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青花菜种质资源遗传多样性的ISSR分析
被引量:
8
1
作者
王岚
朱熠
鹏
+4 位作者
蒋明
楼潇潇
赵
罗
鹏
朱柯柯
管铭
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第4期915-919,共5页
利用ISSR分子标记技术,对来自国内外的33个青花菜(Brassica oleracea var.italica)材料进行遗传多样性研究。从100条通用ISSR引物中筛选出15条用于PCR扩增,共得到可重复的211条清晰谱带,其中多态性谱带180条,多态性条带比率(PPB)为85.3...
利用ISSR分子标记技术,对来自国内外的33个青花菜(Brassica oleracea var.italica)材料进行遗传多样性研究。从100条通用ISSR引物中筛选出15条用于PCR扩增,共得到可重复的211条清晰谱带,其中多态性谱带180条,多态性条带比率(PPB)为85.31%,平均Nei's基因多样性指数与Shannon's信息指数为0.332 7和0.487 7;材料间遗传距离范围为0.09~0.45,平均0.28;聚类分析表明,33份青花菜种质可分为4组,没有明显的地域分布规律。结果表明,ISSR标记可用于青花菜种质的分子鉴定;青花菜供试材料具有一定的遗传多样性。
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关键词
青花菜
种质资源
遗传多样性
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职称材料
结球白菜转录因子基因BrCCCH的克隆与分析
2
作者
王岚
金建峰
+3 位作者
蒋明
赵
罗
鹏
田星
楼潇潇
《浙江农业科学》
2014年第7期1040-1043,共4页
CCCH型锌指蛋白是1种转录因子,在植物生长、发育和逆境反应中起着重要的调控作用。本研究以结球白菜叶片为材料,利用PCR技术克隆到1个CCCH基因。结果表明,BrCCCH的基因组全长为2 302 bp,具6个内含子,编码450个氨基酸,BrCCCH编码蛋白有5...
CCCH型锌指蛋白是1种转录因子,在植物生长、发育和逆境反应中起着重要的调控作用。本研究以结球白菜叶片为材料,利用PCR技术克隆到1个CCCH基因。结果表明,BrCCCH的基因组全长为2 302 bp,具6个内含子,编码450个氨基酸,BrCCCH编码蛋白有5个保守的C-X8-C-X5-C-X3-H基序;序列比对结果表明,BrCCCH与13种植物CCCH基因的相似性为45%~97%,与同属植物芜菁的相似性最大,与禾本科的乌拉尔图小麦的相似性最小;从进化树上看,不同科的植物各自聚为1组,支持率达100%。BrCCCH基因的克隆为后续开展其表达分析和基因功能鉴定奠定了基础。
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关键词
结球白菜
CCCH
基因克隆
转录因子
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职称材料
青花菜CC-NBS-LRR抗病基因BoCNL1的克隆与分析
3
作者
黄笑梅
金建峰
+4 位作者
张雪
朱思眉
朱柯柯
赵
罗
鹏
蒋明
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第2期259-263,共5页
根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849...
