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LwaCas13a蛋白的表达纯化与活性分析
1
作者
豆玲
李泽轩
+5 位作者
贾
訸
潇
张彩云
左富江
李婷
谢元江
段晓雷
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期2941-2950,共10页
【目的】获得高纯度、高浓度、优良反式切割活性的韦德纤毛菌(Leptotrichia wadei)的Cas13a(LwaCas13a)蛋白,为研发基于CRISPR-LwaCas13a系统的动物病毒RNA检测新方法提供重要的生物学工具。【方法】通过PCR、双酶切与连接反应构建pET15...
【目的】获得高纯度、高浓度、优良反式切割活性的韦德纤毛菌(Leptotrichia wadei)的Cas13a(LwaCas13a)蛋白,为研发基于CRISPR-LwaCas13a系统的动物病毒RNA检测新方法提供重要的生物学工具。【方法】通过PCR、双酶切与连接反应构建pET15b-SUMO-LwaCas13a重组质粒,并进行原核诱导表达与条件优化;发酵100 mL大肠杆菌BL21(DE3)菌诱导表达LwaCas13a蛋白后进行纯化,纯化后利用超滤法浓缩蛋白,使用BCA法检测蛋白浓度。将LwaCas13a蛋白、CRISPR RNA(CrRNA)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)靶标RNA及荧光标记单链RNA(ssRNA)探针共孵育,利用全波长荧光分析仪检测CRISPR-LwaCas13a反式切割活性,与商业化Cas13a蛋白进行活性对比,并优化LwaCas13a与CrRNA最佳结合比例。【结果】成功构建重组质粒pET15b-SUMO-LwaCas13a;LwaCas13a重组蛋白的最佳诱导表达条件为0.4 mmol/L IPTG、18℃诱导16 h;经过纯化最终获得95%纯度、7.5 mg/mL浓度的LwaCas13a蛋白。荧光检测结果显示,LwaCas13a蛋白具有明显的反式切割活性,为商业化Cas13a蛋白活性的1.25倍,且LwaCas13a蛋白与CrRNA的最佳结合比例为1∶2。【结论】试验成功表达纯化出高纯度、高浓度的LwaCas13a重组蛋白,其反式切割活性优于商业化Cas13a蛋白,并明确了该蛋白与CrRNA的最佳配比,为利用LwaCas13a进行动物病毒RNA检测新技术的研发提供了依据。
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关键词
LwaCas13a蛋白
原核表达
SUMO酶切
反式切割活性
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职称材料
河南省食管癌高发区40~69岁人群食管癌筛查结果分析
被引量:
1
2
作者
贾
訸
潇
张芳
+4 位作者
胡建平
刘曙正
张萌
郭兰伟
曹小琴
《社区医学杂志》
2019年第24期1533-1535,1539,共4页
目的食管癌早期没有症状,出现症状就诊的患者基本处于晚期,预后差。本研究分析河南省食管癌高发区不同性别和年龄组人群筛查检出率和早诊率,为肿瘤早诊早治理论提供科学依据。方法选择河南省2015-2018年16个食管癌高发区筛查现场,对40~6...
目的食管癌早期没有症状,出现症状就诊的患者基本处于晚期,预后差。本研究分析河南省食管癌高发区不同性别和年龄组人群筛查检出率和早诊率,为肿瘤早诊早治理论提供科学依据。方法选择河南省2015-2018年16个食管癌高发区筛查现场,对40~69岁人群进行食管内镜下碘染色检查及指示性活检及病理学诊断。分析不同性别和年龄筛查的阳性检出率及早诊率差异。结果2015-2018年河南省共完成71601例首轮筛查,食管癌筛查阳性检出率为0.86%,早诊率为85.23%。男性食管癌筛查阳性检出率为1.07%,高于女性的0.71%,差异有统计学意义,χ~2=26.41,P<0.001,阳性检出率随年龄增加而增长,χ~2=468.43,P<0.001。男性早诊率为84.76%,女性早诊率为85.71%,两者比较差异无统计学意义,χ~2=0.11,P=0.739;各年龄组间早诊率差别亦无统计学意义,χ~2=0.24,P=0.887。结论河南省食管癌高发区40~69岁人群中不同年龄和性别食管癌阳性检出率有所不同,但早诊率无明显差别,与检出率相比,早诊率更加稳定。
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关键词
食管癌
早期诊断
早期治疗
检出率
早诊率
河南省
原文传递
题名
LwaCas13a蛋白的表达纯化与活性分析
1
作者
豆玲
李泽轩
贾
訸
潇
张彩云
左富江
李婷
谢元江
段晓雷
机构
甘肃省动物疫病预防控制中心
遵义医科大学检验医学院
南昌大学玛丽女王学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期2941-2950,共10页
