基于生物信息分析山豆根中紫檀烷类化合物抗头颈部鳞状细胞癌作用机制。方法:通过文献查找山豆根中的紫檀烷类化合物,利用PubChem数据、GEO数据库、String数据库、GeneCards数据库、Systems Dock Web Site等预测靶点,采用Cytoscape软件...基于生物信息分析山豆根中紫檀烷类化合物抗头颈部鳞状细胞癌作用机制。方法:通过文献查找山豆根中的紫檀烷类化合物,利用PubChem数据、GEO数据库、String数据库、GeneCards数据库、Systems Dock Web Site等预测靶点,采用Cytoscape软件构建“化学成分—靶点—通路”网络。每个靶点参与多条通路在>=10以上的靶点即为关键靶点。运用STRING构建关键靶点蛋白互作网络图,运用AutoDockTools1.5.6、Pymol2.4.0进行分子对接。结果:TP53、NTRK1、YWHAZ、MCM2、HSPA5 NPM1、CUL3等154个蛋白可能是山豆根中紫檀烷类化合物发挥药理作用的关键靶点。结论:该研究结果为之后山豆根植物抗癌研究打下基础。展开更多
文摘基于生物信息分析山豆根中紫檀烷类化合物抗头颈部鳞状细胞癌作用机制。方法:通过文献查找山豆根中的紫檀烷类化合物,利用PubChem数据、GEO数据库、String数据库、GeneCards数据库、Systems Dock Web Site等预测靶点,采用Cytoscape软件构建“化学成分—靶点—通路”网络。每个靶点参与多条通路在>=10以上的靶点即为关键靶点。运用STRING构建关键靶点蛋白互作网络图,运用AutoDockTools1.5.6、Pymol2.4.0进行分子对接。结果:TP53、NTRK1、YWHAZ、MCM2、HSPA5 NPM1、CUL3等154个蛋白可能是山豆根中紫檀烷类化合物发挥药理作用的关键靶点。结论:该研究结果为之后山豆根植物抗癌研究打下基础。
