含氟农药的比较分子场分析研究 被引量：13

1

作者 谷妍 董喜城 +4 位作者 陈海峰 陈敏伯 张世相 袁身刚 郑崇直 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第12期1540-1545,共6页

用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4％和... 用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4％和39.6％,影响毒性的立体场与静电场的贡献分别为59.2％和40.8％.药效模型与毒效模型在交叉验证时的相关系数平方(R^2)分别为0.652和0.611,非交叉验证的R^2分别为0.982和0.977,方差比F(8,69)值分别为463.6及362.9,活性和毒性的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为3.6％和2.9％.,表明模型具有较好的自预测能力.对测试组34个化合物进行了活性和毒性的预测,活性与毒性预测的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为10.4％和6.4％.最后,还建立了一个由97个化合物构建的扩大的模型,各种统计量得到了进一步提高.并预计了一个活性较高且毒性很低的新化合物. 展开更多

关键词 3D-QSAR 比较分子场分析 含氟农药 生物活性

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含氟新农药的构效关系研究——Ⅰ.经典QSAR分析 被引量：7

2

作者 袁琼 柴鸽庆 +2 位作者 张世相 郑崇直 袁身刚 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第1期100-107,共8页

为了能更深入地认识含氟新化合物作为农药的生物活性和其结构间的关系,建立有意义的构效关系模型,我们用经典QSAR(定量构效关系)方法研究了三十三个含氟化合物的两种不同的生物活性与结构的关系,其对抗黄瓜疫病活性模型有很好的解释能... 为了能更深入地认识含氟新化合物作为农药的生物活性和其结构间的关系,建立有意义的构效关系模型,我们用经典QSAR(定量构效关系)方法研究了三十三个含氟化合物的两种不同的生物活性与结构的关系,其对抗黄瓜疫病活性模型有很好的解释能力和预测能力,并根据这个模型设计了一些新的活性结构.而对抑制西瓜白绢病的活性数据的处理未能获得理想模型.通过这一工作确立了先应用聚类等定性分析方法,再用多元统计分析方法作更深入研究的QSAR研究模式. 展开更多

关键词 农药 含氟化合物 构效关系

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抗小麦赤霉病类含氟农药的3D-QSAR研究 被引量：5

3

作者 陈海峰 董喜城 +5 位作者 谷妍 柴鸽庆 张世相 袁身刚 陈敏伯 郑崇直 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第9期1074-1078,共5页

用CoMFA方法对一组含氟农药分子的抗小麦赤霉病活性进行了定量构效关系研究.发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为90.3％和9.7％,立体场的影响是占主导性的.该模型非交叉验证的相关系数(r^2)为0.991,F值是297.524,标准偏差(S)为0.0... 用CoMFA方法对一组含氟农药分子的抗小麦赤霉病活性进行了定量构效关系研究.发现影响药效的立体场与静电场的贡献分别为90.3％和9.7％,立体场的影响是占主导性的.该模型非交叉验证的相关系数(r^2)为0.991,F值是297.524,标准偏差(S)为0.015,表明模型具有较好的预测能力.根据该模型,设计并预测了几个新的化合物,其活性都在0.96以上,经过研究表明在预测结构的某些位置添加位阻较大的基团,活性提高比较明显. 展开更多

关键词 三维定量构效关系 COMFA 含氟农药 小麦 赤霉病

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红外光谱谱图压缩-重建的新方法 被引量：6

4

作者 罗时玮 姚树文 +2 位作者 姚建华 袁身刚 郑崇直 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2000年第3期260-266,共7页

