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基于超分辨成像增强对拟南芥内质网动态变化的研究
1
作者
张以恒
刘家正
+6 位作者
王雪晨
孙政哲
薛
雅
郡
汪沛
韩华
郑宏伟
李晓娟
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期67-76,共10页
【目的】为了解决在植物细胞内质网的研究中,成像速度与成像分辨率难以同时满足准确识别精细结构和动态变化的瓶颈问题。【方法】使用结构光照明显微成像技术,对拟南芥活体材料中的内质网进行超分辨实时成像,并优化了自监督去噪框架(Bli...
【目的】为了解决在植物细胞内质网的研究中,成像速度与成像分辨率难以同时满足准确识别精细结构和动态变化的瓶颈问题。【方法】使用结构光照明显微成像技术,对拟南芥活体材料中的内质网进行超分辨实时成像,并优化了自监督去噪框架(Blind2Unblind),以进一步提升快速显微成像的信噪比。【结果】建立了对时间序列成像中内质网结构进行定量分析的方法,并通过对环境胁迫下内质网结构动态变化的追踪进一步验证了方法的有效性。此外,各类参数的相关性分析显示管状内质网的面积和长度与生长端和三叉点的数量显著正相关,而内质网池和整体流的面积与管的面积和长度显著负相关。【结论】优化的自监督去噪框架提升了植物活细胞中结构光照明显微图像的信噪比,实现了管状内质网、内质网池、整体流、生长端和节点等复杂结构和动态的量化,各结构间存在复杂相关性。
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关键词
拟南芥
内质网
动态
超分辨率成像
成像增强
量化分析
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职称材料
题名
基于超分辨成像增强对拟南芥内质网动态变化的研究
1
作者
张以恒
刘家正
王雪晨
孙政哲
薛
雅
郡
汪沛
韩华
郑宏伟
李晓娟
机构
北京林业大学理学院林木资源高效生产全国重点实验室
北京林业大学生物科学与技术学院林木、花卉遗传育种教育部重点实验室
北京林业大学生物科学与技术学院林木育种与生态修复国家工程研究中心
中国科学院自动化研究所多模态人工智能系统全国重点实验室
中国科学院大学未来技术学院
脑认知功能图谱与类脑智能交叉研究平台
华中科技大学计算机科学与技术学院
中国科学院新疆生态与地理研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期67-76,共10页
基金
国家自然科学基金项目(91954202,31871349,32171461)
第三次新疆综合科考(2022xikk1200),SunTrust Banks 2030-大型项目(2021ZD0204500,2021ZD0204503)
北京林业大学科技创新计划项目(2019J003003)。
文摘
【目的】为了解决在植物细胞内质网的研究中,成像速度与成像分辨率难以同时满足准确识别精细结构和动态变化的瓶颈问题。【方法】使用结构光照明显微成像技术,对拟南芥活体材料中的内质网进行超分辨实时成像,并优化了自监督去噪框架(Blind2Unblind),以进一步提升快速显微成像的信噪比。【结果】建立了对时间序列成像中内质网结构进行定量分析的方法,并通过对环境胁迫下内质网结构动态变化的追踪进一步验证了方法的有效性。此外,各类参数的相关性分析显示管状内质网的面积和长度与生长端和三叉点的数量显著正相关,而内质网池和整体流的面积与管的面积和长度显著负相关。【结论】优化的自监督去噪框架提升了植物活细胞中结构光照明显微图像的信噪比,实现了管状内质网、内质网池、整体流、生长端和节点等复杂结构和动态的量化,各结构间存在复杂相关性。
关键词
拟南芥
内质网
动态
超分辨率成像
成像增强
量化分析
Keywords
Arabidopsis thaliana
endoplasmic reticulum
dynamics
super-resolution imaging
image enhancement
quantitative analysis
分类号
Q94-33 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于超分辨成像增强对拟南芥内质网动态变化的研究
张以恒
刘家正
王雪晨
孙政哲
薛
雅
郡
汪沛
韩华
郑宏伟
李晓娟
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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