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红树植物木榄SCoT-PCR体系优化及遗传多样性分析 被引量：6
1
作者 袁柳娇 余如凤 +4 位作者 钟军弟 刘锴栋 黎海利 袁长春 陈燕 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期352-361,共10页
为优化建立木榄的SCo T-PCR体系,利用建立的SCo T方法进行分析木榄不同地理种源的遗传多样性,基于L25(56)正交设计,本研究在5个水平上优化试验了5个影响木榄SCo T-PCR的因素:模板DNA、Mg^(2+)、d NTPs、Taq酶和引物。同时,运用优化的SC... 为优化建立木榄的SCo T-PCR体系,利用建立的SCo T方法进行分析木榄不同地理种源的遗传多样性,基于L25(56)正交设计,本研究在5个水平上优化试验了5个影响木榄SCo T-PCR的因素:模板DNA、Mg^(2+)、d NTPs、Taq酶和引物。同时,运用优化的SCo T体系对木榄8个不同地理种源进行遗传多样性分析。本研究结果建立了木榄SCo T-PCR最佳反应体系(20μL):模板DNA 20 ng,引物0.75μmol/L,d NTPs 0.5 mmol/L,Mg^(2+)2.5 mmol/L,Taq酶1.25 U。同时,筛选出了带谱清晰、多态性丰富的16条SCo T引物进行遗传多样性分析。共扩增出115个位点,其中73个为多态性位点,多态性比例为62.33%。从UPGMA聚类和PCo A分析结果可以看出8个地理种源间的遗传多样性及亲缘关系。研究表明SCo T分子标记可以用于木榄种群的遗传多样性。 展开更多
关键词 木榄 SCoT标记 体系优化 遗传多样性
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秋茄(Kandelia candel L.)响应重金属胁迫的数字基因表达谱 被引量：5
2
作者 袁柳娇 傅梦妮 +4 位作者 余如凤 黎海利 袁长春 陈燕 刘锴栋 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期22-28,共7页
基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对重金属污水胁迫处理组和对照组秋茄材料进行转录组测序分析。结果表明,重金属污水胁迫处理样品与对照样品相比,共筛选出的3 097个差异表达基因,其中2 202个表达上调,895个表达下调。GO功能... 基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对重金属污水胁迫处理组和对照组秋茄材料进行转录组测序分析。结果表明,重金属污水胁迫处理样品与对照样品相比,共筛选出的3 097个差异表达基因,其中2 202个表达上调,895个表达下调。GO功能显著性富集分析出38个GO分类条目,大量与生长发育,代谢调控,环境刺激响应相关的基因表现为富集。进一步的KEGG代谢途径分析表明,差异表达基因主要与糖类、核酸、蛋白质和脂质等生物大分子代谢、能量代谢以及次生代谢过程有关。转录因子分析发现b HLH,MYB,NAC和WRKY在重金属胁迫中发挥重要作用。此外,重金属胁迫还促进萜类、黄酮类化合物生物合成的关键酶基因(牻牛儿基焦磷酸合酶(Unigene0029352)、黄酮醇合成酶(Unigene0010384))的表达,进而促进秋茄有效成分的积累;显著诱导细胞分裂素相关基因type-b响应调节子ARR2(Unigene0033740)的表达、抑制油菜素内酯的信号转导组分基因BSK(Unigene0008986)的表达,进而提高秋茄对重金属胁迫的适应能力。实验选取了5个与环境刺激响应密切相关的基因,通过qRT-PCR验证了它们在重金属污水胁迫处理下的表达差异,结果与数字基因表达谱分析的结果较为一致,证实了差异表达基因数据的有效性。说明在重金属胁迫处理下,秋茄通过调节基因表达提高自身对污染胁迫的耐受能力。 展开更多
关键词 秋茄 重金属 污水胁迫处理 数字基因表达谱(DEG) 差异表达基因
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重金属胁迫下白骨壤数字基因表达谱分析 被引量：2
3
作者 袁长春 莫健新 +4 位作者 袁柳娇 余如凤 刘倩 钟军弟 刘锴栋 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2017年第2期206-213,共8页
