WRKY转录因子是仅存于高等植物中的一个超级基因家族,在植物的多种应激反应中起着重要作用。为分析蔗茅WRKY基因家族,本研究利用生物信息学方法对蔗茅EfWRKY基因家族进行分析,并在冷胁迫下对EfWRKY基因的表达进行了分析。结果显示,EfWRK...WRKY转录因子是仅存于高等植物中的一个超级基因家族,在植物的多种应激反应中起着重要作用。为分析蔗茅WRKY基因家族,本研究利用生物信息学方法对蔗茅EfWRKY基因家族进行分析,并在冷胁迫下对EfWRKY基因的表达进行了分析。结果显示,EfWRKY基因的氨基酸数在58~633,分子量在6.47133~67.80718 k D,等电点在5.28~10.04,不稳定指数在25.19~84.29,脂肪系数在32.83~76.69,平均亲水系数在-1.337~-0.111。亚细胞定位显示41个蔗茅WRKY蛋白均在细胞核内。EfWRKY基因家族的二级结构中无规则卷曲占比最高。氨基酸序列比对及与水稻构建进化树分析表明,EfWRKY基因家族含有41个家族成员,共分为Ⅰ、Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅲa和Ⅲb 6个组。经Heatmap分析发现41个基因在受到不同程度的冷胁迫下EfWRKY基因都有不同程度的表达。展开更多
文摘WRKY转录因子是仅存于高等植物中的一个超级基因家族,在植物的多种应激反应中起着重要作用。为分析蔗茅WRKY基因家族,本研究利用生物信息学方法对蔗茅EfWRKY基因家族进行分析,并在冷胁迫下对EfWRKY基因的表达进行了分析。结果显示,EfWRKY基因的氨基酸数在58~633,分子量在6.47133~67.80718 k D,等电点在5.28~10.04,不稳定指数在25.19~84.29,脂肪系数在32.83~76.69,平均亲水系数在-1.337~-0.111。亚细胞定位显示41个蔗茅WRKY蛋白均在细胞核内。EfWRKY基因家族的二级结构中无规则卷曲占比最高。氨基酸序列比对及与水稻构建进化树分析表明,EfWRKY基因家族含有41个家族成员,共分为Ⅰ、Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅲa和Ⅲb 6个组。经Heatmap分析发现41个基因在受到不同程度的冷胁迫下EfWRKY基因都有不同程度的表达。
