮族人群HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型有较高的遗传多态性。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 基因频率 单倍体型 广西壮族 多态性
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广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1高分辨等位基因和单倍型多态性的初步分析 被引量:5
3
作者 裴永峰 黄惠妮 +2 位作者 李恒聪 吴国光 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期645-654,共10页
目的分析广西汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型的分布特征。方法采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对广西地区1 64... 目的分析广西汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型的分布特征。方法采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对广西地区1 644名汉族无关个体进行HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型多态性的分型,使用Arlequin软件(3.5.2.2)计算HLA等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡参数。使用MEGA v6.0软件构建系统发生树,并与其他部分中国汉族人群的基因频率进行比较。结果该人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因分布均偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),3个位点分别检出37种HLA-A,70种HLA-B和37种HLA-DRB1等位基因。其中,等位基因频率分布最高的分别是A~*11∶01(28.86%)、B~*46∶01(14.26%)和DRB1~*15∶01(13.32%),最常见的单倍型是A~*33:03-B~*58∶01-DRB1~*03∶01(6.12%),A~*02∶07-B~*46∶01、A~*11∶01-DRB1~*15∶01和B~*58∶01-DRB1~*03∶01呈现最强的连锁不平衡。该人群与广西壮族人群亲缘关系最近,其多态性最接近的汉族是中国南方汉族。结论广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型有较高的遗传多态性,将为中国人群在临床寻找HLA匹配的无关亲缘供者、法医学研究以及人类学研究等提供有价值的遗传学依据。 展开更多
关键词 基因频率 广西汉族 单倍体型 人类白细胞抗原 多态性
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CD36 c.C275T基因突变导致CD36缺失的研究
4
作者 蒋丽红 李丽兰 《现代医药卫生》 2023年第5期730-734,共5页
目的研究在广西CD36缺失个体中检测到的CD36基因突变c.C275T,是否可导致CD36缺失和在人群中的发生率。方法采用血小板抗原单克隆抗体特异性免疫固定试验(MAIPA)和流式细胞技术检测确定广西地区1位汉族男性个体(XXX)的CD36表型,应用CD36... 目的研究在广西CD36缺失个体中检测到的CD36基因突变c.C275T,是否可导致CD36缺失和在人群中的发生率。方法采用血小板抗原单克隆抗体特异性免疫固定试验(MAIPA)和流式细胞技术检测确定广西地区1位汉族男性个体(XXX)的CD36表型,应用CD36外显子测序、cDNA克隆测序对其CD36缺失的分子基础展开研究,构建真核表达细胞株及应用蛋白免疫印迹试验(Western blot)验证所检测到的CD36突变基因对CD36表达的影响。应用所建立的针对该突变基因的DNA PCR-SSP基因分型方法,在随机的无血缘关系的1026名广西地区人群中进行人群分布调查。结果经MAIPA和流式细胞技术检测鉴定XXX的CD36表型为Ⅱ型CD36缺失。CD36外显子测序发现其具有CD36 c.C275T(p.Thr92Met)突变,为突变杂合子,CD36 cDNA克隆测序发现该个体具有c.275C>T(p.Thr92Met)突变型和CD36野生型2种CD36 mRNA转录本。通过建立的真核表达细胞株及Western blot验证结果显示CD36 c.275C>T异常转录本可导致CD36表达缺失。该基因突变在人群的发生率研究显示,在随机的1026名广西人群中,CD36 c.275C>T突变的人群发生率为0。结论CD36基因突变c.275C>T(p.Thr92Met)可导致CD36缺失,并初步阐明了其导致CD36缺失的分子基础及在广西地区人群中的分布特征,为了解中国人群CD36缺失的分子基础和特征提供了实验和理论依据。 展开更多
关键词 CD36缺失 基因突变 分子机制及特征 人群分布