介绍一种基于“分析－综合”编码算法来实现高分辨率数值化红外光谱全谱数据的压缩和重建的方法．对１０万张红外谱图中随机抽取的５０５张数值化红外全谱谱图逐个进行压缩－重建实验，压缩比达１２．７：１，重建的谱图失真率很小．本... 介绍一种基于“分析－综合”编码算法来实现高分辨率数值化红外光谱全谱数据的压缩和重建的方法．对１０万张红外谱图中随机抽取的５０５张数值化红外全谱谱图逐个进行压缩－重建实验，压缩比达１２．７：１，重建的谱图失真率很小．本方法可以根据需要来选定图形基及其数目，在保证重建失真率的前提下，可使所需要压缩的谱图具有相等的数据量．压缩后的代码完全不再具有原数字谱图的坐标意义，必须经过特定方式处理才能恢复再现原谱图，因此也可用于对数据进行加密．适当地选择图形基，可用于其他复杂图形的压缩． 展开更多

关键词 分析综合编码 红外光谱 数据压缩 数据库

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大批量获取分子三维结构数据的方法 被引量：5

5

作者 杨铄 袁身刚 +1 位作者 陈敏伯 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 2000年第1期185-186,共2页

用VisualC + +编写程序 ,并结合PC机上运行的分子模拟软件HyperChem的专用脚本语言 ,实现二维分子结构的快速批量转化 ,从而用于三维化合物数据库的建立。

关键词 三维结构 批量转化 分子结构 数据库

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建立三维分子结构检索系统的总体设计 被引量：6

6

作者 袁身刚 姚建华 +1 位作者 陈海峰 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第1期77-80,共4页

简要介绍了一个比较完备的三维分子结构检索系统，它包括三维结构数据的集成、数据更新、全结构和子结构检索、药效团检索等功能。它是分子设计的一个有力的工具。

关键词 结构检索 位筛 药效团 三维 分子结构 检索系统

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SIOC化学数据库的网络化进展 被引量：5

7

作者 陈维明 王源 +2 位作者 朱谷 朱翠娣 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第5期355-356,共2页

介绍了 Ｓ Ｉ Ｏ Ｃ 上网的４ 个化学数据库， 包括两个化工企业和厂商数据库，

关键词 WEB 化学数据库 红外光谱数据库 文献数据库

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红外谱图中特征峰与对应子结构相互关系的确定 被引量：1

8

作者 陈海峰 罗时玮 +5 位作者 姚建华 袁身刚 郑崇直 范波涛 A.PANAYE J.P.DOUCET 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 2000年第1期183-184,共2页

采用子结构检索、公共子结构寻找和相似指数计算的方法研究了红外特征峰与对应子结构的相互关系。说明对大量谱图信息进行统计分析确定基团的特征峰 ,是一种行之有效的方法。

关键词 子结构检索 特征峰 化学结构 红外谱图

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族性化学结构的计算机处理－族性结构文字描述部分的分析与存储 被引量：2

9

作者 李航 陈维明 +1 位作者 王源 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1996年第4期257-262,共6页

报告了一个基于形式语言的语法分析方法，对用ＤＥＬＡＧＥＳ描述语言描述的族性结构文字描述部分进行分析。分析结果以语法树形式存放，以方便下一步的检索或匹配。由于使用了语法分析，程序可以报告文字描述可能存在的错误并指出错误... 报告了一个基于形式语言的语法分析方法，对用ＤＥＬＡＧＥＳ描述语言描述的族性结构文字描述部分进行分析。分析结果以语法树形式存放，以方便下一步的检索或匹配。由于使用了语法分析，程序可以报告文字描述可能存在的错误并指出错误的位置。 展开更多

关键词 有机化合物 形式语言 族性结构 计算机

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数据库的整合与数据网络 被引量：1

10

作者 陈维明 孙传涛 +1 位作者 王源 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期245-247,共3页

本文提出了一个用于数据库整合的新思想-数据网络,讨论了与数据网络有关的2个主要技术问题,数据组装和数据登录,并以中医药信息系统为例说明了数据网络的应用及其特点。

关键词 整合 数据库 数据网络 数据组装 数据登录 中医药信息系统

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三维分子结构检索系统的结构索引与匹配 被引量：4

11

作者 姚建华 袁身刚 +3 位作者 陈海峰 郑崇直 杨铄 范波涛 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第2期97-100,共4页

