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番茄不规则裂果性状的QTL定位及候选基因分析 被引量：5
1
作者 陈斌 吴震 +5 位作者 文军琴 林昊维 于璐 薛灵姿 周蓉 蒋芳玲 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期1329-1339,共11页
为挖掘调控番茄不规则裂果性状的关键基因,利用番茄易发生不规则裂果的种质‘S189’和耐裂果的种质‘R91’杂交获得F 1代,之后F_(1)自交构建F_(2)群体。以F_(2)群体中挑选出的20株易裂果单株和20株耐裂果单株的DNA分别等量混合,构成易... 为挖掘调控番茄不规则裂果性状的关键基因,利用番茄易发生不规则裂果的种质‘S189’和耐裂果的种质‘R91’杂交获得F 1代,之后F_(1)自交构建F_(2)群体。以F_(2)群体中挑选出的20株易裂果单株和20株耐裂果单株的DNA分别等量混合,构成易裂池和耐裂池,进行QTL-seq分析。共检测到2个调控番茄不规则裂果性状的QTL,分别位于2号染色体的38.75~42.14 Mb区域和5号染色体的49.07~49.48 Mb区域,暂命名为qCR2和qCR5。在qCR5的区域内仅检测到2个基因,利用2个亲本的红熟期果皮进行基因表达量分析,发现其差异均不显著。qCR2的区域较大,为快速有效地挖掘候选基因,利用43个多态性标记构建2号染色体标记连锁图,并结合F 2群体裂果率进行遗传连锁分析,在多态性标记sli2734和Bin3371之间检测到1个主效QTL,其LOD值为3.05,贡献率为7.05%,且其对应的物理位置与qCR2的区域相重合。联合QTL-seq分析和遗传连锁分析将候选区域缩小至39.55~39.94 Mb,记为qCR2.1。在qCR2.1的区域内共有53个基因,利用亲本红熟期果皮进行基因表达量分析,获得3个表达量差异显著的基因Solyc02g072400、Solyc02g072470和Solyc02g076780。其中Solyc02g076780表达量差异极显著,其与乙烯调控相关,推测其为控制番茄不规则裂果性状的关键候选基因。 展开更多
关键词 番茄 不规则裂果 QTL定位 候选基因
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外源CaCl_2缓解番茄裂果的生理机制 被引量：4
2
作者 崔守尧 吴震 +2 位作者 吕海萌 薛灵姿 蒋芳玲 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期59-65,共7页
[目的]本文旨在从生理水平探究外源CaCl_2缓解番茄裂果的机制,为裂果的防控提供理论依据。[方法]以耐裂和易裂果番茄为材料,喷施10 g·L^(-1)CaCl_2溶液,统计番茄裂果率,测定抗氧化酶活性变化、相关离子(Ca^(2+)、K^+、Mg^(2+)、B^(... [目的]本文旨在从生理水平探究外源CaCl_2缓解番茄裂果的机制,为裂果的防控提供理论依据。[方法]以耐裂和易裂果番茄为材料,喷施10 g·L^(-1)CaCl_2溶液,统计番茄裂果率,测定抗氧化酶活性变化、相关离子(Ca^(2+)、K^+、Mg^(2+)、B^(3+))含量、细胞壁主要成分含量(纤维素和果胶)、细胞壁关键水解酶(纤维素酶和多聚半乳糖醛酸酶)活性。[结果]10 g·L^(-1)CaCl_2处理可以显著降低易裂果番茄的裂果率,降低果皮中过氧化氢(H_2O_2)和丙二醛(MDA)含量及抗氧化酶活性,使易裂番茄电导率显著下降。10 g·L^(-1)CaCl_2处理下,番茄果皮Ca^(2+)、K^+、B^(3+)的含量显著升高,Mg^(2+)含量下降;果皮中纤维素酶和多聚半乳糖醛酸酶活性降低,细胞壁中纤维素和果胶的含量增加。[结论]喷施CaCl_2处理可以降低番茄果实的氧化胁迫伤害,稳定细胞膜结构,促进番茄对Ca^(2+)、K^+、B^(3+)离子的吸收,减少对Mg^(2+)的吸收,使Ca^(2+)、B^(3+)与细胞壁更易结合,从而增加细胞壁的强度,缓解裂果的发生。 展开更多
