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吴屯杨PwHB7基因的克隆及生物信息学分析
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作者 张珂 孙婧靓 +3 位作者 李国娇 金博众 胡语芮 邢小宇 《天津农业科学》 CAS 2024年第6期1-6,共6页
为探究吴屯杨PwHB7基因的生物学特征及功能,以吴屯杨为材料,利用RT-PCR技术克隆吴屯杨PwHB7基因的cDNA全长序列,并通过生物信息学方法分析PwHB7全长序列的特征。结果表明:吴屯杨PwHB7基因开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为717 ... 为探究吴屯杨PwHB7基因的生物学特征及功能,以吴屯杨为材料,利用RT-PCR技术克隆吴屯杨PwHB7基因的cDNA全长序列,并通过生物信息学方法分析PwHB7全长序列的特征。结果表明:吴屯杨PwHB7基因开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为717 bp,编码238个氨基酸。二级结构预测表明:PwHB7蛋白主要由α螺旋、无规则卷曲、延伸链、β转角组成。理化性质分析表明:该蛋白由C、H、O、N、S组成,理论等电点为4.93,脂肪指数为60.67。跨膜区分析表明:该蛋白为非跨膜蛋白。磷酸化位点分析表明:丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸可能成为磷酸化位点。系统发育树分析表明:PwHB7基因与毛果杨PtHB7基因的亲缘关系最近。该结果为解析PwHB7基因响应干旱胁迫的分子机制奠定了基础,为吴屯杨抗旱育种提供新思路。 展开更多
关键词 吴屯杨 PwHB7基因 克隆 序列分析
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