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当多肽分子遇见二维材料——分子间氢键作用解析
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作者 何佳妮 郑舒琳 +1 位作者 蔡开聪 《化学教育(中英文)》 CAS 北大核心 2024年第2期121-126,共6页
在“计算机与应用化学”的课堂教学中借助Gaussian软件阐明3种不同端基的丙氨酸二肽和氮化石墨烯分子间存在的氢键作用。通过对原子间距、电荷分布与静电势的分析,引导学生认识氢键形成的机制,加深其对氢键本质的理解,致力于培养跨学科... 在“计算机与应用化学”的课堂教学中借助Gaussian软件阐明3种不同端基的丙氨酸二肽和氮化石墨烯分子间存在的氢键作用。通过对原子间距、电荷分布与静电势的分析,引导学生认识氢键形成的机制,加深其对氢键本质的理解,致力于培养跨学科综合型创新人才。 展开更多
关键词 Gaussian软件 氢键 电荷分布 静电势
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隐式溶剂环境中丙氨酸二肽酰胺-Ⅰ带光谱的神经网络预测
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作者 郑舒琳 +2 位作者 范建平 颜桂炀 蔡开聪 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第S01期51-52,共2页
借助神经网络学习方法开展多肽振动光谱预测与解析,构建不同极性溶剂环境下丙氨酸二肽(ALAD)的酰胺-Ⅰ带振动频率预测的神经网络模型,探究ALAD各个构象异构体的骨架二面角、C=O键长及酰胺-Ⅰ带振动频率处于不同化学环境中的相关性。
关键词 红外光谱 酰胺-Ⅰ带 丙氨酸二肽 神经网络学习
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VMD在分子间相互作用教学中的应用——以丙氨酸二肽与水形成的氢键为例 被引量:1
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作者 郑舒琳 +1 位作者 代亚楠 蔡开聪 《化学教育(中英文)》 CAS 北大核心 2022年第24期95-100,共6页
在“计算机在化学中的应用”课程教学中,借助VMD软件揭示溶液中丙氨酸二肽(ALAD)与水分子间存在的氢键作用及其对多肽分子结构的影响。课堂教学过程中将有机化学中抽象的氢键以三维立体动画的形式在课堂上展示,并在上机实践教学中引导... 在“计算机在化学中的应用”课程教学中,借助VMD软件揭示溶液中丙氨酸二肽(ALAD)与水分子间存在的氢键作用及其对多肽分子结构的影响。课堂教学过程中将有机化学中抽象的氢键以三维立体动画的形式在课堂上展示,并在上机实践教学中引导学生从定性和定量的角度对多肽与水分子间的氢键相互作用机制进行解析,能够丰富教师课堂教学手段,深化学生宏微观探析、证据推理与模型认知的化学学科核心能力。 展开更多
关键词 VMD软件 氢键 径向分布函数 空间分布函数
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