为揭示也迷离鸡线粒体全基因组特征,并探讨也迷离鸡起源驯化,研究利用Illu‐mina Nova Seq 6000二代测序技术,获得完整的也迷离鸡全基因组测序信息,将原始数据进行质控过滤,并经MitoZ v3.4软件组装注释成完整的线粒体基因组。从EBI数据...为揭示也迷离鸡线粒体全基因组特征,并探讨也迷离鸡起源驯化,研究利用Illu‐mina Nova Seq 6000二代测序技术,获得完整的也迷离鸡全基因组测序信息,将原始数据进行质控过滤,并经MitoZ v3.4软件组装注释成完整的线粒体基因组。从EBI数据库下载37个国内外不同品种鸡及鹌鹑的线粒体全基因组DNA序列,基于Mega-X软件邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建系统发育树。结果显示:也迷离鸡线粒体基因组全序列长度为16790 bp,包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个非编码控制区(D-loop区)。线粒体基因组中核苷酸比例为T(23.70%)、C(32.50%)、A(30.30%)、G(13.50%),AT-skew>0,GC-skew<0。系统发育分析显示,也迷离鸡与红原鸡及来航鸡的亲缘关系较近。结果表明,也迷离鸡在驯化过程中可能导入原鸡血液,存在来航鸡等商业鸡的基因渗入。展开更多
