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无籽蜜柚蔗糖合成酶(SUS)和蔗糖转化酶(INV)基因家族生物信息学及表达分析
被引量:
12
1
作者
邓
舒
雅
麦贻婷
+1 位作者
陈惠萍
钮俊
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1576-1586,共11页
蔗糖是光合作用的最终产物,通过韧皮部运输到植物的非光合组织中,蔗糖的分解主要由蔗糖合成酶(SUS)和蔗糖转化酶(INV)催化。为了探究SUS和INV基因家族在无籽蜜柚汁胞发育中的功能,本文通过HPLC研究,结果表明阿拉伯糖和木糖在汁胞早期发...
蔗糖是光合作用的最终产物,通过韧皮部运输到植物的非光合组织中,蔗糖的分解主要由蔗糖合成酶(SUS)和蔗糖转化酶(INV)催化。为了探究SUS和INV基因家族在无籽蜜柚汁胞发育中的功能,本文通过HPLC研究,结果表明阿拉伯糖和木糖在汁胞早期发育中含量较高,而果糖、葡萄糖和蔗糖的含量随成熟过程显著增加。基于拟南芥数据库中SUS和INV蛋白序列,与柚子的基因组数据进行同源比对,分别筛选获得6个和12个具有完整开放阅读框(ORF)的Cg-SUS和Cg-INV基因。根据其在染色体上分布,分别命名为Cg-SUS1~6和CgINV1~12,并对其蛋白理化性质、内含子与外显子、系统进化树和蛋白功能结构域等方面加以分析。数字表达谱分析初步确定无籽蜜柚汁胞在发育过程中Cg-SUS2、Cg-SUS3和Cg-INV6转录较为活跃,对其进行qRTPCR分析,结合各类糖含量的检测结果与基因表达做相关性分析,结果显示Cg-SUS2表达量与木糖、阿拉伯糖含量之间存在极显著正相关性,因此Cg-SUS2可能涉及阿拉伯糖和木糖的生物合成; Cg-SUS3和Cg-INV6表达量与葡萄糖、果糖、蔗糖含量之间存在显著正相关性,说明Cg-SUS3可能参与到蔗糖的降解途径中,从而促使转运过来的蔗糖生成UDP-葡萄糖和果糖, Cg-INV6可能是液泡己糖累积的关键酶。
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关键词
无籽蜜柚
汁胞发育
蔗糖合成酶
蔗糖转化酶
原文传递
山杏LACS基因家族生物信息学及表达分析
被引量:
3
2
作者
邓
舒
雅
肖羽
+2 位作者
张鹤婷
陈惠萍
钮俊
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期1977-1984,共8页
在植物脂肪酸的代谢途径中,长链酰基辅酶A合成酶把游离脂肪酸活化成酰基辅酶A,是调控脂肪酸代谢的重要酶。依据山杏(Prunus sibirica)转录组数据,开展LACS保守域比对分析,共确定6个具有完整ORF的LACS基因,其长度为2 360~2 900 bp,编码...
