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介观层次上的计算机模拟和应用 被引量：20
1
作者 李有勇 郭森立 +1 位作者 王凯旋 徐筱杰 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 2000年第4期361-375,共15页
本文综述了近年发展起来的介观层次上的计算机模拟和应用。介绍了两种较为成熟的模拟方法 :介观动力学和耗散颗粒动力学。还介绍了介观模拟方法在胶束形成、胶体絮状物构造、乳化剂、流变学、共聚物和高分子混合形态以及通过多孔介质的... 本文综述了近年发展起来的介观层次上的计算机模拟和应用。介绍了两种较为成熟的模拟方法 :介观动力学和耗散颗粒动力学。还介绍了介观模拟方法在胶束形成、胶体絮状物构造、乳化剂、流变学、共聚物和高分子混合形态以及通过多孔介质的流动研究中的应用。 展开更多
关键词 介观动力学 耗散颗粒动力学 计算机模拟 高聚物
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对pluronic水溶液介观相分离的理论模拟研究 被引量：3
2
作者 李有勇 侯廷军 +2 位作者 王凯旋 郭森立 徐筱杰 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第4期402-406,共5页
用一种新的动力学密度泛函方法(介观动力学)对pluronic(P85)水溶液的介观相分离动力学进行了模拟研究.该方法可以直接给出水溶液体系中不规则三维微观形貌的动力学形成过程.在动力学模拟中,热力学参数通过平均场密度泛函方法计算得到,... 用一种新的动力学密度泛函方法(介观动力学)对pluronic(P85)水溶液的介观相分离动力学进行了模拟研究.该方法可以直接给出水溶液体系中不规则三维微观形貌的动力学形成过程.在动力学模拟中,热力学参数通过平均场密度泛函方法计算得到,共聚物分子则用高斯链作为模型进行模拟研究.高斯链的最小结构单元是被抽象为键连的珠子体,代表实际体系高聚物分子中的一个单体或几个单体.研究了pluronic水溶液体系的动力学演变历程并讨论了嵌段共聚物中不同组分长短以及共聚物浓度等因素对溶液微观形貌和体系性质的影响.和其它平衡态模拟方法相比较,介观动力学方法可以给出介观相分离的时间演变过程,有助于加深对很多工业加工处理过程和生理过程机理的理解. 展开更多
关键词 PLURONIC 介观动力学 软凝态聚合物 表面活性剂
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用介观动力学模拟Pluronic L64／水／p—Xylene体系的相分离 被引量：4
3
作者 郭森立 侯廷军 徐筱杰 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第12期2093-2098,共6页
用介观动力学在介观层次上对不同组分的Pluronic L64/水/p-xylene三元体系的相分离进行了研究,得到了和实验相吻合的结果.计算表明对于纯p-xylene溶剂和有含少量水的p-xylene溶剂,体系没有发生相分离,随着水的含量增加,体系发生了明显... 用介观动力学在介观层次上对不同组分的Pluronic L64/水/p-xylene三元体系的相分离进行了研究,得到了和实验相吻合的结果.计算表明对于纯p-xylene溶剂和有含少量水的p-xylene溶剂,体系没有发生相分离,随着水的含量增加,体系发生了明显的相分离,产生了不同形态的胶团.本研究还通过对比不同溶剂组分下的体系介观形貌,讨论了水在体系相分离中的作用.同时通过分析模拟了1 000步后体系中水的分布,证实在胶团核中存在自由水(free water)的猜想. 展开更多
关键词 PLURONIC L64 相分离 介观动力学 密度泛函 高斯链 相互作用参数 溶液属性 非离子型表面活性剂 水 P-XYLENE 三元体系
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基于分子间相互作用的分子设计系统-P U M D S 被引量：3
4
作者 徐筱杰 侯廷军 +3 位作者 王俊梅 廖宁 骆宏鹏 郭森立 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第5期335-336,共2页
北京大学分子设计系统 （ Ｐ Ｕ Ｍ Ｄ Ｓ） 主要用于研究和分析分子间相互作用。通过这个系统， 可以确定超分子体系中各个组成单元之间的相互作用， 超分子体系的结构以及形成过程。同时它也可以用于药物研究特别是先导化合物的设... 北京大学分子设计系统 （ Ｐ Ｕ Ｍ Ｄ Ｓ） 主要用于研究和分析分子间相互作用。通过这个系统， 可以确定超分子体系中各个组成单元之间的相互作用， 超分子体系的结构以及形成过程。同时它也可以用于药物研究特别是先导化合物的设计。利用这个系统我们进行了多个超分子体系的研究， 均取得了很好的结果。 展开更多
关键词 PUMDS 分子间相互作用 分子识别 分子设计
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一个新BEDT-TTF电荷转移盐的晶体结构预测 被引量：1
5
作者 郭森立 侯廷军 +2 位作者 徐筱杰 张斌 朱道本 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第4期289-291,共3页
用分子力学方法预测了一个新的电荷转移盐(ET)2FeCl4的晶体结构.用密度泛函理论(DFT)对(ET)2FeCl4系列电荷转移盐的单晶电子能量进行了计算.通过对比相近晶体的晶体结构和电子能量,解释了计算所得晶体结构的合理性.
关键词 BEDT-TTF电荷转移盐 晶体结构 分子力学 密度泛函理论 电子能量
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Pluronic L64/水/p-Xylene体系的模拟 被引量：1
6
作者 郭森立 侯廷军 徐筱杰 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期298-300,共3页
用介观动力学在介观层次上对不同组分的pluronic L64/水/p-Xylene三元体系的相分离进行了研究,得到了与实验相吻合的结果。计算表明对于纯p-Xylene溶剂和有合少量水的p-Xylene溶剂,体系没有发生相分离,随着水的含量增加,体系发生了明显... 用介观动力学在介观层次上对不同组分的pluronic L64/水/p-Xylene三元体系的相分离进行了研究,得到了与实验相吻合的结果。计算表明对于纯p-Xylene溶剂和有合少量水的p-Xylene溶剂,体系没有发生相分离,随着水的含量增加,体系发生了明显的相分离,产生了不同形态的胶团。本文还通过对比不同溶剂组分下的体系介观形貌,讨论了水在体系相分离中的作用。同时通过分析模拟了1000步后体系中水的分布,证实在胶团核中存在自由水(free water)的猜想。 展开更多
关键词 PLURONIC 相分离 介观动力学 密度泛函 高斯链 相互作用参数 计算机模拟 非离子表面活性剂
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一组胰蛋白酶抑制剂结合自由能的预测
7
作者 侯廷军 章威 +1 位作者 郭森立 徐筱杰 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期1-3,共3页
本文采用基于线性响应近似的自由能预测方法计算了胰蛋白酶和苯酰氨类抑制剂的结合自由能。计算结果表明,3参数和双参数模型的预测能力要明显优于单参数模型。计算得到的抑制剂和受体间的作用模式为基于结构的药物设计提供了重要的信息。
关键词 线性相应近似 胰蛋白酶 苯酰氨类抑制剂 分子动力学 结合自由能 预测 分子对接 药物设计
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