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基于单链DNA开关调控的多功能生物电路（英文）
1
作者
胡
亚赛
郜艳敏
+1 位作者
郝敏
齐浩
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1135-1144,共10页
合成生物电路在生物传感及生物计算方面成为了广泛应用的工具。工程化生物电路系统具有良好的灵活性,同时也具备模块化的特征。在本文中,研究了基于单链DNA开关调控的多功能生物电路的构建方法。通过将计算机辅助设计的单链DNA开关作为...
合成生物电路在生物传感及生物计算方面成为了广泛应用的工具。工程化生物电路系统具有良好的灵活性,同时也具备模块化的特征。在本文中,研究了基于单链DNA开关调控的多功能生物电路的构建方法。通过将计算机辅助设计的单链DNA开关作为核心控制元件,并利用长度为20 bp的toehold区域来激活单链DNA开关,驱动了简单的单向式、循环式以及级联的多层次的生物电路系统。在级联式电路系统中,通过调整单链DNA开关的结构,使信噪比从2.996变成5.274。同时,单链DNA开关作为长单链DNA(784 bp)的一部分,在无细胞蛋白质系统中实现了基因表达调控。因此,本文研究的工程化方法为今后复杂的人工生物电路的构建提供了坚实的技术基础。
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关键词
单链DNA开关
生物电路
级联
体外基因表达
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职称材料
额外的错配碱基提高T4 DNA连接酶等位特异性连接（英文）
被引量：
1
2
作者
李书亚
郜艳敏
+2 位作者
胡
亚赛
郝敏
齐浩
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期854-860,共7页
连接是一种主要的DNA处理过程。由于较低的商业成本以及核酸底物识别的灵活性,T4DNA连接酶被广泛应用于生物分子工程,特别是特定核酸序列的等位特异性连接检测。本文评估了在T4 DNA连接酶介导的连接反应中,引入额外的错配碱基对所产生...
连接是一种主要的DNA处理过程。由于较低的商业成本以及核酸底物识别的灵活性,T4DNA连接酶被广泛应用于生物分子工程,特别是特定核酸序列的等位特异性连接检测。本文评估了在T4 DNA连接酶介导的连接反应中,引入额外的错配碱基对所产生的影响。设计了超过150组DNA/DNA或DNA/RNA带有的额外错配碱基对的组合。结果发现,引入额外的错配碱基对后,T4 DNA连接酶在DNA/DNA连接中特异性可提高60倍以上,而在DNA/RNA连接中特异性只能提高2倍。在等位特异性连接中,有的错配碱基对可使T4 DNA连接酶的特异性提高600多倍。
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关键词
等位特异性连接
错配
T4
DNA连接酶
锁式探针
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职称材料
题名
基于单链DNA开关调控的多功能生物电路（英文）
1
作者
胡
亚赛
郜艳敏
郝敏
齐浩
机构
天津大学化工学院系统生物工程教育部重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期1135-1144,共10页
基金
Supported by National Natural Science Foundation of China(No.21476167 and No.21778039)~~
文摘
合成生物电路在生物传感及生物计算方面成为了广泛应用的工具。工程化生物电路系统具有良好的灵活性,同时也具备模块化的特征。在本文中,研究了基于单链DNA开关调控的多功能生物电路的构建方法。通过将计算机辅助设计的单链DNA开关作为核心控制元件,并利用长度为20 bp的toehold区域来激活单链DNA开关,驱动了简单的单向式、循环式以及级联的多层次的生物电路系统。在级联式电路系统中,通过调整单链DNA开关的结构,使信噪比从2.996变成5.274。同时,单链DNA开关作为长单链DNA(784 bp)的一部分,在无细胞蛋白质系统中实现了基因表达调控。因此,本文研究的工程化方法为今后复杂的人工生物电路的构建提供了坚实的技术基础。
关键词
单链DNA开关
生物电路
级联
体外基因表达
Keywords
single-stranded DNA toehold switch(SSS)
biological circuits
cascade
in vitro gene expression
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
下载PDF
职称材料
题名
额外的错配碱基提高T4 DNA连接酶等位特异性连接（英文）
被引量：
1
2
作者
李书亚
郜艳敏
胡
亚赛
郝敏
齐浩
机构
天津大学化工学院
系统生物工程教育部重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期854-860,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.21476167和No.21778039)资助
文摘
连接是一种主要的DNA处理过程。由于较低的商业成本以及核酸底物识别的灵活性,T4DNA连接酶被广泛应用于生物分子工程,特别是特定核酸序列的等位特异性连接检测。本文评估了在T4 DNA连接酶介导的连接反应中,引入额外的错配碱基对所产生的影响。设计了超过150组DNA/DNA或DNA/RNA带有的额外错配碱基对的组合。结果发现,引入额外的错配碱基对后,T4 DNA连接酶在DNA/DNA连接中特异性可提高60倍以上,而在DNA/RNA连接中特异性只能提高2倍。在等位特异性连接中,有的错配碱基对可使T4 DNA连接酶的特异性提高600多倍。
关键词
等位特异性连接
错配
T4
DNA连接酶
锁式探针
Keywords
allele-specific DNA ligation
mismatch
T4 DNA ligase
padlock probe
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于单链DNA开关调控的多功能生物电路（英文）
胡
亚赛
郜艳敏
郝敏
齐浩
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
下载PDF
职称材料
2
额外的错配碱基提高T4 DNA连接酶等位特异性连接（英文）
李书亚
郜艳敏
胡
亚赛
郝敏
齐浩
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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职称材料
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