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广西地区8例类孟买血型个体的血清学鉴定及FUT1基因突变分析 被引量:2
5
作者 刘金莲 刘学军 +2 位作者 马婷婷 李丽兰 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1318-1324,共7页
目的:对广西地区8例类孟买血型个体进行血清学及分子生物学背景分析。方法:采用血型血清学方法对研究标本进行血型鉴定,用分子生物学方法进行基因型分析,包括以PCR-SSP方法进行ABO基因分型和测序,对决定H抗原表达的FUT1基因进行分析。结... 目的:对广西地区8例类孟买血型个体进行血清学及分子生物学背景分析。方法:采用血型血清学方法对研究标本进行血型鉴定,用分子生物学方法进行基因型分析,包括以PCR-SSP方法进行ABO基因分型和测序,对决定H抗原表达的FUT1基因进行分析。结果:8例类孟买血型中,4例为B_(m)^(h),4例为A_(m)^(h)。FUT1基因测序结果显示,6例为h3h3突变[c.658C>T(p.Arg220Cys)突变纯合子],1例为h^(832)h^(832)突变[c.832G>A(p.Asp278Asn)突变纯合子],1例为h^(328)h3突变[c.328G>A(p.Ala110Thr)突变杂合子合并c.658C>T(p.Arg220Cys)突变杂合子]。结论:类孟买血型存在多种分子遗传机制,在本研究中,广西地区类孟买血型个体中发现导致类孟买血型的FUT1基因突变主要包括h3、h^(328)和h^(832) 3种,其中以h3突变最多见。 展开更多
关键词 类孟买血型 血型血清学 FUT1基因 基因突变
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导致CD36缺失的基因新突变CD36c.T200A(p.Ile67Asn)
6
作者 蒋丽红 吴国光 +1 位作者 李丽兰 《海南医学》 CAS 2022年第24期3136-3139,共4页
目的研究广西CD36缺失人群中发现的一个CD36基因新突变,及其导致CD36缺失的分子生物学基础。方法先证者,女性,壮族,为广西人群中检测到的一名CD36缺失个体,应用流式细胞术和血小板抗原单克隆抗体特异性免疫固定实验(MAIPA)检测确定其CD3... 目的研究广西CD36缺失人群中发现的一个CD36基因新突变,及其导致CD36缺失的分子生物学基础。方法先证者,女性,壮族,为广西人群中检测到的一名CD36缺失个体,应用流式细胞术和血小板抗原单克隆抗体特异性免疫固定实验(MAIPA)检测确定其CD36表型;使用DNA外显子测序和c DNA克隆测序检测分析其CD36外显子和mRNA序列,针对所发现的CD36 mRNA转录本变异体,建立该变异体的真核表达细胞株,应用Western Blot验证其是否影响CD36的表达。结果先证者的CD36表型经MAIPA和流式细胞术鉴定为Ⅰ型CD36缺失。CD36 DNA外显子测序结果显示该个体具有新突变CD36c.T200A(p.Ile67Asn),为突变杂合子,CD36 c DNA克隆测序结果显示该个体有两种CD36 m RNA转录本:c.200T>A(p.Ile67Asn)(GenBank:HM217021.1)转录本变异体和CD36野生型转录本。真核表达细胞株和Western blot实验结果表明CD36转录本变异体c.200T>A可导致CD36表达缺失。结论本研究发现了一个可导致CD36缺失的基因新突变CD36 c.T200A(p.Ile67Asn),初步阐明了该个体导致CD36缺失的分子生物学基础,为CD36缺失分子机制的研究提供了依据。 展开更多
关键词 CD36缺失 基因突变 分子机制 分子克隆 细胞转染
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常温和冰冻保存条件下单采血小板制品凝血功能的差异 被引量:1
7
作者 钟周琳 周燕 +5 位作者 卢芳 李丽兰 李恒聪 蒋丽红 吴国光 《广西医学》 CAS 2020年第16期2062-2065,共4页
目的探讨常温(22±2)℃振荡、-80℃冰冻保存下单采血小板制品凝血功能的差异。方法随机选取16份单采血小板,应用无菌接管技术将每份单采血小板样本分成8份。其中4份于(22±2)℃常温振荡保存,分别在采集当日、第3天、第5天、第8... 目的探讨常温(22±2)℃振荡、-80℃冰冻保存下单采血小板制品凝血功能的差异。方法随机选取16份单采血小板,应用无菌接管技术将每份单采血小板样本分成8份。其中4份于(22±2)℃常温振荡保存,分别在采集当日、第3天、第5天、第8天进行检测;另4份置于冻存管中-80℃保存,分别在采集后第3天、第5天、第8天及1年进行检测。采用血细胞计数仪检测血小板计数、平均血小板体积(MPV),采用血栓弹力图检测凝血时间、α角、最大振幅、凝血指数,采用流式细胞术检测血小板CD62P表达水平、膜联蛋白V(Annexin V)结合率。结果采集后各时点,随着保存时间增加,常温保存的血小板凝血时间延长而凝血指数降低,但冰冻保存的血小板凝血时间缩短而凝血指数增高;与常温保存的血小板比较,冰冻保存的血小板的各时点凝血时间更短,而采集后第5天、第8天的凝血指数更高(均P<0.05)。采集后各时点,两种保存条件下血小板的CD62P表达水平和Annexin V结合率均随着保存时间增高;与常温保存的血小板比较,冰冻保存的血小板各时点的Annexin V结合率更高,采集后第5天、第8天的CD62P表达水平更低(均P<0.05)。采集后各时点,两组的血小板计数、MPV、最大振幅、α角差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论冰冻保存的单采血小板具有更稳定的凝血功能,保存期长,可作为常温保存单采血小板制品的补充。 展开更多
