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基于网络药理学和分子对接技术探讨健脾益肾化痰方对肺癌的作用机制 被引量：1
1
作者 王超 连振清 +3 位作者 杜铖豪 刘丽晶 管未峰 王志光 《云南民族大学学报（自然科学版）》 CAS 2023年第6期708-716,共9页
运用网络药理学和分子对接技术探讨健脾益肾化痰方治疗肺癌的分子机制.通过TCMSP、化学专业数据库收集健脾益肾化痰方的活性成分,并通过PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取活性成分的靶点,Gene Cards、Gene、CTD数据库收集肺... 运用网络药理学和分子对接技术探讨健脾益肾化痰方治疗肺癌的分子机制.通过TCMSP、化学专业数据库收集健脾益肾化痰方的活性成分,并通过PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取活性成分的靶点,Gene Cards、Gene、CTD数据库收集肺癌相关靶点,将肺癌相关靶点与健脾益肾化痰方活性成分靶点取交集即为健脾益肾化痰方治疗肺癌的潜在靶点.利用Cytoscape软件构建健脾益肾化痰方干预肺癌的中药复方网络图、STRING数据库构建潜在靶点的蛋白质互作网络、Cytoscape进行可视化、Metascape数据库对健脾益肾化痰方抗肺癌的潜在靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析.选取Degree排名前6位的活性成分与靶点分别运用AutoDockTools进行分子对接及可视化.结果筛选到111个健脾益肾化痰方相关活性成分,涉及966个靶点,其中与肺癌相关的靶点有373个.健脾益肾化痰方可能通过β-谷甾醇、豆甾醇、苏齐内酯等核心成分,作用于SRC、MAPK1、ATK1等核心靶点,干预肺癌中肿瘤通路、PI3K-AKT信号通路和肿瘤中的蛋白聚糖等信号通路,参与了细胞迁移的正调控、细胞运动的正调节、细胞成分运动的正调节等生物过程以干预肺癌.表明健脾益肾化痰方可能通过多靶标、多途径干预肺癌.其核心成分可能是β-谷甾醇、豆甾醇、苏齐内酯等.为进一步研究健脾益肾化痰方防治肺癌的机制提供理论支持. 展开更多
关键词 健脾益肾化痰方 网络药理学 分子对接 肺癌
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基于网络药理学与分子对接技术探讨瑶药酸藤子抗炎的机制
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作者 张仲敏 连振清 +2 位作者 刘丽晶 杜铖豪 王超 《邵阳学院学报（自然科学版）》 2022年第5期82-90,共9页
目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨瑶药酸藤子抗炎的分子机制。方法 通过Gene Cards、Gene、CTD数据库收集炎症相关靶点,通过查阅文献获取瑶药酸藤子的活性成分,并通过Swiss Target Prediction数据库获取活性成分的靶点。将炎症相... 目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨瑶药酸藤子抗炎的分子机制。方法 通过Gene Cards、Gene、CTD数据库收集炎症相关靶点,通过查阅文献获取瑶药酸藤子的活性成分,并通过Swiss Target Prediction数据库获取活性成分的靶点。将炎症相关靶点与酸藤子活性成分靶点取交集即为酸藤子抗炎的潜在靶点,利用STRING数据库构建靶点的蛋白质相互作用网络。利用生物信息在线分析工具对酸藤子抗炎的潜在靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。选取Degree排名前3的活性成分与靶点分别进行分子对接及可视化。结果 筛选到7个酸藤子的活性成分,涉及267个靶点,其中与炎症相关的靶点有123个。酸藤子抗炎的靶基因主要涉及氧化应激反应、类固醇激素反应、对活性氧反应等生物过程,包含PI3K-Akt,癌症中的microRNA、癌症中的蛋白多糖等信号通路。分子对接结果显示3个活性成分蒽贝素、金圣草黄素、槲皮素与IL-6、HSP90AA1、AKT1 3个靶点均能有效结合。结论 瑶药酸藤子可能通过多靶标、多途径干预炎症。其核心成分可能是蒽贝素、金圣草黄素、槲皮素。 展开更多
关键词 瑶药 酸藤子 网络药理学 分子对接 炎症
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