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铜绿假单胞菌Ⅲ型分泌系统的分子调控机制
被引量：
11
1
作者
罗勤
金守
光
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1413-1417,共5页
铜绿假单胞菌是临床上重要的革兰氏阴性条件致病菌。通过Ⅲ型分泌系统,铜绿假单胞菌将其毒力因子注入到真核宿主细胞内部,逃避宿主巨噬细胞的吞噬降解,引起宿主相应的病理变化,是铜绿假单胞菌感染致病的重要原因。本文在简单介绍铜绿假...
铜绿假单胞菌是临床上重要的革兰氏阴性条件致病菌。通过Ⅲ型分泌系统,铜绿假单胞菌将其毒力因子注入到真核宿主细胞内部,逃避宿主巨噬细胞的吞噬降解,引起宿主相应的病理变化,是铜绿假单胞菌感染致病的重要原因。本文在简单介绍铜绿假单胞菌Ⅲ型分泌系统组成和功能的基础上,主要对调控T3SS基因转录表达的分子机制的研究进展进行综述和讨论。
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关键词
铜绿假单胞菌
Ⅲ型分泌系统
转录调控
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职称材料
定向RNA-Seq技术在铜绿假单胞菌的应用
2
作者
张樱
陈昊
+1 位作者
罗燕萍
金守
光
《解放军医学院学报》
CAS
2013年第6期647-649,共3页
目的探讨定向转录组测序技术在铜绿假单胞菌的应用,为研究基因组的注释和表达调控提供重要手段。方法抽提菌体RNA并去除rRNA,连接接头后用特异性引物反转录成cDNA,PCR扩增后测序;所得数据采用Bowtie和rSeq软件分析。结果在所有26 557 65...
目的探讨定向转录组测序技术在铜绿假单胞菌的应用,为研究基因组的注释和表达调控提供重要手段。方法抽提菌体RNA并去除rRNA,连接接头后用特异性引物反转录成cDNA,PCR扩增后测序;所得数据采用Bowtie和rSeq软件分析。结果在所有26 557 654条读段中,除去无效读段209 928条,与基因组匹配的读段为26 347 726条,测序结果能覆盖几乎99%的基因组,78.7%的基因来源于两个方向转录本映射读段,读段数最高的基因是ssrA,发现新的基因2 283个。结论成功建立了铜绿假单胞菌中的定向RNA-Seq技术。
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关键词
铜绿假单胞菌
定向高通量测序
转录组
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职称材料
铜绿假单胞菌毒力相关小RNA的筛选与鉴定
3
作者
陈谷奎
陈荣伟
+3 位作者
程志晖
金守
光
吴卫辉
靳永新
《南开大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期52-59,共8页
小RNA在细菌的基因调控过程中具有重要的作用,然而目前在铜绿假单胞菌中仅发现了几种有功能的小RNA.铜绿假单胞菌中存在着许多短片段RNA(100-250 bp),然而这些短片段RNA的功能尚不清楚.为了筛选与铜绿假单胞菌毒力相关的小RNA,结合生物...
小RNA在细菌的基因调控过程中具有重要的作用,然而目前在铜绿假单胞菌中仅发现了几种有功能的小RNA.铜绿假单胞菌中存在着许多短片段RNA(100-250 bp),然而这些短片段RNA的功能尚不清楚.为了筛选与铜绿假单胞菌毒力相关的小RNA,结合生物信息学手段和实验检测技术对这些短片段RNA进行了靶点基因预测及相关表型研究.结果显示:利用小RNA靶点预测软件,筛选到23个毒力相关小RNA;通过构建小RNA过表达质粒,对这些小RNA进行了高表达及相关的表型检测,发现Pant116对铜绿假单胞菌的3型分泌系统具有负调控作用.
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关键词
铜绿假单胞菌
小RNA
靶点预测软件
3型分泌系统
原文传递
铜绿假单胞菌mexS基因对其运动能力的影响
被引量：
2
4
作者
郭建慧
何沿沿
+3 位作者
陈荣浩
吴卫辉
金守
光
靳永新
《南开大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期44-50,共7页
使用同源重组方法构建mex S基因突变菌株PAO1mex S::Ω,检测其与铜绿假单胞菌野生型菌株PAO1泳动,蹭行运动及蜂群运动能力.结果表明:与野生型菌株相比,PAO1mex S::Ω这3种运动能力均显著增加;构建mex S互补菌株PAO1mex S::ΩC,通过检测...
使用同源重组方法构建mex S基因突变菌株PAO1mex S::Ω,检测其与铜绿假单胞菌野生型菌株PAO1泳动,蹭行运动及蜂群运动能力.结果表明:与野生型菌株相比,PAO1mex S::Ω这3种运动能力均显著增加;构建mex S互补菌株PAO1mex S::ΩC,通过检测互补株的泳动、蹭行运动及蜂群运动能力,发现mex S基因回复了突变株这3种运动能力.为了探索mex S基因调控这3种运动能力的分子机制,进一步提取了PAO1与PAO1mex S::Ω菌株RNA,使用RNA测序技术比较两者全基因组转录水平,结果发现与野生型菌株相比,PAO1mex S::Ω中部分运动能力相关基因的表达水平发生了明显地变化.本文首次报道mex S基因影响铜绿假单胞菌的运动能力.
