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人顶体酶三维结构的同源模建及其与KF950的分子对接研究
被引量：
8
1
作者
吕加国
盛春泉
+5 位作者
张珉
季海涛
张万年
周有骏
朱驹
蒋
俊
航
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期1073-1078,共6页
采用同源模建方法首次构建了人顶体酶的三维结构模型,模型的可靠性经Ramachandran图和Profile_3D图验证.采用InsightII/Bindingsite方法准确定位了人顶体酶的活性位点,并研究了顶体酶重要功能残基在活性位点的立体分布.在此基础上,通过...
采用同源模建方法首次构建了人顶体酶的三维结构模型,模型的可靠性经Ramachandran图和Profile_3D图验证.采用InsightII/Bindingsite方法准确定位了人顶体酶的活性位点,并研究了顶体酶重要功能残基在活性位点的立体分布.在此基础上,通过柔性分子对接方法首次阐明了顶体酶高效抑制剂KF950与靶酶活性位点的相互作用模式,发现特异性的氢键相互作用是KF950产生高抑制活性的重要分子基础.其研究结果将为合理设计新型顶体酶抑制剂,寻找男性口服避孕药奠定坚实基础.
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关键词
人顶体酶
同源模建
活性位点
4-胍基苯甲酸(4-甲氧甲酰基)苯酯甲烷磺酸盐
分子对接
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职称材料
Bcl-2蛋白抑制剂结合腔的性质分析
2
作者
郑灿辉
周有骏
+7 位作者
朱驹
陈军
李耀武
盛春泉
宋云龙
吕加国
蒋
俊
航
刘娜
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期591-595,共5页
采用多重拷贝同时搜寻(MCSS)等方法对Bcl-2蛋白抑制剂结合腔进行分析.结果显示,结合腔可分成P1,L1,P2,P3和P4等5个区域,其底部呈疏水性,而P3部位不适合芳香性大基团的结合.结合腔侧面和边缘处分布有可与配体形成除疏水以外作用的多个重...
采用多重拷贝同时搜寻(MCSS)等方法对Bcl-2蛋白抑制剂结合腔进行分析.结果显示,结合腔可分成P1,L1,P2,P3和P4等5个区域,其底部呈疏水性,而P3部位不适合芳香性大基团的结合.结合腔侧面和边缘处分布有可与配体形成除疏水以外作用的多个重要残基.MCSS计算得到的各种性质官能团在结合腔内的能量优势位置和取向能与已知结合模式的高活性抑制剂的重要基团位置吻合得较好.
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关键词
BCL-2蛋白
多重拷贝同时搜寻
抑制剂
合理设计
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职称材料
题名
人顶体酶三维结构的同源模建及其与KF950的分子对接研究
被引量：
8
1
作者
吕加国
盛春泉
张珉
季海涛
张万年
周有骏
朱驹
蒋
俊
航
机构
第二军医大学药学院
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期1073-1078,共6页
基金
上海市计生委局管科技发展基金(No.05JG05011)资助项目.
文摘
采用同源模建方法首次构建了人顶体酶的三维结构模型,模型的可靠性经Ramachandran图和Profile_3D图验证.采用InsightII/Bindingsite方法准确定位了人顶体酶的活性位点,并研究了顶体酶重要功能残基在活性位点的立体分布.在此基础上,通过柔性分子对接方法首次阐明了顶体酶高效抑制剂KF950与靶酶活性位点的相互作用模式,发现特异性的氢键相互作用是KF950产生高抑制活性的重要分子基础.其研究结果将为合理设计新型顶体酶抑制剂,寻找男性口服避孕药奠定坚实基础.
关键词
人顶体酶
同源模建
活性位点
4-胍基苯甲酸(4-甲氧甲酰基)苯酯甲烷磺酸盐
分子对接
Keywords
human acrosin
homology modeling
active site
4-guanidinozoic acid （4-methoxycarbonyl）-phenyl ester monomesylate
molecular docking
分类号
Q814 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
Bcl-2蛋白抑制剂结合腔的性质分析
2
作者
郑灿辉
周有骏
朱驹
陈军
李耀武
盛春泉
宋云龙
吕加国
蒋
俊
航
刘娜
机构
第二军医大学药学院药物化学教研室
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期591-595,共5页
基金
第二军医大学博士创新基金(2005年度)
上海市重点学科建设项目(批准号:B906)资助
文摘
采用多重拷贝同时搜寻(MCSS)等方法对Bcl-2蛋白抑制剂结合腔进行分析.结果显示,结合腔可分成P1,L1,P2,P3和P4等5个区域,其底部呈疏水性,而P3部位不适合芳香性大基团的结合.结合腔侧面和边缘处分布有可与配体形成除疏水以外作用的多个重要残基.MCSS计算得到的各种性质官能团在结合腔内的能量优势位置和取向能与已知结合模式的高活性抑制剂的重要基团位置吻合得较好.
关键词
BCL-2蛋白
多重拷贝同时搜寻
抑制剂
合理设计
Keywords
Bcl-2 protein
Multiple copy simultaneous search
Inhibitor
Rational design
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人顶体酶三维结构的同源模建及其与KF950的分子对接研究
吕加国
盛春泉
张珉
季海涛
张万年
周有骏
朱驹
蒋
俊
航
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006
8
下载PDF
职称材料
2
Bcl-2蛋白抑制剂结合腔的性质分析
郑灿辉
周有骏
朱驹
陈军
李耀武
盛春泉
宋云龙
吕加国
蒋
俊
航
刘娜
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
0
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职称材料
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