了解南京地区手足口病中柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)的流行情况以及VP1区基因特征及3D区的重组形式。收集2016—2018年南京地区手足口病监测样本,使用Real Time RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测,分析流行情况。对CV-A6阳...了解南京地区手足口病中柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)的流行情况以及VP1区基因特征及3D区的重组形式。收集2016—2018年南京地区手足口病监测样本,使用Real Time RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测,分析流行情况。对CV-A6阳性样本针对VP1全长及3D区部分进行基因测序分析,使用Mega 5.2软件进行进化树分析,并使用Bioedit软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果显示,2016—2018年南京地区手足口病高发季为5—7月,呈单峰流行。CV-A6阳性690例(41.62%),全部处于D3亚型分支,核苷酸同源性为90.8%~100.00%。CV-A6存在3种重组形式,分别为RF-A、J、L。氨基酸分析显示,在VP1区有13个位点替换,3D区有24个位点替换。CV-A6已取代EV-A71,是南京地区手足口病的优势病原,属于D3亚型;存在3种不同形式的重组。持续开展CV-A6监测,对于南京地区手足口病防控有重要意义。展开更多
文摘了解南京地区手足口病中柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)的流行情况以及VP1区基因特征及3D区的重组形式。收集2016—2018年南京地区手足口病监测样本,使用Real Time RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测,分析流行情况。对CV-A6阳性样本针对VP1全长及3D区部分进行基因测序分析,使用Mega 5.2软件进行进化树分析,并使用Bioedit软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果显示,2016—2018年南京地区手足口病高发季为5—7月,呈单峰流行。CV-A6阳性690例(41.62%),全部处于D3亚型分支,核苷酸同源性为90.8%~100.00%。CV-A6存在3种重组形式,分别为RF-A、J、L。氨基酸分析显示,在VP1区有13个位点替换,3D区有24个位点替换。CV-A6已取代EV-A71,是南京地区手足口病的优势病原,属于D3亚型;存在3种不同形式的重组。持续开展CV-A6监测,对于南京地区手足口病防控有重要意义。