在植物脂肪酸的代谢途径中,长链酰基辅酶A合成酶把游离脂肪酸活化成酰基辅酶A,是调控脂肪酸代谢的重要酶。依据山杏(Prunus sibirica)转录组数据,开展LACS保守域比对分析,共确定6个具有完整ORF的LACS基因,其长度为2 360~2 900 bp,编码氨基酸为654~730 aa。开展LACS蛋白保守域及进化树分析,确定了山杏LACS具有AMP绑定域,说明其在物种间的高度保守性。同时,对不同发育期山杏杏仁的LACS基因开展q RT-PCR表达谱分析。为探究杏仁发育过程中油脂的累积模式,以山杏为试材,采用索氏提取法对其油脂含量进行测定,确定杏仁油的主要累积期在20~50 DAF。结合油脂含量的检测结果,对蛋白互作网络和基因表达等方面加以分析,确定山杏LACS9与油脂累积密切相关。本研究结果可为后续探究LACS基因家族在山杏杏仁发育及油脂累积中的调控机制奠定基础。
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关键词
山杏
长链酰基辅酶A合成酶
生物信息学分析
qRT-PCR分析
原文传递
题名
无籽蜜柚蔗糖合成酶(SUS)和蔗糖转化酶(INV)基因家族生物信息学及表达分析
被引量:
12
1
作者
邓
舒
雅
麦贻婷
陈惠萍
钮俊
机构
海南大学热带农林学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1576-1586,共11页
基金
海南省自然科学基金面上项目(317045)
海南大学科研启动基金项目[KYQD(ZR)1701]~~
文摘
蔗糖是光合作用的最终产物,通过韧皮部运输到植物的非光合组织中,蔗糖的分解主要由蔗糖合成酶(SUS)和蔗糖转化酶(INV)催化。为了探究SUS和INV基因家族在无籽蜜柚汁胞发育中的功能,本文通过HPLC研究,结果表明阿拉伯糖和木糖在汁胞早期发育中含量较高,而果糖、葡萄糖和蔗糖的含量随成熟过程显著增加。基于拟南芥数据库中SUS和INV蛋白序列,与柚子的基因组数据进行同源比对,分别筛选获得6个和12个具有完整开放阅读框(ORF)的Cg-SUS和Cg-INV基因。根据其在染色体上分布,分别命名为Cg-SUS1~6和CgINV1~12,并对其蛋白理化性质、内含子与外显子、系统进化树和蛋白功能结构域等方面加以分析。数字表达谱分析初步确定无籽蜜柚汁胞在发育过程中Cg-SUS2、Cg-SUS3和Cg-INV6转录较为活跃,对其进行qRTPCR分析,结合各类糖含量的检测结果与基因表达做相关性分析,结果显示Cg-SUS2表达量与木糖、阿拉伯糖含量之间存在极显著正相关性,因此Cg-SUS2可能涉及阿拉伯糖和木糖的生物合成; Cg-SUS3和Cg-INV6表达量与葡萄糖、果糖、蔗糖含量之间存在显著正相关性,说明Cg-SUS3可能参与到蔗糖的降解途径中,从而促使转运过来的蔗糖生成UDP-葡萄糖和果糖, Cg-INV6可能是液泡己糖累积的关键酶。
关键词
无籽蜜柚
汁胞发育
蔗糖合成酶
蔗糖转化酶
Keywords
Citrus grandis 'Seedless'
juice sacs development
sucrose synthase
invertase
分类号
S666.3 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
山杏LACS基因家族生物信息学及表达分析
被引量:
3
2
作者
邓
舒
雅
肖羽
张鹤婷
陈惠萍
钮俊
机构
海南大学热带农林学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期1977-1984,共8页
基金
海南大学科研基金资助项目(No.KYQD(ZR))资助
文摘
在植物脂肪酸的代谢途径中,长链酰基辅酶A合成酶把游离脂肪酸活化成酰基辅酶A,是调控脂肪酸代谢的重要酶。依据山杏(Prunus sibirica)转录组数据,开展LACS保守域比对分析,共确定6个具有完整ORF的LACS基因,其长度为2 360~2 900 bp,编码氨基酸为654~730 aa。开展LACS蛋白保守域及进化树分析,确定了山杏LACS具有AMP绑定域,说明其在物种间的高度保守性。同时,对不同发育期山杏杏仁的LACS基因开展q RT-PCR表达谱分析。为探究杏仁发育过程中油脂的累积模式,以山杏为试材,采用索氏提取法对其油脂含量进行测定,确定杏仁油的主要累积期在20~50 DAF。结合油脂含量的检测结果,对蛋白互作网络和基因表达等方面加以分析,确定山杏LACS9与油脂累积密切相关。本研究结果可为后续探究LACS基因家族在山杏杏仁发育及油脂累积中的调控机制奠定基础。
关键词
山杏
长链酰基辅酶A合成酶
生物信息学分析
qRT-PCR分析
Keywords
Prunus sibirica, Long chain acyl-coenzyme A synthetases, Bioinformatics analysis, qRT-PCR analysis
分类号
S662.2 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
无籽蜜柚蔗糖合成酶(SUS)和蔗糖转化酶(INV)基因家族生物信息学及表达分析
邓
舒
雅
麦贻婷
陈惠萍
钮俊
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
12
原文传递
2
山杏LACS基因家族生物信息学及表达分析
邓
舒
雅
肖羽
张鹤婷
陈惠萍
钮俊
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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