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东海近岸带鱼(Trichiurus japonicus)线粒体控制区序列的群体遗传变异研究
被引量:
5
1
作者
吴仁协
张浩冉
+2 位作者
牛素芳
苗
奔
奔
翟云
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期1318-1327,共10页
带鱼(Trichiurusjaponicus)是广泛分布于东亚大陆架海域的暖温性近底层经济鱼类,也是东海区最重要的海洋渔业捕捞对象。然而,目前的研究报道对东海近岸带鱼群体遗传变异特性认识不足,不利于其种群的遗传资源保护和管理。本研究利用线粒...
带鱼(Trichiurusjaponicus)是广泛分布于东亚大陆架海域的暖温性近底层经济鱼类,也是东海区最重要的海洋渔业捕捞对象。然而,目前的研究报道对东海近岸带鱼群体遗传变异特性认识不足,不利于其种群的遗传资源保护和管理。本研究利用线粒体控制区序列对东海近岸带鱼6个群体191个个体的遗传多样性、遗传分化和历史动态进行分析。在577 bp长的控制区序列中共检测到70个多态位点,定义了121个单倍型。群体总的单倍型多样性较高(0.9911),但总的核苷酸多样性较低(0.0092),群体间遗传多样性水平差异较小。单倍型遗传学关系、Fst值和分子方差分析结果均表明群体间的遗传分化不显著,存在广泛的基因交流。历史动态分析结果表明东海近岸带鱼群体在更新世中晚期可能经历了瓶颈效应和随后的群体快速扩张,这是导致群体遗传多样性较低的主要原因。带鱼较强的扩散能力、洄游行为、海洋环流以及近期的群体扩张可能是造成东海近岸带鱼缺乏显著的系统地理种群结构的原因。研究结果提示,在线粒体DNA水平上,东海近岸带鱼群体是一个随机交配的种群,在遗传资源管理上可作为一个单元进行管理。
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关键词
带鱼
东海近岸
线粒体控制区
遗传变异
历史动态
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职称材料
石斑鱼转录因子NR1D1和NR1D2在冷胁迫中的调控作用
2
作者
苗
奔
奔
林楚
+4 位作者
曹文科
梁燕珊
吴仁协
牛素芳
梁镇邦
《应用海洋学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期147-159,共13页
NR1D1和NR1D2转录因子属于核受体转录因子家族,二者通过调控靶基因表达参与众多生物学过程,尤其在昼夜节律调节中发挥重要作用。本研究通过分析NR1D1和NR1D2的蛋白质分子特征以及在冷胁迫下珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus♀&...
NR1D1和NR1D2转录因子属于核受体转录因子家族,二者通过调控靶基因表达参与众多生物学过程,尤其在昼夜节律调节中发挥重要作用。本研究通过分析NR1D1和NR1D2的蛋白质分子特征以及在冷胁迫下珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus♀×Epinephelus lanceolatus♂)的基因调控关系以及它们所参与的通路,揭示它们在鱼类低温环境中的功能作用。生物信息学比较分析显示NR1D1和NR1D2基因序列均有23个开放阅读框,编码的蛋白质均属于不稳定的亲水性蛋白质。NR1D1和NR1D2蛋白质均含有ZF-C4类锌脂蛋白结构域和Hormone_Recep核激素受体的配体结合域,主要配体为含铁原卟啉IX。这两种蛋白主要在细胞核中发挥调控基因表达的作用,且与昼夜节律通路的多个关键基因有直接作用关系。结果表明,在冷胁迫下NR1D1和NR1D2作为转录因子可通过调控靶基因的表达,参与昼夜节律调节并促进糖脂代谢、线粒体氧化等过程,为珍珠龙胆石斑鱼提供必要的能量,有助于增强其耐寒性。
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关键词
海洋生物学
珍珠龙胆石斑鱼
冷胁迫
核受体转录因子家族
昼夜节律调节
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职称材料
题名
东海近岸带鱼(Trichiurus japonicus)线粒体控制区序列的群体遗传变异研究
被引量:
5
1
作者
吴仁协
张浩冉
牛素芳
苗
奔
奔
翟云
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期1318-1327,共10页
基金
国家自然科学基金项目,31372532号