根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849个氨基酸;编码蛋白具CC(卷曲螺旋)、NBS和LRR结构域;进化分析结果表明,BoCNL1与不结球白菜的关系最近,在进化树上处于同一分支,与醉蝶花的关系最远;RT-PCR结果表明,BoCNL1在根、花茎、叶、花蕾、开放的花和嫩角果中均有表达,但表达量低。
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关键词
青花菜
抗病基因
CC-NBS-LRR
基因克隆
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职称材料
题名
青花菜种质资源遗传多样性的ISSR分析
被引量:
8
1
作者
王岚
朱熠
鹏
蒋明
楼潇潇
赵
罗
鹏
朱柯柯
管铭
机构
台州学院生命科学学院
贵阳市科技干部培训中心
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第4期915-919,共5页
基金
浙江省公益性技术应用研究计划项目(2012C32011)
台州市科技计划项目(121KY16)
浙江省自然科学基金项目(LY13C150003)
文摘
利用ISSR分子标记技术,对来自国内外的33个青花菜(Brassica oleracea var.italica)材料进行遗传多样性研究。从100条通用ISSR引物中筛选出15条用于PCR扩增,共得到可重复的211条清晰谱带,其中多态性谱带180条,多态性条带比率(PPB)为85.31%,平均Nei's基因多样性指数与Shannon's信息指数为0.332 7和0.487 7;材料间遗传距离范围为0.09~0.45,平均0.28;聚类分析表明,33份青花菜种质可分为4组,没有明显的地域分布规律。结果表明,ISSR标记可用于青花菜种质的分子鉴定;青花菜供试材料具有一定的遗传多样性。
关键词
青花菜
种质资源
遗传多样性
Keywords
ISSR
Brassica oleracea var.italica
germplasm resource
ISSR
genetic diversity
分类号
S635.9 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
结球白菜转录因子基因BrCCCH的克隆与分析
2
作者
王岚
金建峰
蒋明
赵
罗
鹏
田星
楼潇潇
机构
台州学院生命科学学院
出处
《浙江农业科学》
2014年第7期1040-1043,共4页
基金
浙江省自然科学基金项目(LY13C150003)
浙江省本科院校中青年学科带头人学术攀登项目(pd2013420)
台州学院校立学生科研项目(No.13XS24)
文摘
CCCH型锌指蛋白是1种转录因子,在植物生长、发育和逆境反应中起着重要的调控作用。本研究以结球白菜叶片为材料,利用PCR技术克隆到1个CCCH基因。结果表明,BrCCCH的基因组全长为2 302 bp,具6个内含子,编码450个氨基酸,BrCCCH编码蛋白有5个保守的C-X8-C-X5-C-X3-H基序;序列比对结果表明,BrCCCH与13种植物CCCH基因的相似性为45%~97%,与同属植物芜菁的相似性最大,与禾本科的乌拉尔图小麦的相似性最小;从进化树上看,不同科的植物各自聚为1组,支持率达100%。BrCCCH基因的克隆为后续开展其表达分析和基因功能鉴定奠定了基础。
关键词
结球白菜
CCCH
基因克隆
转录因子
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
青花菜CC-NBS-LRR抗病基因BoCNL1的克隆与分析
3
作者
黄笑梅
金建峰
张雪
朱思眉
朱柯柯
赵
罗
鹏
蒋明
机构
台州学院生命科学学院
浙江大学生命科学学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第2期259-263,共5页
基金
浙江省自然科学基金项目(LY13C150003)
浙江省大学生科技创新活动计划(新苗人才计划)(2014R428011)
浙江省本科院校中青年学科带头人学术攀登项目(pd2013420)
文摘
根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849个氨基酸;编码蛋白具CC(卷曲螺旋)、NBS和LRR结构域;进化分析结果表明,BoCNL1与不结球白菜的关系最近,在进化树上处于同一分支,与醉蝶花的关系最远;RT-PCR结果表明,BoCNL1在根、花茎、叶、花蕾、开放的花和嫩角果中均有表达,但表达量低。
关键词
青花菜
抗病基因
CC-NBS-LRR
基因克隆
Keywords
Brassica oleracea var
italica
disease resistance gene
CC-NBS-LRR
gene cloning
分类号
S635.3 [农业科学—蔬菜学]
Q78 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
青花菜种质资源遗传多样性的ISSR分析
王岚
朱熠
鹏
蒋明
楼潇潇
赵
罗
鹏
朱柯柯
管铭
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014
8
下载PDF
职称材料
2
结球白菜转录因子基因BrCCCH的克隆与分析
王岚
金建峰
蒋明
赵
罗
鹏
田星
楼潇潇
《浙江农业科学》
2014
0
下载PDF
职称材料
3
青花菜CC-NBS-LRR抗病基因BoCNL1的克隆与分析
黄笑梅
金建峰
张雪
朱思眉
朱柯柯
赵
罗
鹏
蒋明
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2016
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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