关键词 血小板制品 常温保存 冰冻保存 凝血功能 血栓弹力图 CD62P 膜联蛋白V结合率
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苯丙酸诺龙促进胰岛NIT-1细胞Nampt表达和胰岛素分泌
8
作者 吴雅婷 +2 位作者 冯乔 沈旺 冯乐平 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2014年第1期68-71,共4页
目的探讨雄性激素苯丙酸诺龙在氧化应激条件下对胰岛细胞的作用,为2型糖尿病治疗提供理论依据。方法将培养的NIT-1细胞按不同葡萄糖浓度(5.6、11.1、16.7和27.6 mmol/L)分为4组,分别用10μg/mL苯丙酸诺龙处理48 h,之后用流式细胞仪检测... 目的探讨雄性激素苯丙酸诺龙在氧化应激条件下对胰岛细胞的作用,为2型糖尿病治疗提供理论依据。方法将培养的NIT-1细胞按不同葡萄糖浓度(5.6、11.1、16.7和27.6 mmol/L)分为4组,分别用10μg/mL苯丙酸诺龙处理48 h,之后用流式细胞仪检测细胞周期;用Western blot检测Nampt和FOXO1蛋白表达和用放射免疫法测定细胞胰岛素分泌。结果用苯丙酸诺龙处理48 h后,1)低糖条件下细胞G0/G1期阻滞明显改善(P<0.01);2)高糖条件下细胞G2/M期阻滞得到缓解(P<0.01);3)高糖氧化应激状态下,苯丙酸诺龙促进胰岛细胞Nampt表达(P<0.05)和抑制非磷酸化的FOXO1蛋白表达(P<0.01),细胞分泌胰岛素增加。结论苯丙酸诺龙能够在高浓度葡萄糖条件下改善胰岛细胞生存状况和促进胰岛素分泌,这些效应可能与促进细胞内Nampt表达和抑制FOXO1密切相关。 展开更多
关键词 胰岛NIT-1细胞 苯丙酸诺龙 NAMPT FOXO1 细胞周期
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位于CD36基因剪切位点的2个新突变及其导致CD36缺失的分子基础 被引量:3
9
作者 李丽兰 +5 位作者 蒋丽红 钟周琳 黎海燕 周燕 卢芳 吴国光 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期2056-2065,共10页
目的:对在广西人群中发现的2个位于CD36剪切位点的新基因突变,以及它们导致CD36缺失的分子基础和在人群中的发生率进行研究。方法:对在广西人群中发现的2例CD36缺失个体(HHC和WGM)使用DNA测序和cDNA克隆测序,检测他们的CD36外显子序列及... 目的:对在广西人群中发现的2个位于CD36剪切位点的新基因突变,以及它们导致CD36缺失的分子基础和在人群中的发生率进行研究。方法:对在广西人群中发现的2例CD36缺失个体(HHC和WGM)使用DNA测序和cDNA克隆测序,检测他们的CD36外显子序列及mRNA蛋白编码区序列,对所发现的CD36 mRNA异常转录本建立真核表达细胞株并用Western blot实验验证异常转录本对CD36表达的影响。对所发现的新突变基因建立DNA PCR-SSP基因分型方法,在广西地区的110名CD36缺失个体群和广西地区随机的296名人群间展开人群分布调查。结果:在HHC和WGM个体中,发现了CD36剪切位点新突变CD36 c.430-1G>C,且在WGM个体中还发现了CD36 c.1006+2T>G的剪切位点新突变。cDNA克隆测序显示,CD36 c.430-1G>C可导致c.429_430ins[430-17_430-2;C](p.Ala144fsTer1)和c.430_609del(p.Ala144_Pro203del,GenBank注册号:HM217023.1)2种CD36 mRNA异常转录本的产生,而CD36 c.1006+2T>G可导致c.819_1006del(p.Ser274GlufsTer16)(GenBank注册号:HM217025.1)CD36 mRNA异常转录本的产生。通过建立的真核表达细胞株及Western blot实验验证了以上3种异常转录本均可导致CD36表达缺失。对所发现的2个剪切位点突变基因展开的人群发生率的研究显示,在110名CD36缺失个体群和随机的296名人群中,CD36 c.430-1G>C突变发生率分别为10.91%(12/110)和1.35%(4/296),而CD36 c.1006+2T>G突变的发生率分别为2.73%(3/110)和0(0/296)。结论:本研究发现了2个位于CD36基因剪切位点的新突变,初步阐明了它们导致CD36缺失的分子基础及在广西人群中的分布特征,为中国人群CD36缺失的分子机制及特征研究提供了实验和理论依据。 展开更多
关键词 CD36缺失 剪切位点突变 分子机制及特征 人群分布
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