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大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子Ⅰ遗传多态性分析
被引量:
11
1
作者
薛良义
李婷
+3 位作者
孙升
肖
章
奎
沈秋静
童丽娟
《水产科学》
CAS
北大核心
2008年第10期503-506,共4页
肌肉生长抑制素是控制骨骼肌生长发育的重要细胞因子,采用PCR-SSCP和测序方法分析了大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子I的单核苷酸多态性,结果发现,外显子I有7个多态性位点,分别是270(G→A)、196(C→T)、349(A→T)、51(T→C)、352(G→A)、...
肌肉生长抑制素是控制骨骼肌生长发育的重要细胞因子,采用PCR-SSCP和测序方法分析了大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子I的单核苷酸多态性,结果发现,外显子I有7个多态性位点,分别是270(G→A)、196(C→T)、349(A→T)、51(T→C)、352(G→A)、348(C→T)和264(G→T),但只有349位点和352位点的碱基突变造成错义突变,氨基酸变化分别为T→S和E→K,其他位点均属同义突变。存在7种基因型,它们的频率分别为0.2708、0.0833、0.3333、0.0208、0.1667、0.1047和0.0208,该基因位点的杂合度为0.709。统计分析表明,外显子I无论是基因型水平上的多态性还是氨基酸水平上的突变均与体长和体质量呈显著性相关(P<0.05),但与肌肉脂肪含量无显著相关(P>0.05)。
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关键词
大黄鱼
肌肉生长抑制素基因
单链构象多态性
生长发育性状
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职称材料
眼斑拟石首鱼肌肉生长抑制素基因克隆及组织表达分析
被引量:
7
2
作者
薛良义
李婷
+1 位作者
杨巧一
肖
章
奎
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期95-101,共7页
肌肉生长抑制素(MSTN)基因对肌肉生长起负调控作用,在动物育种上具有潜在的应用前景。报道了眼斑拟石首鱼(Sciaenops ocellatus)的MSTN基因的序列结构特征及其组织特异性表达。MSTN基因具有3个外显子和2个内含子,编码376个氨基酸。...
肌肉生长抑制素(MSTN)基因对肌肉生长起负调控作用,在动物育种上具有潜在的应用前景。报道了眼斑拟石首鱼(Sciaenops ocellatus)的MSTN基因的序列结构特征及其组织特异性表达。MSTN基因具有3个外显子和2个内含子,编码376个氨基酸。在内含子Ⅰ和3′-UTR区内,分别发现了(TC)4CC(TC)4CT(TC)4和(AC)7微卫星序列。推断的眼斑拟石首鱼的MSTN氨基酸序列具很强的保守性,与石鼓鱼、金鲷、条纹石鮨、白鲈、金眼石鮨之间的相似性在90%以上。在结构上,眼斑拟石首鱼的MSTN包含N端信号序列(1~22氨基酸残基),TGF-β前肽域(41~256氨基酸残基),RXXR蛋白水解位点(264~267位的RARR)和TGF-β区域(282~376氨基酸残基)。在检测的10种组织中,MSTN只在眼斑拟石首鱼的肌肉、脑和眼组织中表达,其中在肌肉表达最强。
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关键词
眼斑拟石首鱼
肌肉生长抑制素基因
克隆
组织表达
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职称材料
大黄鱼肌肉生长抑制素基因微卫星序列多态性分析
被引量:
9
3
作者
薛良义
孙升
+3 位作者
肖
章
奎
杨巧一
叶放
童丽娟
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期980-985,共6页
肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)参与肌肉生长和脂肪发生的调节.本研究在克隆大黄鱼MSTN cDNA的基础上,对3′端非编码区微卫星序列的多态性及其与体长、体重和肌肉脂肪含量的关系进行了分析.结果表明,获得的cDNA长1886bp,在3′...
肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)参与肌肉生长和脂肪发生的调节.本研究在克隆大黄鱼MSTN cDNA的基础上,对3′端非编码区微卫星序列的多态性及其与体长、体重和肌肉脂肪含量的关系进行了分析.结果表明,获得的cDNA长1886bp,在3′端非编码区存在微卫星序列(CA)n.在受检的52个个体中,微卫星序列长度在64~126bp之间.大部分个体的微卫星序列内存在碱基替换,最常见的碱基替换形式是C→T,属于非完美型微卫星序列.根据该位点微卫星序列长度,在实验群体中共检测到23个等位基因,其中频率为0.0192的等位基因11个,0.0385的5个,0.0769的3个,0.0577的2个,0.1154和0.1346的各1个.该基因位点的群体杂合度为0.9327,多态信息含量为0.9288.微卫星序列长度与大黄鱼体长、体重和肌肉脂肪含量之间的相关系数分别为0.409、0.435和-0.026,P值分别为0.021、0.016和0.878.碱基替换对大黄鱼生长及肌肉脂肪含量均无显著影响.