关键词 番茄 裂果 外源CaCl2 抗氧化系统 细胞壁 离子
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醋栗番茄LA2093渐渗系的构建及花序相关性状QTL分析 被引量：2
3
作者 周艳朝 蒋芳玲 +5 位作者 孙敏涛 刘帅 文军琴 李思琦 薛灵姿 吴震 《江西农业学报》 CAS 2019年第6期1-8,共8页
为了创制一批携带优良农艺性状的番茄种质资源新材料,以栽培番茄品种'Jina'(Solanum lycopersicum)为受体亲本,以野生醋栗番茄LA2093(S.pimpinellifolium)为供体亲本,利用杂交、3次回交和InDel、SSR分子标记辅助选择方法构建了... 为了创制一批携带优良农艺性状的番茄种质资源新材料,以栽培番茄品种'Jina'(Solanum lycopersicum)为受体亲本,以野生醋栗番茄LA2093(S.pimpinellifolium)为供体亲本,利用杂交、3次回交和InDel、SSR分子标记辅助选择方法构建了一套以栽培番茄'Jina'为遗传背景、含LA2093的基因的渐渗系。从BC1群体构建的遗传图谱中选择均匀分布于12条染色体的96对InDel、SSR分子标记追踪野生番茄的渗入片段,在BC3代共留选渐渗系材料51份,其中单片段材料14份、双片段材料27份、三片段材料10份;共得到渗入片段98个,平均单个渗入片段长度为35.69cM;51份渐渗系平均渗入供体基因片段占受体基因组的比例为5.6%,完全覆盖12条染色体。利用BC3F1群体检测到与首花序节位、花序间隔节位、单花序花数3个农艺性状相关的6个QTL位点,单个位点的贡献率为4.33%~47.93%。 展开更多
关键词 醋栗番茄 渐渗系 花序 QTL
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桃GRF基因家族的序列及其组织特异性表达分析 被引量：11
4
作者 曹珂 薛灵姿 +5 位作者 王蛟 方伟超 朱更瑞 陈昌文 王新卫 王力荣 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期578-586,共9页
转录因子家族基因GRF(growth-regulating factor)是植物中特有的一类生长调控因子基因,在水稻和拟南芥中,GRF家族基因编码的蛋白质具有正向调控茎和叶生长发育的功能。为了探究在桃中GRF基因是否参与了狭叶桃"金蜜狭叶"的叶... 转录因子家族基因GRF(growth-regulating factor)是植物中特有的一类生长调控因子基因,在水稻和拟南芥中,GRF家族基因编码的蛋白质具有正向调控茎和叶生长发育的功能。为了探究在桃中GRF基因是否参与了狭叶桃"金蜜狭叶"的叶片发育,本试验首先分析桃基因组中鉴定出的GRF基因的序列信息;然后,以正常叶片的"上海水蜜"桃为对照,通过荧光定量PCR检测了这些GRF基因在"金蜜狭叶"桃的组织特异性表达情况;最后,利用126对简单序列重复标记对1个F2杂交群体进行连锁分析,定位狭叶性状,辅助筛选狭叶性状的候选基因。结果表明:桃基因组GRF基因包括10个成员,分布在除4和8外的其他染色体上,编码蛋白的氨基酸长度在191~612之间。蛋白序列分析表明,除ppa011917m的QLQ结构域中的Leu残基被Phe代替外,这10个GRF的N端均含保守的QLQ和WRC结构域。系统进化树将桃上的10个GRF基因分为3组。从10个GRF基因的表达结果可以看出,6个基因在茎尖的表达量高于幼叶,也高于其他成熟组织和器官;其中2个基因在狭叶桃中的表达显著高于正常叶对照。通过连锁分析将"金蜜狭叶"桃的狭叶性状定位在第6染色体的15.7~21.1 Mb之间,该区间仅含有1个GRF基因ppa003017m,是狭叶性状的候选基因。本研究将为"金蜜狭叶"桃狭叶性状基因的鉴定和高光效种质筛选奠定研究基础。 展开更多
关键词 桃 反转录 GRF基因 狭叶 荧光定量
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