[目的]从转录组水平研究重金属污水胁迫处理下白骨壤的基因表达变化,以揭示白骨壤响应重金属污染胁迫的机制。[方法]采用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术对重金属污水胁迫处理组和对照组白骨壤材料进行转录组测序分析。[结果]... [目的]从转录组水平研究重金属污水胁迫处理下白骨壤的基因表达变化,以揭示白骨壤响应重金属污染胁迫的机制。[方法]采用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术对重金属污水胁迫处理组和对照组白骨壤材料进行转录组测序分析。[结果]与对照组相比,重金属处理下白骨壤共有10 459个差异表达基因,其中,8 685个表达量上升,1 774个表达量下降。Me V聚类表明:大部分基因在重金属处理样本中的表达量受到极大的诱导。GO功能注释发现,差异表达基因主要定位于叶绿体以及细胞内各种膜结构,参与"细胞代谢"、"细胞组分的组合和生物合成"、"对刺激的响应"等过程。KEGG代谢通路分析显示,差异表达基因分布于126条Pathways,涉及"核糖体"、"光合作用"、"乙醛酸盐代谢"、"丙酮酸代谢"等途径。重金属胁迫还促进萜类、黄酮类化合物生物合成的关键酶基因(牻牛儿基焦磷酸合酶(0009238)、黄酮醇合成酶(0001833))的表达,进而促进白骨壤有效成分的积累;显著诱导细胞分裂素水解酶编码基因CKX7(0057124)、油菜素内脂信号转导组分基因BSK(0043741)等的表达,进而提高白骨壤对重金属胁迫的适应能力。此外,转录因子分析发现,b HLH、NAC、MYB-related和WRKY在重金属胁迫中发挥重要作用。实验选取8个与环境刺激响应密切相关的基因,通过qRT-PCR验证了它们在重金属污水胁迫处理下的表达差异,结果与数字基因表达谱分析的结果较一致,证实了差异表达基因数据的有效性。[结论]重金属处理影响了白骨壤大量的新陈代谢、光合作用、小分子酸合成、激素合成与信号转导及次生代谢产物合成相关基因的表达。 展开更多
关键词 白骨壤 重金属胁迫 数字基因表达谱(DEG) 差异表达基因 机制
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生活污水对白骨壤和红海榄叶片指标及结构的影响 被引量：1
4
作者 余如凤 邓妹 +2 位作者 陈文莲 袁柳娇 刘锴栋 《桉树科技》 2016年第3期36-40,共5页
为了探讨2种红树植物叶片对生活污水环境的适应性,采用石蜡切片法和显微拍照法观察了白骨壤和红海榄2种红树植物的叶片结构。结果表明:污染区的白骨壤叶片的上角质层厚度、表皮层厚度、上内皮层厚度等均比无污染区的白骨壤大,而污染区... 为了探讨2种红树植物叶片对生活污水环境的适应性,采用石蜡切片法和显微拍照法观察了白骨壤和红海榄2种红树植物的叶片结构。结果表明:污染区的白骨壤叶片的上角质层厚度、表皮层厚度、上内皮层厚度等均比无污染区的白骨壤大,而污染区的红海榄叶片则在下角质层厚度、上表皮层厚度、下内皮层厚度等指标上比污染区的红海榄显著增大,表明生活污水对红树植物的生长有一定的影响。 展开更多
关键词 生活污水 红树植物 生理指标 抗污染性
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生活污水对桐花树、秋茄叶片结构特征及生长的影响
5
作者 袁柳娇 戴连英 +2 位作者 余如凤 陈文莲 刘锴栋 《防护林科技》 2016年第11期4-7,共4页
对采自广东省湛江市霞山区观海长廊的无污染区和污染区桐花树与秋茄所生长的土壤进行分析检测,比较了污染区和无污染区土壤中养分及重金属的含量;对污染区和无污染区的桐花树和秋茄的叶片,采用光学显微镜观察,描述了生活污水对其叶片结... 对采自广东省湛江市霞山区观海长廊的无污染区和污染区桐花树与秋茄所生长的土壤进行分析检测,比较了污染区和无污染区土壤中养分及重金属的含量;对污染区和无污染区的桐花树和秋茄的叶片,采用光学显微镜观察,描述了生活污水对其叶片结构特征指标的影响。结果表明:污染区土壤的重金属含量比无污染区高,土壤的酸性也增强,污染区与无污染区相比,有效磷的含量最高;污染区植物叶片的叶表皮细胞变小,被拉成不规则的多边形,细胞内的单宁含量减少,且叶片干质量及面积都比无污染区的要小。由此可见,生活污水对红树植物的生长有一定的影响。 展开更多
关键词 生活污水 污染 叶片结构 生理指标
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