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关键词
大黄鱼
肌肉生长抑制素基因
微卫星
多态性
生长
肌肉脂肪含量
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职称材料
ncRNA研究技术进展
被引量:
1
4
作者
肖
章
奎
薛良义
《生命科学》
CSCD
2007年第2期122-126,共5页
ncRNA通过多种机制调控着基因的表达,生物信息学、基因组SELEX技术及微阵列分析等方法在ncRNA的研究中发挥了重要作用,导致在最近5年发现了大量的新ncRNA,本文就研究ncRNA的各种方法作一简要介绍。
关键词
NCRNA
生物信息学
生物芯片
基因组SELEX
质谱法
RNA组学
RNA鉴定
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职称材料
紫竹梅花雄蕊毛细胞的胞质流动和胞质骨架
5
作者
李明义
王庆平
+1 位作者
肖
章
奎
于蕾
《湖北大学学报(自然科学版)》
CAS
1997年第4期384-387,共4页
将Olympus相差显微镜活体观察与电镜活体固定、包埋、切片观察相结合发现,紫竹梅花雄蕊毛细胞中存在一条宽大的或者多条较细的胞质束,胞质束内的胞质集体涌动,线粒体和胞质颗粒缓慢移动.胞质束是一种均一、稠密的基质,电子...
将Olympus相差显微镜活体观察与电镜活体固定、包埋、切片观察相结合发现,紫竹梅花雄蕊毛细胞中存在一条宽大的或者多条较细的胞质束,胞质束内的胞质集体涌动,线粒体和胞质颗粒缓慢移动.胞质束是一种均一、稠密的基质,电子密度显著高于细胞质基质,且有单层膜包被,颗粒和线粒体附着在胞质束膜的外表面上.
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关键词
紫竹梅
胞质流动
胞质有架
花雄蕊毛细胞
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职称材料
题名
大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子Ⅰ遗传多态性分析
被引量:
11
1
作者
薛良义
李婷
孙升
肖
章
奎
沈秋静
童丽娟
机构
宁波大学生命科学与生物工程学院
出处
《水产科学》
CAS
北大核心
2008年第10期503-506,共4页
基金
国家高技术研究发展计划项目(No.2006AA10A405)
浙江省自然科学基金资助项目(No.Y306295)
+1 种基金
宁波市自然科学基金资助项目(No.2006A610083)
宁波大学科研基金资助项目(No.XK0613041)
文摘
肌肉生长抑制素是控制骨骼肌生长发育的重要细胞因子,采用PCR-SSCP和测序方法分析了大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子I的单核苷酸多态性,结果发现,外显子I有7个多态性位点,分别是270(G→A)、196(C→T)、349(A→T)、51(T→C)、352(G→A)、348(C→T)和264(G→T),但只有349位点和352位点的碱基突变造成错义突变,氨基酸变化分别为T→S和E→K,其他位点均属同义突变。存在7种基因型,它们的频率分别为0.2708、0.0833、0.3333、0.0208、0.1667、0.1047和0.0208,该基因位点的杂合度为0.709。统计分析表明,外显子I无论是基因型水平上的多态性还是氨基酸水平上的突变均与体长和体质量呈显著性相关(P<0.05),但与肌肉脂肪含量无显著相关(P>0.05)。
关键词
大黄鱼
肌肉生长抑制素基因
单链构象多态性
生长发育性状
Keywords
Pseudosciaena crocea
myostatin
SSCP
growth and development trait
分类号
Q959 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
眼斑拟石首鱼肌肉生长抑制素基因克隆及组织表达分析
被引量:
7
2
作者
薛良义
李婷
杨巧一
肖
章
奎
机构
宁波大学生命科学与生物工程学院
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第3期95-101,共7页
基金
浙江省自然科学基金(306295)
长江学者和创新团队发展计划基金(IRTO734)
宁波市自然科学基金(2006A610083)资助项目
文摘
肌肉生长抑制素(MSTN)基因对肌肉生长起负调控作用,在动物育种上具有潜在的应用前景。报道了眼斑拟石首鱼(Sciaenops ocellatus)的MSTN基因的序列结构特征及其组织特异性表达。MSTN基因具有3个外显子和2个内含子,编码376个氨基酸。在内含子Ⅰ和3′-UTR区内,分别发现了(TC)4CC(TC)4CT(TC)4和(AC)7微卫星序列。推断的眼斑拟石首鱼的MSTN氨基酸序列具很强的保守性,与石鼓鱼、金鲷、条纹石鮨、白鲈、金眼石鮨之间的相似性在90%以上。在结构上,眼斑拟石首鱼的MSTN包含N端信号序列(1~22氨基酸残基),TGF-β前肽域(41~256氨基酸残基),RXXR蛋白水解位点(264~267位的RARR)和TGF-β区域(282~376氨基酸残基)。在检测的10种组织中,MSTN只在眼斑拟石首鱼的肌肉、脑和眼组织中表达,其中在肌肉表达最强。
关键词
眼斑拟石首鱼
肌肉生长抑制素基因
克隆
组织表达
Keywords
Sciaenops ocellatus
myostatin
cloning
