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转录组数据分析揭示非洲猪瘟病毒感染后的宿主免疫应答机制及关键效应因子
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作者 陈涛 苟士学 +4 位作者 郑伟 金银戈 蒋美玲 罗贤 周小青 《生物化工》 CAS 2023年第4期15-18,30,共5页
目的:利用生物信息学和公共转录组数据揭示非洲猪瘟病毒(African Swine Fever Virus,ASFV)感染后宿主的免疫应答机制,并筛选出潜在的关键效应因子。方法:使用数据集GSE132905进行差异分析,对差异基因进行聚类和功能富集分析,并对聚类基... 目的:利用生物信息学和公共转录组数据揭示非洲猪瘟病毒(African Swine Fever Virus,ASFV)感染后宿主的免疫应答机制,并筛选出潜在的关键效应因子。方法:使用数据集GSE132905进行差异分析,对差异基因进行聚类和功能富集分析,并对聚类基因进行蛋白互作网络分析。结果:共鉴定出918个差异基因;富集分析结果表明这些基因与干扰素的生成、先天免疫反应、抗病毒机制等通路相关;蛋白互作网络分析鉴定出9个关键基因,这些基因在对抗病毒感染的过程中扮演着重要的角色。结论:通过生物信息学分析和蛋白互作数据库筛选,可鉴定出有助于揭示ASFV潜在致病机制的关键基因,为ASFV的疫苗和药物开发提供新的候选靶点。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 生物信息分析 差异基因 蛋白互作网络 基因表达综合数据库
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