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关键词
铜绿假单胞菌
mexS基因
泳动
蹭行运动
蜂群运动
原文传递
题名
铜绿假单胞菌Ⅲ型分泌系统的分子调控机制
被引量：
11
1
作者
罗勤
金守
光
机构
遗传调控与整合生物学湖北省重点实验室
Department of Molecular Genetics and Microbiology
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1413-1417,共5页
基金
国家自然科学基金(30500025)
教育部留学回国人员科研启动基金
教育部211重点学科项目~~
文摘
铜绿假单胞菌是临床上重要的革兰氏阴性条件致病菌。通过Ⅲ型分泌系统,铜绿假单胞菌将其毒力因子注入到真核宿主细胞内部,逃避宿主巨噬细胞的吞噬降解,引起宿主相应的病理变化,是铜绿假单胞菌感染致病的重要原因。本文在简单介绍铜绿假单胞菌Ⅲ型分泌系统组成和功能的基础上,主要对调控T3SS基因转录表达的分子机制的研究进展进行综述和讨论。
关键词
铜绿假单胞菌
Ⅲ型分泌系统
转录调控
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
type Ⅲ secretion system （T3SS）
transcriptional regulation
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
定向RNA-Seq技术在铜绿假单胞菌的应用
2
作者
张樱
陈昊
罗燕萍
金守
光
机构
解放军总医院微生物科
美国佛罗里达大学医学院分子遗传学和微生物系
美国佛罗里达大学医学院心脏科
出处
《解放军医学院学报》
CAS
2013年第6期647-649,共3页
文摘
目的探讨定向转录组测序技术在铜绿假单胞菌的应用,为研究基因组的注释和表达调控提供重要手段。方法抽提菌体RNA并去除rRNA,连接接头后用特异性引物反转录成cDNA,PCR扩增后测序;所得数据采用Bowtie和rSeq软件分析。结果在所有26 557 654条读段中,除去无效读段209 928条,与基因组匹配的读段为26 347 726条,测序结果能覆盖几乎99%的基因组,78.7%的基因来源于两个方向转录本映射读段,读段数最高的基因是ssrA,发现新的基因2 283个。结论成功建立了铜绿假单胞菌中的定向RNA-Seq技术。
关键词
铜绿假单胞菌
定向高通量测序
转录组
Keywords
pseudomonas aeruginosa
strand-specific deep sequencing
transcriptome
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
铜绿假单胞菌毒力相关小RNA的筛选与鉴定
3
作者
陈谷奎
陈荣伟
程志晖
金守
光
吴卫辉
靳永新
机构
南开大学生命科学学院
出处
《南开大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期52-59,共8页
基金
天津市应用基础与前沿技术研究计划(13JCQNJC09500)
南开大学基本科研业务费青年及海外项目
文摘
小RNA在细菌的基因调控过程中具有重要的作用,然而目前在铜绿假单胞菌中仅发现了几种有功能的小RNA.铜绿假单胞菌中存在着许多短片段RNA(100-250 bp),然而这些短片段RNA的功能尚不清楚.为了筛选与铜绿假单胞菌毒力相关的小RNA,结合生物信息学手段和实验检测技术对这些短片段RNA进行了靶点基因预测及相关表型研究.结果显示:利用小RNA靶点预测软件,筛选到23个毒力相关小RNA;通过构建小RNA过表达质粒,对这些小RNA进行了高表达及相关的表型检测,发现Pant116对铜绿假单胞菌的3型分泌系统具有负调控作用.
关键词
铜绿假单胞菌
小RNA
靶点预测软件
3型分泌系统
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
sRNA
target prediction software
type 3 secretion system
分类号
Q936 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
铜绿假单胞菌mexS基因对其运动能力的影响
被引量：
2
4
作者
郭建慧
何沿沿
陈荣浩
吴卫辉
金守
光
靳永新
机构
南开大学生命科学学院
佛罗里达大学分子遗传学与微生物学系
出处
《南开大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期44-50,共7页
基金
天津市应用基础与前沿技术研究计划(13JCQNJC09500)
南开大学基本科研业务费青年及海外项目
文摘
使用同源重组方法构建mex S基因突变菌株PAO1mex S::Ω,检测其与铜绿假单胞菌野生型菌株PAO1泳动,蹭行运动及蜂群运动能力.结果表明:与野生型菌株相比,PAO1mex S::Ω这3种运动能力均显著增加;构建mex S互补菌株PAO1mex S::ΩC,通过检测互补株的泳动、蹭行运动及蜂群运动能力,发现mex S基因回复了突变株这3种运动能力.为了探索mex S基因调控这3种运动能力的分子机制,进一步提取了PAO1与PAO1mex S::Ω菌株RNA,使用RNA测序技术比较两者全基因组转录水平,结果发现与野生型菌株相比,PAO1mex S::Ω中部分运动能力相关基因的表达水平发生了明显地变化.本文首次报道mex S基因影响铜绿假单胞菌的运动能力.
关键词
铜绿假单胞菌
mexS基因
泳动
蹭行运动
蜂群运动
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
mexS gene
swimming
twitching
swarming
分类号
Q935 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
铜绿假单胞菌Ⅲ型分泌系统的分子调控机制
罗勤
金守
光
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
11
下载PDF
职称材料
2
定向RNA-Seq技术在铜绿假单胞菌的应用
张樱
陈昊
罗燕萍
金守
光
《解放军医学院学报》
CAS
2013
0
下载PDF
职称材料
3
铜绿假单胞菌毒力相关小RNA的筛选与鉴定
陈谷奎
陈荣伟
程志晖
金守
光
吴卫辉
靳永新
《南开大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
原文传递
4
铜绿假单胞菌mexS基因对其运动能力的影响
郭建慧
何沿沿
陈荣浩
吴卫辉
金守
光
靳永新
《南开大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015
2
原文传递
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