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2022年深圳市新型冠状病毒Omicron BA.2亚系变异株的分子特征分析
被引量:
1
1
作者
周莎
陈龙
+19 位作者
屈雅丽
吕秋莹
张仁利
姚相杰
孟君
张晓敏
吴春利
孙颖
刘慧
魏欣仪
陈建成
李诗敏
朱灿
卢清菊
钟
庭
珊
陈慧
胡雪婷
陈妙媚
黄小丽
何雅青
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期923-931,共9页
新型冠状病毒(SARS⁃CoV⁃2)BA.2亚谱系BA.2.12.1表现出令人担忧的传播能力。为了了解深圳本地与输入的BA.2亚谱系分布与遗传特征,本研究对2022年1⁃6月深圳市BA.2亚系变异株进行了全基因组序列分析。通过高通量测序,本研究获得了155例本土...
新型冠状病毒(SARS⁃CoV⁃2)BA.2亚谱系BA.2.12.1表现出令人担忧的传播能力。为了了解深圳本地与输入的BA.2亚谱系分布与遗传特征,本研究对2022年1⁃6月深圳市BA.2亚系变异株进行了全基因组序列分析。通过高通量测序,本研究获得了155例本土、30例输入共185株覆盖度98%以上的BA.2亚型毒株的基因组序列。185株BA.2亚型毒株可分为BA.2.2、BA.2.3、BA.2.9、BA.2.10、BA.2.10.1、BA.2.12.1和BA.2.29七种亚型,其中BA.2.2占比最高(92.97%,172/185),其他亚型占比从高到低依次为BA.2.10.1(2.70%,5/185)、BA.2.10(1.62%,3/185)、BA.2.9(1.08%,2/185)、BA.2.3(0.54%,1/185)、BA.2.12.1(0.54%,1/185)及BA.2.29(0.54%,1/185)。172株BA.2.2亚型变异株中,本土及中国香港输入各153株(88.95%)和19株(11.05%)。序列比较分析发现,153株深圳本土BA.2.2毒株与19株中国香港输入BA.2.2毒株共享69个核苷酸变异位点和52个氨基酸变异位点(不包括缺失突变)。根据单核苷酸变异位点特征,153株深圳本土BA.2.2毒株至少可以分为6条传播链。与特征性突变相比,1株美国输入的受关注BA.2.12.1变异株在N区多了一个P383L氨基酸变异位点。深圳本地与输入的BA.2亚系变异株呈现出了高基因组多样性特征,开展SARS⁃CoV⁃2关切变异株与亚谱系毒株的分子监测,对新型冠状病毒感染(COVID⁃19)疫情的溯源与防控具有重要意义。
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关键词
新型冠状病毒
BA.2亚系
深圳
基因组序列
溯源
原文传递
精液白细胞与正常形态精子百分率的相关性分析
被引量:
3
2
作者
成艳君
李雪梅
+3 位作者
周永红
杨宇霞
钟
庭
珊
赖李友
《广州医药》
2017年第1期70-72,共3页
目的探讨精液白细胞和形态正常精子百分率的相关性。方法随机选取2014年4月—2015年8月来生殖中心进行就诊的男性800例,分析患者精液中的白细胞数量以及分析患者的精子形态,比较二者的相关性。结果正常形态精子百分率低于正常参考值的...
目的探讨精液白细胞和形态正常精子百分率的相关性。方法随机选取2014年4月—2015年8月来生殖中心进行就诊的男性800例,分析患者精液中的白细胞数量以及分析患者的精子形态,比较二者的相关性。结果正常形态精子百分率低于正常参考值的患者中有61.9%的白细胞数大于1×106,精子形态正常的患者有38.9%患者的白细胞数大于1×106,患者比例差异有统计学意义(P<0.05)。精子形态正常的患者(320例)和正常形态精子百分率低于正常参考值的患者(480例)相比,精子形态正常的比例远远大于正常形态精子百分率低于正常参考值的患者(P<0.05)。而正常形态精子百分率低于正常参考值的患者的头部异常、颈部和中间部分异常、尾部异常精子比例高于正常组(P<0.05)。正常形态精子百分率低于正常参考值的和正常形态的精子比例呈正相关;和大头精子百分率、锥形以及小头形态精子百分率呈负相关;和梨形以及其他形态的精子呈正相关。结论精液中的白细胞可以影响精子的参数,使得患者精液中的颈部或中部异常形态、头部和尾部异常形态的精子比例提升,具体机制有待进一步研究。
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关键词
男性不育
精液白细胞
精子形态
百分率
下载PDF
职称材料
题名
2022年深圳市新型冠状病毒Omicron BA.2亚系变异株的分子特征分析
被引量:
1
1
作者
周莎
陈龙
屈雅丽
吕秋莹
张仁利
姚相杰
孟君
张晓敏
吴春利
孙颖
刘慧
魏欣仪
陈建成
李诗敏
朱灿
卢清菊
钟
庭
珊
陈慧
胡雪婷
陈妙媚
黄小丽
何雅青
机构
南华大学公共卫生学院
深圳市疾病预防控制中心病原微生物检测所
南方医科大学公共卫生学院流行病学系
深圳市疾病预防控制中心传染病预防控制所
