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奥利万星中间体A82846B产生菌拟孢囊菌CCTCC M2020063全基因组序列分析与mbtH类基因的验证
被引量：
1
1
作者
程雯
蒲
桂
洪
+1 位作者
牛国清
邹祥
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3977-3990,共14页
【目的】分析荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063中A82846B合成的代谢途径和关键基因。【方法】使用Illumina二代测序和PacBio三代测序技术对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行全基因组测序,利用Glimmer预测编码序列,使用HPLC和LCMS鉴定次级代谢...
【目的】分析荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063中A82846B合成的代谢途径和关键基因。【方法】使用Illumina二代测序和PacBio三代测序技术对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行全基因组测序,利用Glimmer预测编码序列,使用HPLC和LCMS鉴定次级代谢产物,使用antiSMASH 5.0软件预测次级代谢产物合成基因簇。利用Geneious软件对A82846B合成相关基因进行分析,对其中的mbtH类基因着重分析。【结果】本实验菌株鉴定为荒漠拟孢囊菌(Kibdelosporangium aridum),基因组中有一条线性染色体,无质粒,序列全长12475688 bp,GC含量为66.27%,有11900个开放阅读框,共有47个基因簇。该菌株具有合成A82846B的能力,且生物合成相关基因位于Cluster32,包含33个基因,mbtH类基因gene07864的过表达促进A82846的合成,提升了26.42%,卤化酶基因为gene07859,与万古霉素、巴利霉素的卤化酶相似度较高。【结论】本研究对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行了基因组序列分析,获得了A82846B生物合成相关的功能基因信息,为A82846B的代谢途径和工程改造提供了强有力的基础。
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关键词
荒漠拟孢囊菌
奥利万星
A82846B
全基因组组装
mbtH类基因
卤化酶基因
原文传递
糖肽类抗生素奥利万星及其中间体生物合成研究进展
2
作者
蒲
桂
洪
程雯
邹祥
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
2020年第8期738-744,共7页
随着抗生素耐药菌出现,新型抗生素的需求日益增加。奥利万星是近年来新上市的新型半合成糖肽类抗生素,用于敏感革兰阳性菌,包括(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)导致的急性细菌性皮肤和皮肤结构感染(ABSSSIs)的治疗...
随着抗生素耐药菌出现,新型抗生素的需求日益增加。奥利万星是近年来新上市的新型半合成糖肽类抗生素,用于敏感革兰阳性菌,包括(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)导致的急性细菌性皮肤和皮肤结构感染(ABSSSIs)的治疗,其优点为对耐药菌有效、半衰期长、给药方便等。本文主要对奥利万星的抗菌活性,奥利万星中间体的生物合成途径、化学结构、菌株选育等最新研究进展进行综述,为高产菌株的基因工程改造及产品开发提供指导。
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关键词
奥利万星
作用机制
生物合成
中间体
菌种选育
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职称材料
题名
奥利万星中间体A82846B产生菌拟孢囊菌CCTCC M2020063全基因组序列分析与mbtH类基因的验证
被引量：
1
1
作者
程雯
蒲
桂
洪
牛国清
邹祥
机构
西南大学药学院
西南大学生物技术中心
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期3977-3990,共14页
文摘
【目的】分析荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063中A82846B合成的代谢途径和关键基因。【方法】使用Illumina二代测序和PacBio三代测序技术对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行全基因组测序,利用Glimmer预测编码序列,使用HPLC和LCMS鉴定次级代谢产物,使用antiSMASH 5.0软件预测次级代谢产物合成基因簇。利用Geneious软件对A82846B合成相关基因进行分析,对其中的mbtH类基因着重分析。【结果】本实验菌株鉴定为荒漠拟孢囊菌(Kibdelosporangium aridum),基因组中有一条线性染色体,无质粒,序列全长12475688 bp,GC含量为66.27%,有11900个开放阅读框,共有47个基因簇。该菌株具有合成A82846B的能力,且生物合成相关基因位于Cluster32,包含33个基因,mbtH类基因gene07864的过表达促进A82846的合成,提升了26.42%,卤化酶基因为gene07859,与万古霉素、巴利霉素的卤化酶相似度较高。【结论】本研究对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行了基因组序列分析,获得了A82846B生物合成相关的功能基因信息,为A82846B的代谢途径和工程改造提供了强有力的基础。
关键词
荒漠拟孢囊菌
奥利万星
A82846B
全基因组组装
mbtH类基因
卤化酶基因
Keywords
Kibdelosporangium aridum
oritavancin
A82846B
whole genome assembly
mbtH-like gene
halogenase gene
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
糖肽类抗生素奥利万星及其中间体生物合成研究进展
2
作者
蒲
桂
洪
程雯
邹祥
机构
西南大学药学院
出处
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
2020年第8期738-744,共7页
文摘
随着抗生素耐药菌出现,新型抗生素的需求日益增加。奥利万星是近年来新上市的新型半合成糖肽类抗生素,用于敏感革兰阳性菌,包括(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)导致的急性细菌性皮肤和皮肤结构感染(ABSSSIs)的治疗,其优点为对耐药菌有效、半衰期长、给药方便等。本文主要对奥利万星的抗菌活性,奥利万星中间体的生物合成途径、化学结构、菌株选育等最新研究进展进行综述,为高产菌株的基因工程改造及产品开发提供指导。
关键词
奥利万星
作用机制
生物合成
中间体
菌种选育
Keywords
Oritavancin
Mechanism
Biosynthesis
Intermediates
Strain screening
分类号
R978.1 [医药卫生—药品]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
奥利万星中间体A82846B产生菌拟孢囊菌CCTCC M2020063全基因组序列分析与mbtH类基因的验证
程雯
蒲
桂
洪
牛国清
邹祥
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
原文传递
2
糖肽类抗生素奥利万星及其中间体生物合成研究进展
蒲
桂
洪
程雯
邹祥
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
2020
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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