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基于生物信息学构建肝细胞癌预后相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络
被引量：
2
1
作者
袁浩
桐
姜博文
+3 位作者
李真鹏
井媛旭
袁硕
杨超
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第5期413-419,共7页
目的应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA(miRNA)-mRNA调控网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RN...
目的应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA(miRNA)-mRNA调控网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RNA Interactome及circBank数据库中预测与circRNA相结合的miRNA,在miRDB、RNAInter及TargetScan数据中预测miRNA的靶基因,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。应用DAVID软件、STRING数据库、Cytoscape软件及GEPIA数据库对靶基因进行功能注释、通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)构建及预后分析,最后确定肝癌预后相关circRNA-miRNA-核心靶基因调控网络。结果筛选出1个circRNA,为hsa_circRNA_0000301,与之结合的miRNA有4个,分别为hsamiR-377-3p、hsa-miR-767-3p、hsa-miR-1178-3p及hsa-miR-1228-3p。功能注释和通路富集分析显示靶基因主要参与泛素依赖性蛋白质分解代谢等过程,且在MAPK等多个信号通路中显著富集。通过PPI网络及预后分析筛选出3个预后相关核心靶基因,分别为EIF4E、PRKACB和NRAS。最后构建出含有1个circRNA,2个miRNA,3个靶基因的肝癌预后相关调控网络。结论本研究为深入挖掘肝癌发生的分子机制,寻找肝癌潜在的circRNA诊断标志物提供一定的研究依据。
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关键词
肝癌
环状RNA
微RNA
竞争性内源RNA
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职称材料
自适应性多管道清洗机器人的系统设计与研究
2
作者
齐展飞
陈艳
+2 位作者
严权
徐志强
袁浩
桐
《科教导刊（电子版）》
2020年第5期276-277,共2页
当前我国实行的油污管道清洁方式有两种,分别是物理清洗和化学清洗,这两种方法都需要在人工的操作下进行,其清洁效率低下,且造成人工成本的浪费。随着我国经济的飞速发展,人们对生活质量的要求也越来越高,对健康意识和环保意识也越来越...
当前我国实行的油污管道清洁方式有两种,分别是物理清洗和化学清洗,这两种方法都需要在人工的操作下进行,其清洁效率低下,且造成人工成本的浪费。随着我国经济的飞速发展,人们对生活质量的要求也越来越高,对健康意识和环保意识也越来越强,同时科技进步也推动了清洗技术和装备的快速发展。当下的清洗行业已发展为新型的潜力行业,因此,在管道清洗这一领域设计出一种实用的自动清洗装置显得尤为重要,本课题的研究,就是想利用Solid works这款软件的三维绘图功能,通过数字化模拟建模来设计可用于管道清洗的机器人,解决现在人工清洁所面临的的困难和不便。
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关键词
清洗
机器人
Solid
works
设计
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职称材料
题名
基于生物信息学构建肝细胞癌预后相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络
被引量：
2
1
作者
袁浩
桐
姜博文
李真鹏
井媛旭
袁硕
杨超
机构
齐齐哈尔医学院口腔医学院
齐齐哈尔医学院医学技术学院生物化学教研室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第5期413-419,共7页
基金
黑龙江省卫生健康委2021年医药卫生科研课题(20210202020361)
黑龙江省大学生创新创业训练计划项目(202111230007)
齐齐哈尔医学科学院项目(QMSI2020B-04)。
文摘
目的应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA(miRNA)-mRNA调控网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RNA Interactome及circBank数据库中预测与circRNA相结合的miRNA,在miRDB、RNAInter及TargetScan数据中预测miRNA的靶基因,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。应用DAVID软件、STRING数据库、Cytoscape软件及GEPIA数据库对靶基因进行功能注释、通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)构建及预后分析,最后确定肝癌预后相关circRNA-miRNA-核心靶基因调控网络。结果筛选出1个circRNA,为hsa_circRNA_0000301,与之结合的miRNA有4个,分别为hsamiR-377-3p、hsa-miR-767-3p、hsa-miR-1178-3p及hsa-miR-1228-3p。功能注释和通路富集分析显示靶基因主要参与泛素依赖性蛋白质分解代谢等过程,且在MAPK等多个信号通路中显著富集。通过PPI网络及预后分析筛选出3个预后相关核心靶基因,分别为EIF4E、PRKACB和NRAS。最后构建出含有1个circRNA,2个miRNA,3个靶基因的肝癌预后相关调控网络。结论本研究为深入挖掘肝癌发生的分子机制,寻找肝癌潜在的circRNA诊断标志物提供一定的研究依据。
关键词
肝癌
环状RNA
微RNA
竞争性内源RNA
Keywords
hepatocellular carcinoma
circle RNA
microRNA
competitive endogenous RNA
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
自适应性多管道清洗机器人的系统设计与研究
2
作者
齐展飞
陈艳
严权
徐志强
袁浩
桐
机构
武汉东湖学院
出处
《科教导刊（电子版）》
2020年第5期276-277,共2页
基金
2019年大学生创新创业国家级项目:自适应性多管道清洗机器人的系统设计与研究,(项目编号:201911798008。
文摘
当前我国实行的油污管道清洁方式有两种,分别是物理清洗和化学清洗,这两种方法都需要在人工的操作下进行,其清洁效率低下,且造成人工成本的浪费。随着我国经济的飞速发展,人们对生活质量的要求也越来越高,对健康意识和环保意识也越来越强,同时科技进步也推动了清洗技术和装备的快速发展。当下的清洗行业已发展为新型的潜力行业,因此,在管道清洗这一领域设计出一种实用的自动清洗装置显得尤为重要,本课题的研究,就是想利用Solid works这款软件的三维绘图功能,通过数字化模拟建模来设计可用于管道清洗的机器人,解决现在人工清洁所面临的的困难和不便。
关键词
清洗
机器人
Solid
works
设计
分类号
TP242.2 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学构建肝细胞癌预后相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络
袁浩
桐
姜博文
李真鹏
井媛旭
袁硕
杨超
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023
2
下载PDF
职称材料
2
自适应性多管道清洗机器人的系统设计与研究
齐展飞
陈艳
严权
徐志强
袁浩
桐
《科教导刊（电子版）》
2020
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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