介绍了三维分子结构检索系统的结构索引与匹配，应用位筛成功地实现了三维结构数据的索引，可以快速得到候选结构，然后使用原子－原子匹配算法获得精确的命中结构。

关键词 结构索引 三维分子结构 分子结构 检索系统

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三维分子结构检索系统的柔性构象检索 被引量：4

12

作者 陈海峰 姚建华 +6 位作者 袁身刚 荔建锋 杨铄 郑崇直 范波涛 A.PANAYE J.P.DOUCET 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第2期101-104,110,共5页

介绍了ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ法和遗传算法两种柔性构象检索方法，并对４种药效团进行了柔性构象检索，经过对比发现遗传算法可以在比较合理的时间内得得到较多的命中结构，比ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ法更适用于柔性构象检索。

关键词 柔性构象检索 三维分子结构 分子结构 检索

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可用合成原料数据库的建立 被引量：2

13

作者 陈旭东 王利莎 +1 位作者 袁身刚 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第3期171-174,共4页

可用合成原料数据库是计算机辅助合成设计系统不可缺少的组成部分。本文介绍建立可用合成原料数据库所需考虑的几个主要问题：入库化合物的来源、入选原则、建立数据库的方法等。同时，本文还简单介绍了已初步建成的含有３４００多个化... 可用合成原料数据库是计算机辅助合成设计系统不可缺少的组成部分。本文介绍建立可用合成原料数据库所需考虑的几个主要问题：入库化合物的来源、入选原则、建立数据库的方法等。同时，本文还简单介绍了已初步建成的含有３４００多个化合物的可用合成原料数据库。 展开更多

关键词 合成设计 合成原料 数据库 计算机辅助

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胆汁中游离胆汁酸的薄层层析分离与定量测定 被引量：3

14

作者 洪南康 孟承伟 +1 位作者 郑崇直 罗国芳 《上海医学》 CAS 1983年第1期41-43,共3页

本文介绍用薄层层析法测定胆汁中游离型胆汁酸。溶剂系统为异辛烷:异丙醚∶冰醋酸∶正丁醇∶水(12∶5∶5∶3∶1v/v)。分离后各游离型胆汁酸斑点用磷钼酸显色剂显色,然后用分光光度计进行比色测定。

关键词 胆汁酸 游离型 薄层层析分离 定量测定 胆酸

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虚拟活性化合物的自动生成 被引量：3

15

作者 陈海峰 荔建锋 +2 位作者 姚建华 袁身刚 郑崇直 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第5期529-532,共4页

虚拟活性化合物的自动生成是从药效团和预先设定的结构碎片出发,通过碎片选择、碎片组装和柔性构象搜索来获得虚拟活性结构.经过对HIV-1蛋白酶抑制剂药效团进行虚拟活性化合物生成,得到了16个虚拟活性化合物,通过构象分析发现生成的化... 虚拟活性化合物的自动生成是从药效团和预先设定的结构碎片出发,通过碎片选择、碎片组装和柔性构象搜索来获得虚拟活性结构.经过对HIV-1蛋白酶抑制剂药效团进行虚拟活性化合物生成,得到了16个虚拟活性化合物,通过构象分析发现生成的化合物满足药效团的限制条件.说明这一方法能够有效的生成虚拟活性结构,与药效团检索结果对比发现生成的虚拟活性结构新颖易于合成. 展开更多

