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SNP芯片联合质谱筛检胃癌相关基因3′UTR区SNPs的病例-对照研究 被引量：2
1
作者 韩仁杰 吴传城 +2 位作者 刘宝英 郭赛熊 陈昱 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2018年第5期359-364,共6页
目的:探讨胃癌发生相关基因3′非翻译区(3′UTR)单核苷酸多态性位点(SNPs),为寻找有价值的胃癌分子标志物提供新的依据。方法:采用1∶1配对病例-对照研究的方法。应用SNP芯片对福建省胃癌高发区仙游县96例胃腺癌患者与96例健康对照人群... 目的:探讨胃癌发生相关基因3′非翻译区(3′UTR)单核苷酸多态性位点(SNPs),为寻找有价值的胃癌分子标志物提供新的依据。方法:采用1∶1配对病例-对照研究的方法。应用SNP芯片对福建省胃癌高发区仙游县96例胃腺癌患者与96例健康对照人群基因组中消化道肿瘤相关基因3′UTR区SNPs位点进行检测,应用飞行时间质谱分析质谱技术对芯片筛检出来的SNPs位点在622例胃癌患者和622例正常健康基因组中进行验证。结果:SNP芯片及生物信息学分析选取EGFR rs884225、EGFR rs10277413、FAS rs1468063、MSH2 rs17502941和MSH2 rs11125144为候选基因位点。对622对病例-对照组样本的上述候选基因位点进行SNP分型,均未发现上述5个位点与胃癌易感性相关。进一步分层分析结果发现EGFR rs884225中含有T等位基因的基因型(CT+TT)与贲门癌相关(OR=0.67,95%CI:0.46～0.99),而其他位点与贲门癌、非贲门癌的风险关联无统计学意义(P>0.05)。结论:EGFR基因3′非翻译区的rs884225多态性位点与福建省仙游县的贲门癌发生存在关联,T等位基因可能是贲门癌发生的一个遗传保护因素。 展开更多
关键词 3’非翻译区 靶基因 单核苷酸多态性 胃癌
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