基金
国家自然科学基金项目(82160409)
贵州省科技厅合作基础研究项目(黔科合基础[2018]1196)
遵义医科大学大学生创新创业训练计划(ZYDC2020098)。
文摘
【目的】获得高纯度、高浓度、优良反式切割活性的韦德纤毛菌(Leptotrichia wadei)的Cas13a(LwaCas13a)蛋白,为研发基于CRISPR-LwaCas13a系统的动物病毒RNA检测新方法提供重要的生物学工具。【方法】通过PCR、双酶切与连接反应构建pET15b-SUMO-LwaCas13a重组质粒,并进行原核诱导表达与条件优化;发酵100 mL大肠杆菌BL21(DE3)菌诱导表达LwaCas13a蛋白后进行纯化,纯化后利用超滤法浓缩蛋白,使用BCA法检测蛋白浓度。将LwaCas13a蛋白、CRISPR RNA(CrRNA)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)靶标RNA及荧光标记单链RNA(ssRNA)探针共孵育,利用全波长荧光分析仪检测CRISPR-LwaCas13a反式切割活性,与商业化Cas13a蛋白进行活性对比,并优化LwaCas13a与CrRNA最佳结合比例。【结果】成功构建重组质粒pET15b-SUMO-LwaCas13a;LwaCas13a重组蛋白的最佳诱导表达条件为0.4 mmol/L IPTG、18℃诱导16 h;经过纯化最终获得95%纯度、7.5 mg/mL浓度的LwaCas13a蛋白。荧光检测结果显示,LwaCas13a蛋白具有明显的反式切割活性,为商业化Cas13a蛋白活性的1.25倍,且LwaCas13a蛋白与CrRNA的最佳结合比例为1∶2。【结论】试验成功表达纯化出高纯度、高浓度的LwaCas13a重组蛋白,其反式切割活性优于商业化Cas13a蛋白,并明确了该蛋白与CrRNA的最佳配比,为利用LwaCas13a进行动物病毒RNA检测新技术的研发提供了依据。
关键词
LwaCas13a蛋白
原核表达
SUMO酶切
反式切割活性
Keywords
LwaCas13a protein
prokaryotic expression
SUMO enzyme digestion
trans-cleavage activity
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
河南省食管癌高发区40~69岁人群食管癌筛查结果分析
被引量:
1
2
作者
贾
訸
潇
张芳
胡建平
刘曙正
张萌
郭兰伟
曹小琴
机构
南昌大学玛丽女王学院
河南省中医药大学第一附属医院纠风办
河南省医学会办公室
郑州大学附属肿瘤医院
出处
《社区医学杂志》
2019年第24期1533-1535,1539,共4页
基金
国家重点研发计划(2016YFC1302800,2016YFC0901400).
文摘
目的食管癌早期没有症状,出现症状就诊的患者基本处于晚期,预后差。本研究分析河南省食管癌高发区不同性别和年龄组人群筛查检出率和早诊率,为肿瘤早诊早治理论提供科学依据。方法选择河南省2015-2018年16个食管癌高发区筛查现场,对40~69岁人群进行食管内镜下碘染色检查及指示性活检及病理学诊断。分析不同性别和年龄筛查的阳性检出率及早诊率差异。结果2015-2018年河南省共完成71601例首轮筛查,食管癌筛查阳性检出率为0.86%,早诊率为85.23%。男性食管癌筛查阳性检出率为1.07%,高于女性的0.71%,差异有统计学意义,χ~2=26.41,P<0.001,阳性检出率随年龄增加而增长,χ~2=468.43,P<0.001。男性早诊率为84.76%,女性早诊率为85.71%,两者比较差异无统计学意义,χ~2=0.11,P=0.739;各年龄组间早诊率差别亦无统计学意义,χ~2=0.24,P=0.887。结论河南省食管癌高发区40~69岁人群中不同年龄和性别食管癌阳性检出率有所不同,但早诊率无明显差别,与检出率相比,早诊率更加稳定。
关键词
食管癌
早期诊断
早期治疗
检出率
早诊率
河南省
Keywords
esophageal cancer
early diagnosis
early treatment
detection rate
early diagnosis rate
Henan Province
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
LwaCas13a蛋白的表达纯化与活性分析
豆玲
李泽轩
贾
訸
潇
张彩云
左富江
李婷
谢元江
段晓雷
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
河南省食管癌高发区40~69岁人群食管癌筛查结果分析
贾
訸
潇
张芳
胡建平
刘曙正
张萌
郭兰伟
曹小琴
《社区医学杂志》
2019
1
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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