广东省科技计划资助项目,2017A030303077号
文摘
带鱼(Trichiurusjaponicus)是广泛分布于东亚大陆架海域的暖温性近底层经济鱼类,也是东海区最重要的海洋渔业捕捞对象。然而,目前的研究报道对东海近岸带鱼群体遗传变异特性认识不足,不利于其种群的遗传资源保护和管理。本研究利用线粒体控制区序列对东海近岸带鱼6个群体191个个体的遗传多样性、遗传分化和历史动态进行分析。在577 bp长的控制区序列中共检测到70个多态位点,定义了121个单倍型。群体总的单倍型多样性较高(0.9911),但总的核苷酸多样性较低(0.0092),群体间遗传多样性水平差异较小。单倍型遗传学关系、Fst值和分子方差分析结果均表明群体间的遗传分化不显著,存在广泛的基因交流。历史动态分析结果表明东海近岸带鱼群体在更新世中晚期可能经历了瓶颈效应和随后的群体快速扩张,这是导致群体遗传多样性较低的主要原因。带鱼较强的扩散能力、洄游行为、海洋环流以及近期的群体扩张可能是造成东海近岸带鱼缺乏显著的系统地理种群结构的原因。研究结果提示,在线粒体DNA水平上,东海近岸带鱼群体是一个随机交配的种群,在遗传资源管理上可作为一个单元进行管理。
关键词
带鱼
东海近岸
线粒体控制区
遗传变异
历史动态
Keywords
Trichiurus japonicus
nearshore of the East China Sea
mitochondrial control region sequence
genetic variation
historical demography
分类号
Q953 [生物学—动物学]
S931 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
石斑鱼转录因子NR1D1和NR1D2在冷胁迫中的调控作用
2
作者
苗
奔
奔
林楚
曹文科
梁燕珊
吴仁协
牛素芳
梁镇邦
机构
广东海洋大学水产学院
南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江)
出处
《应用海洋学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期147-159,共13页
基金
南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江)项目(ZJW-2019-06)。
文摘
NR1D1和NR1D2转录因子属于核受体转录因子家族,二者通过调控靶基因表达参与众多生物学过程,尤其在昼夜节律调节中发挥重要作用。本研究通过分析NR1D1和NR1D2的蛋白质分子特征以及在冷胁迫下珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus♀×Epinephelus lanceolatus♂)的基因调控关系以及它们所参与的通路,揭示它们在鱼类低温环境中的功能作用。生物信息学比较分析显示NR1D1和NR1D2基因序列均有23个开放阅读框,编码的蛋白质均属于不稳定的亲水性蛋白质。NR1D1和NR1D2蛋白质均含有ZF-C4类锌脂蛋白结构域和Hormone_Recep核激素受体的配体结合域,主要配体为含铁原卟啉IX。这两种蛋白主要在细胞核中发挥调控基因表达的作用,且与昼夜节律通路的多个关键基因有直接作用关系。结果表明,在冷胁迫下NR1D1和NR1D2作为转录因子可通过调控靶基因的表达,参与昼夜节律调节并促进糖脂代谢、线粒体氧化等过程,为珍珠龙胆石斑鱼提供必要的能量,有助于增强其耐寒性。
关键词
海洋生物学
珍珠龙胆石斑鱼
冷胁迫
核受体转录因子家族
昼夜节律调节
Keywords
marine biology
pearl gentian grouper
cold stress
nuclear receptor transcription factor family
circadian rhythm regulation
分类号
P735 [天文地球—海洋生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东海近岸带鱼(Trichiurus japonicus)线粒体控制区序列的群体遗传变异研究
吴仁协
张浩冉
牛素芳
苗
奔
奔
翟云
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
下载PDF
职称材料
2
石斑鱼转录因子NR1D1和NR1D2在冷胁迫中的调控作用
苗
奔
奔
林楚
曹文科
梁燕珊
吴仁协
牛素芳
梁镇邦
《应用海洋学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
已选择
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