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期923-931,共9页
基金
深圳市科技创新委员会技术攻关重点项目(项目号:JSGG20200225152648408),题目:基于SARS⁃CoV⁃2冠状病毒表面Spike蛋白的早期快检技术研发
深圳市科技创新委员会技术攻关重点项目(项目号:JSGG20210901145004012),题目:新冠病毒变异株快速检测试剂盒关键技术研发
深圳市科技创新委员会技术攻关重点项目(项目号:JSGG20220606141401003),题目:抗疫专2022055新冠病毒S蛋白抗原自测试纸条及材料关键技术研发。
文摘
新型冠状病毒(SARS⁃CoV⁃2)BA.2亚谱系BA.2.12.1表现出令人担忧的传播能力。为了了解深圳本地与输入的BA.2亚谱系分布与遗传特征,本研究对2022年1⁃6月深圳市BA.2亚系变异株进行了全基因组序列分析。通过高通量测序,本研究获得了155例本土、30例输入共185株覆盖度98%以上的BA.2亚型毒株的基因组序列。185株BA.2亚型毒株可分为BA.2.2、BA.2.3、BA.2.9、BA.2.10、BA.2.10.1、BA.2.12.1和BA.2.29七种亚型,其中BA.2.2占比最高(92.97%,172/185),其他亚型占比从高到低依次为BA.2.10.1(2.70%,5/185)、BA.2.10(1.62%,3/185)、BA.2.9(1.08%,2/185)、BA.2.3(0.54%,1/185)、BA.2.12.1(0.54%,1/185)及BA.2.29(0.54%,1/185)。172株BA.2.2亚型变异株中,本土及中国香港输入各153株(88.95%)和19株(11.05%)。序列比较分析发现,153株深圳本土BA.2.2毒株与19株中国香港输入BA.2.2毒株共享69个核苷酸变异位点和52个氨基酸变异位点(不包括缺失突变)。根据单核苷酸变异位点特征,153株深圳本土BA.2.2毒株至少可以分为6条传播链。与特征性突变相比,1株美国输入的受关注BA.2.12.1变异株在N区多了一个P383L氨基酸变异位点。深圳本地与输入的BA.2亚系变异株呈现出了高基因组多样性特征,开展SARS⁃CoV⁃2关切变异株与亚谱系毒株的分子监测,对新型冠状病毒感染(COVID⁃19)疫情的溯源与防控具有重要意义。
关键词
新型冠状病毒
BA.2亚系
深圳
基因组序列
溯源
Keywords
SARS⁃CoV⁃2
BA.2 sub⁃lineage
Shenzhen area
Genome sequence
Trace to the source
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
精液白细胞与正常形态精子百分率的相关性分析
被引量:
3
2
作者
成艳君
李雪梅
周永红
杨宇霞
钟
庭
珊
赖李友
机构
深圳市妇幼保健院生殖医学中心
出处
《广州医药》
2017年第1期70-72,共3页
文摘
目的探讨精液白细胞和形态正常精子百分率的相关性。方法随机选取2014年4月—2015年8月来生殖中心进行就诊的男性800例,分析患者精液中的白细胞数量以及分析患者的精子形态,比较二者的相关性。结果正常形态精子百分率低于正常参考值的患者中有61.9%的白细胞数大于1×106,精子形态正常的患者有38.9%患者的白细胞数大于1×106,患者比例差异有统计学意义(P<0.05)。精子形态正常的患者(320例)和正常形态精子百分率低于正常参考值的患者(480例)相比,精子形态正常的比例远远大于正常形态精子百分率低于正常参考值的患者(P<0.05)。而正常形态精子百分率低于正常参考值的患者的头部异常、颈部和中间部分异常、尾部异常精子比例高于正常组(P<0.05)。正常形态精子百分率低于正常参考值的和正常形态的精子比例呈正相关;和大头精子百分率、锥形以及小头形态精子百分率呈负相关;和梨形以及其他形态的精子呈正相关。结论精液中的白细胞可以影响精子的参数,使得患者精液中的颈部或中部异常形态、头部和尾部异常形态的精子比例提升,具体机制有待进一步研究。
关键词
男性不育
精液白细胞
精子形态
百分率
分类号
R698.2 [医药卫生—泌尿科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2022年深圳市新型冠状病毒Omicron BA.2亚系变异株的分子特征分析
周莎
陈龙
屈雅丽
吕秋莹
张仁利
姚相杰
孟君
张晓敏
吴春利
孙颖
刘慧
魏欣仪
陈建成
李诗敏
朱灿
卢清菊
钟
庭
珊
陈慧
胡雪婷
陈妙媚
黄小丽
何雅青
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
原文传递
2
精液白细胞与正常形态精子百分率的相关性分析
成艳君
李雪梅
周永红
杨宇霞
钟
庭
珊
赖李友
《广州医药》
2017
3
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职称材料
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