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白灵侧耳ACC基因克隆及表达分析
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作者 田雨 郝刘斌 +4 位作者 李海康 冯璠 王春霞 张瑞颖 郑素月 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期9-16,共8页
通过克隆白灵侧耳(Pleurotus tuoliensis)乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-CoA carboxylase,ACC)基因,采用生物信息学方法预测白灵侧耳ACC的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构和保守结构域;基于白灵侧耳ACC与灰盖鬼... 通过克隆白灵侧耳(Pleurotus tuoliensis)乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-CoA carboxylase,ACC)基因,采用生物信息学方法预测白灵侧耳ACC的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构和保守结构域;基于白灵侧耳ACC与灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)、糙皮侧耳(P.ostreatus)、香菇(Lentinula edodes)、刺芹侧耳(P.eryngii)等16个物种的氨基酸序列,采用邻接法构建系统发育树;通过荧光定量PCR测定pH为3、4、5、6、7、8、9、10、11、12时的白灵侧耳ACC的相对表达量。结果表明:白灵侧耳ACC DNA长度为7366 bp,包含12个内含子和13个外显子,cDNA长度为6696 bp,共编码2231个氨基酸残基,相对分子质量为247400,白灵侧耳ACC为酸性、不稳定的亲水蛋白质,不具有信号肽和跨膜结构域,可能存在于细胞质、细胞核或过氧化物酶体中,主要由α螺旋、无规卷曲、β折叠和β转角组成,含有ACC中心区、生物素羧化酶、生物素羧基载体蛋白质和羧基转移酶4个保守结构域;系统发育树表明,白灵侧耳ACC的氨基酸序列与担子菌中的刺芹侧耳相似度较高;与对照组(pH5.42)相比,pH为6、7、8、9、10、11时,ACC相对表达量显著增加(P<0.05)。 展开更多
关键词 白灵侧耳 乙酰辅酶A羧化酶 基因克隆 系统发育 表达
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姬松茸发酵培养料的理化性质及微生物群落研究
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作者 赵玉阳 冯璠 +3 位作者 郝刘斌 孙悦 郑素月 王春霞 《北方园艺》 CAS 北大核心 2024年第9期70-77,共8页
以牛粪和玉米芯为主料进行发酵,采用高通量测序法,设置未发酵(C1)、第1次发酵完成(C2)、第2次发酵完成(C3)3个阶段,研究了不同发酵阶段培养料的理化性质及微生物群落演替的变化规律,以期探究姬松茸培养料隧道式发酵特性,优化隧道发酵技... 以牛粪和玉米芯为主料进行发酵,采用高通量测序法,设置未发酵(C1)、第1次发酵完成(C2)、第2次发酵完成(C3)3个阶段,研究了不同发酵阶段培养料的理化性质及微生物群落演替的变化规律,以期探究姬松茸培养料隧道式发酵特性,优化隧道发酵技术。结果表明:姬松茸培养料发酵过程中含水率、pH、总碳和C/N不断下降,电导率和全氮含量呈先降低后升高的趋势。细菌群落中厚壁菌在整个时期均为优势菌门;放线菌与异常球菌在C2时期成为优势菌群;C3时期绿弯菌门的相对丰度显著上升。真菌群落中的子囊菌在整个培养料发酵过程中是最丰富的真菌门,相对丰度占比均在92.5%之上,其次为担子菌门。TN、pH、C/N、MC、TC和EC值均对发酵料中细菌群落结构有显著影响,其中TN对细菌群落的影响极为显著(P<0.01);TC、C/N、MC和TN是影响发酵料中真菌群落的关键因素,其中TC和C/N的影响程度最为显著(P<0.01)。 展开更多
关键词 姬松茸 隧道式发酵技术 理化性质 高通量测序 微生物群落演替
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19个秀珍菇菌株种质鉴定及遗传多样性分析
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作者 孙悦 郝刘斌 +2 位作者 冯璠 王春霞 郑素月 《食药用菌》 2024年第4期246-250,255,共6页
采用拮抗试验、酯酶同工酶测定和ISSR分子标记技术从形态学、蛋白质和分子角度对19个生产中常用的秀珍菇菌株进行鉴定分析和遗传多样性评价。最终3种方法测定结果高度一致,19个秀珍菇菌株可划分为四类:第一类有9个菌株,分别为1、7、8、9... 采用拮抗试验、酯酶同工酶测定和ISSR分子标记技术从形态学、蛋白质和分子角度对19个生产中常用的秀珍菇菌株进行鉴定分析和遗传多样性评价。最终3种方法测定结果高度一致,19个秀珍菇菌株可划分为四类:第一类有9个菌株,分别为1、7、8、9、10、11、15、16、17号;第二类有8个菌株,分别为2、3、4、5、6、13、14、19号;第三类有1个菌株,为12号;第四类有1个菌株,为18号。 展开更多
关键词 秀珍菇 拮抗试验 酯酶同工酶测定 ISSR分子标记技术
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