关键词 虚拟活性化合物 药效团 HIV-1蛋白酶掏剂

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胆汁中结合胆汁酸的薄层层析分离与定量测定 被引量：2

16

作者 郑崇直 罗国芳 +5 位作者 管重庆 王大琛 蔡祝辉 洪南康 吴新华 孟承伟 《上海医学》 CAS 1983年第1期38-40,共3页

本文介绍用薄层层析法测定胆汁中结合型胆汁酸。溶剂系统为氯仿:无水乙醇:乙酸乙酯:冰醋酸:水(5∶7∶10∶2∶1v/v)。分离后各结合型胆汁酸斑点用磷钼酸显色剂显色,然后用分光光度计进行比色测定。

关键词 胆汁酸 薄层层析分离 定量测定 溶剂系统

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药物专利数据库的需求分析和概要设计 被引量：1

17

作者 陈维明 孙传涛 +6 位作者 储成桂 王源 郑崇直 刘延淮 孙艳玲 俞飞白 程文堂 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 2000年第1期131-132,共2页

对药物专利数据库进行了需求分析和讨论 ,提出了基于数据流图的概要设计。

关键词 药物数据库 药物专利 药物专利数据库

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化学反应处理的计算模型 被引量：1

18

作者 王利莎 袁身刚 郑崇直 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期472-478,共7页

介绍了一种将同类反应上升为合成反应知识和在计算机上实现反合成分析的方法.反合成分析是合成设计中最关键的一步,在本工作中采用了基于谋略键寻找的合成设计方法.它有逻辑宜于在计算机上实现的优点.为了实现这个方法,我们首次提出了... 介绍了一种将同类反应上升为合成反应知识和在计算机上实现反合成分析的方法.反合成分析是合成设计中最关键的一步,在本工作中采用了基于谋略键寻找的合成设计方法.它有逻辑宜于在计算机上实现的优点.为了实现这个方法,我们首次提出了一种能中肯地描述合成反应的计算模型--反应知识的分类模型.这一模型由三条规则定义:规则A--反应类型;规则B--发生反应的外部条件;规则C--不适宜采用这个反应的情况.这种计算模型能够将海量反应数据中最重要最基本的信息提炼出来,转换成计算机能处理的知识.它也包含有反应适用范围的信息,从而提高了析分过程的外推能力. 展开更多

关键词 反应知识描述 谋略键 反合成分析 有机合成 计算模型 设计 计算机处理

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BENSON法预测标准生成焓的改进与程序实现 被引量：2

19

作者 谭瑾 陈敏伯 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第6期426-434,共9页

本工作改进、扩充了Ｂｅｎｓｏｎ － Ｂｕｓｓ 的基团加和法计算有机化合物标准生成焓的方案， 完成了化学结构特征的计算机识别， 扩充了Ｂｅｎｓｏｎ 的碎片库， 改良了旁式校正方法， 建立了原子属性库、碎片库、环校正库、顺式校正... 本工作改进、扩充了Ｂｅｎｓｏｎ － Ｂｕｓｓ 的基团加和法计算有机化合物标准生成焓的方案， 完成了化学结构特征的计算机识别， 扩充了Ｂｅｎｓｏｎ 的碎片库， 改良了旁式校正方法， 建立了原子属性库、碎片库、环校正库、顺式校正库。将该方法实现成微机上运行的Ｗｉｎｄｏｗｓ 应用软件。对７０４ 个化合物的预测值与实验值进行相关性分析， 相关性系数为０－９７５。改进后的Ｂｅｎｓｏｎ 法比其它基团加和法有明显的优越性。 展开更多

关键词 气态 标准生成焓 Benson法 基团加和法 程序

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一种新的化学结构拓扑编码方法 被引量：2

20

作者 袁身刚 赵霞 +1 位作者 曾繁友 郑崇直 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 1990年第7期60-62,共3页

分子的化学结构式由于它能抓住分子结构的主要特征——原子及其联接它们的键,从而简明地表述出整个分子的特性,成为长期以来公认的描述化合物分子结构的基础。随着计算机技术的飞速发展,相当数量的化学家已采用计算机来处理(贮存。

关键词 分子 化学结构 拓扑编码法

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