热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)对于植物应对生物和非生物逆境胁迫具有重要意义.本研究以甜橙基因组为基础,利用生物信息学方法对其基因组中Hsp70基因家族进行了鉴定和分析.结果表明,甜橙Hsp70基因家族至少包含28个成员,蛋白...热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)对于植物应对生物和非生物逆境胁迫具有重要意义.本研究以甜橙基因组为基础,利用生物信息学方法对其基因组中Hsp70基因家族进行了鉴定和分析.结果表明,甜橙Hsp70基因家族至少包含28个成员,蛋白质序列长度在436~1526氨基酸之间,分子量介于48.15~169.78 kDa之间.系统进化分析显示,甜橙Hsp70家族基因分为两个亚族,DnaK和Hsp110/SSE,其中DnaK亚家族成员树在甜橙中占据主要位置,为24个,Hsp110/SSE亚家族成员较少,仅有4个.不同组织基因表达水平分析显示,Hsp70家族基因在愈伤组织、花、叶、果实4种组织中均有表达,但表达水平有差异,在果实中的表达水平普遍高于其他组织.本研究结果为进一步研究甜橙Hsp70家族成员的功能奠定了基础.展开更多
文摘热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)对于植物应对生物和非生物逆境胁迫具有重要意义.本研究以甜橙基因组为基础,利用生物信息学方法对其基因组中Hsp70基因家族进行了鉴定和分析.结果表明,甜橙Hsp70基因家族至少包含28个成员,蛋白质序列长度在436~1526氨基酸之间,分子量介于48.15~169.78 kDa之间.系统进化分析显示,甜橙Hsp70家族基因分为两个亚族,DnaK和Hsp110/SSE,其中DnaK亚家族成员树在甜橙中占据主要位置,为24个,Hsp110/SSE亚家族成员较少,仅有4个.不同组织基因表达水平分析显示,Hsp70家族基因在愈伤组织、花、叶、果实4种组织中均有表达,但表达水平有差异,在果实中的表达水平普遍高于其他组织.本研究结果为进一步研究甜橙Hsp70家族成员的功能奠定了基础.