tissue expression
分类号
Q346 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
大黄鱼肌肉生长抑制素基因微卫星序列多态性分析
被引量:
9
3
作者
薛良义
孙升
肖
章
奎
杨巧一
叶放
童丽娟
机构
宁波大学生命科学与生物工程学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期980-985,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划,No.2006AA10A405)
长江学者和创新团队发展计划(No.IRT0734)
+2 种基金
浙江省自然科学基金(No.Y306295)
宁波市自然科学基金(No.2006A610083)
宁波大学科研基金(No.XK0613041)资助~~
文摘
肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)参与肌肉生长和脂肪发生的调节.本研究在克隆大黄鱼MSTN cDNA的基础上,对3′端非编码区微卫星序列的多态性及其与体长、体重和肌肉脂肪含量的关系进行了分析.结果表明,获得的cDNA长1886bp,在3′端非编码区存在微卫星序列(CA)n.在受检的52个个体中,微卫星序列长度在64~126bp之间.大部分个体的微卫星序列内存在碱基替换,最常见的碱基替换形式是C→T,属于非完美型微卫星序列.根据该位点微卫星序列长度,在实验群体中共检测到23个等位基因,其中频率为0.0192的等位基因11个,0.0385的5个,0.0769的3个,0.0577的2个,0.1154和0.1346的各1个.该基因位点的群体杂合度为0.9327,多态信息含量为0.9288.微卫星序列长度与大黄鱼体长、体重和肌肉脂肪含量之间的相关系数分别为0.409、0.435和-0.026,P值分别为0.021、0.016和0.878.碱基替换对大黄鱼生长及肌肉脂肪含量均无显著影响.
关键词
大黄鱼
肌肉生长抑制素基因
微卫星
多态性
生长
肌肉脂肪含量
分类号
Q959 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
ncRNA研究技术进展
被引量:
1
4
作者
肖
章
奎
薛良义
机构
宁波大学生命科学与生物工程学院
出处
《生命科学》
CSCD
2007年第2期122-126,共5页
基金
浙江省自然科学基金(Y306295)
宁波市自然科学基金(2006A610083)
文摘
ncRNA通过多种机制调控着基因的表达,生物信息学、基因组SELEX技术及微阵列分析等方法在ncRNA的研究中发挥了重要作用,导致在最近5年发现了大量的新ncRNA,本文就研究ncRNA的各种方法作一简要介绍。
关键词
NCRNA
生物信息学
生物芯片
基因组SELEX
质谱法
RNA组学
RNA鉴定
Keywords
ncRNA
bioinformatics
microarray
genomic SELEX
mass spectrometry
momics
RNA identification
分类号
R318.04 [医药卫生—生物医学工程]
Q75 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
紫竹梅花雄蕊毛细胞的胞质流动和胞质骨架
5
作者
李明义
王庆平
肖
章
奎
于蕾
机构
湖北大学生命科学学院
出处
《湖北大学学报(自然科学版)》
CAS
1997年第4期384-387,共4页
基金
国家自然科学基金
文摘
将Olympus相差显微镜活体观察与电镜活体固定、包埋、切片观察相结合发现,紫竹梅花雄蕊毛细胞中存在一条宽大的或者多条较细的胞质束,胞质束内的胞质集体涌动,线粒体和胞质颗粒缓慢移动.胞质束是一种均一、稠密的基质,电子密度显著高于细胞质基质,且有单层膜包被,颗粒和线粒体附着在胞质束膜的外表面上.
关键词
紫竹梅
胞质流动
胞质有架
花雄蕊毛细胞
Keywords
Setcreasea purpurea
Cytoplasmic strand
Cytoplasmic streaming
Organelle movement
Cytoskeleton
分类号
S685.01 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大黄鱼肌肉生长抑制素基因外显子Ⅰ遗传多态性分析
薛良义
李婷
孙升
肖
章
奎
沈秋静
童丽娟
《水产科学》
CAS
北大核心
2008
11
下载PDF
职称材料
2
眼斑拟石首鱼肌肉生长抑制素基因克隆及组织表达分析
薛良义
李婷
杨巧一
肖
章
奎
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
7
下载PDF
职称材料
3
大黄鱼肌肉生长抑制素基因微卫星序列多态性分析
薛良义
孙升
肖
章
奎
杨巧一
叶放
童丽娟
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
9
下载PDF
职称材料
4
ncRNA研究技术进展
肖
章
奎
薛良义
《生命科学》
CSCD
2007
1
下载PDF
职称材料
5
紫竹梅花雄蕊毛细胞的胞质流动和胞质骨架
李明义
王庆平
肖
章
奎
于蕾
《湖北大学学报(自然科学版)》
CAS
1997
0
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职称材料
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