目的通过生物信息学分析方法筛选阿尔茨海默病(alzheimer s disease,AD)患者脑内皮层及海马区的相关基因。方法从GEO数据库中获取AD患者及对照脑内皮(EC)和海马组织(HIP)的基因表达芯片数据。利用GEO2R在线工具对两个数据集中的共同差...目的通过生物信息学分析方法筛选阿尔茨海默病(alzheimer s disease,AD)患者脑内皮层及海马区的相关基因。方法从GEO数据库中获取AD患者及对照脑内皮(EC)和海马组织(HIP)的基因表达芯片数据。利用GEO2R在线工具对两个数据集中的共同差异表达基因(DEGs)进行筛选,并进行基因本体(GO)分析和KEGG通路富集分析,同时构建蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络。结果分别从EC和HIP筛选出62和91个DEGs,其主要富集于化学突触传递、细胞外基质组织、蛋白质结合等生物过程和通路。PPI网络分析分别获得EC和HIP中前10个与AD发病相关的基因。结论ANGPT1、APLNR、MCHR1和ATP2B3等4个基因可能与AD的发病有关。展开更多
文摘目的通过生物信息学分析方法筛选阿尔茨海默病(alzheimer s disease,AD)患者脑内皮层及海马区的相关基因。方法从GEO数据库中获取AD患者及对照脑内皮(EC)和海马组织(HIP)的基因表达芯片数据。利用GEO2R在线工具对两个数据集中的共同差异表达基因(DEGs)进行筛选,并进行基因本体(GO)分析和KEGG通路富集分析,同时构建蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络。结果分别从EC和HIP筛选出62和91个DEGs,其主要富集于化学突触传递、细胞外基质组织、蛋白质结合等生物过程和通路。PPI网络分析分别获得EC和HIP中前10个与AD发病相关的基因。结论ANGPT1、APLNR、MCHR1和ATP2B3等4个基因可能与AD的发病有关。
