期刊文献+
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究 被引量:2
1
作者 陶小买 曾丽娜 +4 位作者 张婷婷 任建国 张洁 刘红美 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期3533-3539,共7页
采用生物信息学方法分析短短芽孢杆菌GZDF3菌株几丁质酶BBChi4基因,以GZDF3菌株全基因组DNA为模版设计特异性引物,通过PCR扩增出BBChi4基因的全序列并对其测序验证。将测序验证无误的基因序列连接到原核表达载体(pET-28a),构建重组表达... 采用生物信息学方法分析短短芽孢杆菌GZDF3菌株几丁质酶BBChi4基因,以GZDF3菌株全基因组DNA为模版设计特异性引物,通过PCR扩增出BBChi4基因的全序列并对其测序验证。将测序验证无误的基因序列连接到原核表达载体(pET-28a),构建重组表达载体pET-28a-BBchi4,转入大肠杆菌BL21进行诱导表达,利用打孔法对诱导表达产物进行抑菌活性研究。生物信息学分析显示BBChi4基因全长为2 181 bp,编码726个氨基酸,分子量大小为77.69 kD,等电点为4.83,属于酸性几丁质酶。破碎重组表达菌体上清液SDS-PAGE电泳显示,重组蛋白质分子量大约为78 kD,与生物信息学预测结果一致。诱导表达最佳参数为1 mmol/L IPTG,30℃诱导4 h。破碎重组表达菌体上清液对半夏致病真菌(尖孢镰刀菌)有较强的拮抗作用。重组表达载体pET-28a-BBchi4的成功构建及表达为深入研究几丁质酶的功能提供科学依据。 展开更多
关键词 短短芽孢杆菌 几丁质酶基因 原核表达 抑菌活性
原文传递
短短芽孢杆菌GZDF3中PilZ结构域基因的挖掘和糖基转移酶的原核表达
2
作者 张功友 +3 位作者 陶小买 吴东明 隆耀航 刘红美 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2944-2951,共8页
【背景】PilZ结构域是最早发现的环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)受体信号分子,与c-di-GMP结合后可以调控目标基因或者蛋白的活性,在细菌的生长过程中发挥着至关重要的作用,而短短芽孢杆菌中PilZ结构域的研究相对缺乏。【目的... 【背景】PilZ结构域是最早发现的环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)受体信号分子,与c-di-GMP结合后可以调控目标基因或者蛋白的活性,在细菌的生长过程中发挥着至关重要的作用,而短短芽孢杆菌中PilZ结构域的研究相对缺乏。【目的】挖掘短短芽孢杆菌GZDF3菌株中的PilZ结构域蛋白基因,并进行重组表达,为研究其功能奠定基础。【方法】从Pfam数据库中下载PilZ结构域模型,HMMScan软件扫描GZDF3全基因组序列,在保守结构域数据库(Conserved domain database,CDD)中分析蛋白保守结构域,Protein BLAST比对分析;采用ExPASy在线软件预测蛋白的基本理化性质;构建重组表达载体进行蛋白重组表达。【结果】GZDF3基因中存在5个含有PilZ结构域的蛋白编码基因,其中命名为Gene4836的基因经Protein BLAST比对分析显示其编码糖基转移酶,Gene1423为YcgR超家族蛋白编码基因,Gene1723编码透明质酸合成酶,属于糖基转移酶超家族2,其余Gene2571、Gene2956编码假定蛋白;Gene4836的编码产物分子量为24.08 kD,等电点为6.39,为酸性亲水性蛋白;C端有一个PilZ结构域;0.5 mmol/L乳糖诱导、30°C培养20 h,表达出一大小约为25kD的重组蛋白,与生物信息学预测结果相符。【结论】首次对短短芽孢杆菌含有PilZ结构域蛋白编码基因进行原核表达,并成功纯化出重组蛋白,为后续研究其功能奠定了基础。 展开更多
关键词 短短芽孢杆菌 PilZ结构域 糖基转移酶 原核表达 重组蛋白
原文传递
短短芽孢杆菌GZDF3嗜铁素合成酶基因Gene5693的生物信息学分析及原核表达
3
作者 袁林 +4 位作者 盛淼淼 王兵 曾丽娜 刘红美 隆耀航 《贵州医科大学学报》 CAS 2019年第8期916-920,共5页
目的:从短短芽孢杆菌GZDF3菌株中克隆嗜铁素合成酶基因Gene5693,构建其原核表达载体并进行重组表达。方法:利用antiSMASH软件对GZDF3全基因组序列进行次级代谢物预测分析,然后采用ExPASy在线分析预测嗜铁素合成酶基因Gene5693的基本理... 目的:从短短芽孢杆菌GZDF3菌株中克隆嗜铁素合成酶基因Gene5693,构建其原核表达载体并进行重组表达。方法:利用antiSMASH软件对GZDF3全基因组序列进行次级代谢物预测分析,然后采用ExPASy在线分析预测嗜铁素合成酶基因Gene5693的基本理化性质并进行重组表达。结果:生物信息学分析结果显示,短短芽孢杆菌GZDF3全基因组序列与Petrobactin嗜铁素基因簇的相似性为83%,Gene5693基因编码的蛋白与Petrobactin嗜铁素编码的蛋白AsbE的相似性为51.06%;Gene5693编码蛋白氨基酸长度为327个氨基酸,分子量为39.05kDa,等电点(pI)为4.94,为酸性亲水性蛋白;Gene5693基因的PCR扩增成功获得预测的Gene5693基因片段,菌落PCR及重组DNA分子的双酶切电泳结果显示成功构建重组质粒;SDS-PAGE结果表明Gene5693编码的蛋白大小与生物信息学预测的结果一致。结论:成功克隆了嗜铁素合成基因Gene5693,并进行了重组表达。 展开更多
关键词 嗜铁素 短短芽孢杆菌 生物信息学 原核表达
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部