采用网络药理学的方法探究虎杖(Polygonum cuspidatum)治疗糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy, DCM)的关键靶点和潜在作用机制.通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology databas...采用网络药理学的方法探究虎杖(Polygonum cuspidatum)治疗糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy, DCM)的关键靶点和潜在作用机制.通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)和查阅文献,获得虎杖的主要活性成分并预测其潜在的作用靶点.利用GeneCards和在线人类孟德尔遗传(online Mendelian inheritance in man, OMIM)数据库获得DCM的作用靶点,并绘制Venn图获得二者的交集靶点.使用String数据库和CytoScape软件构建虎杖-有效成分-交集靶点网络和蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络.通过注释、可视化和集成发现数据库(the database for annotation, visualization and integrated discovery, DAVID)在线分析工具进行基因本体论(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析,共筛选出15个虎杖有效活性成分以及214个治疗DCM的潜在作用靶点,主要涉及脂质和动脉粥样硬化通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路、胰岛素抵抗通路、PI3K-Akt信号通路及凋亡通路等.这说明虎杖通过多成分、多靶点、多通路来发挥治疗DCM的作用.展开更多
文摘采用网络药理学的方法探究虎杖(Polygonum cuspidatum)治疗糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy, DCM)的关键靶点和潜在作用机制.通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)和查阅文献,获得虎杖的主要活性成分并预测其潜在的作用靶点.利用GeneCards和在线人类孟德尔遗传(online Mendelian inheritance in man, OMIM)数据库获得DCM的作用靶点,并绘制Venn图获得二者的交集靶点.使用String数据库和CytoScape软件构建虎杖-有效成分-交集靶点网络和蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络.通过注释、可视化和集成发现数据库(the database for annotation, visualization and integrated discovery, DAVID)在线分析工具进行基因本体论(gene ontology, GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析,共筛选出15个虎杖有效活性成分以及214个治疗DCM的潜在作用靶点,主要涉及脂质和动脉粥样硬化通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路、胰岛素抵抗通路、PI3K-Akt信号通路及凋亡通路等.这说明虎杖通过多成分、多靶点、多通路来发挥治疗DCM的作用.
