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题名刺盘孢菌的蛋白互作预测及侵染早期共表达模块分析
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作者
连玲丽
翁铭铮
张承康
刘伟
何华勤
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机构
福建农林大学生命科学学院
福建农林大学园艺学院福建
宁德师范学院生命科学学院
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出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期298-311,共14页
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基金
福建省“2011协同创新中心”中国乌龙茶产业协同创新中心专项(J2015-75)
福建省科技厅高校产学项目(2016N5010)
闽东优势农产品高值化利用协同创新中心项目(2017z02).
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文摘
刺盘孢菌是一类重要的植物病原真菌,在全球范围内危害众多单双子叶植物。有许多研究对病菌的侵染模式进行了探索,但仍未阐明其确切的分子机制。本研究在预测病菌蛋白互作的基础上,结合表达谱数据对病菌在活体生存环境下的共表达模块进行挖掘和分析,以期为分子机制的研究提供新的线索。通过同源映射法和结构域法,预测得到刺盘孢菌的4288个蛋白之间存在41700个潜在互作,其中39776个互作发生于异源蛋白之间,1924个互作发生于同一蛋白内。将蛋白互作数据分别与4个表达谱数据进行整合,构建得到离体I、离体II、活体I和活体II 4个共表达互作组。对离体和活体互作组的共有基因的表达水平进行比较分析,结果表明,与离体互作组相比,活体互作组中与翻译、蛋白代谢等有关的基因表达水平下降,与离子转运、糖物质转运等有关的基因表达水平上升,暗示了物质转运在刺盘孢菌侵染早期的重要作用。进一步对活体互作组进行模块化分析,结果表明,活体I和活体II的特异模块分别与胁迫响应、肌动蛋白纤维长度调控有关,其中胁迫响应子网是以热激蛋白Hsp70为核心的互作簇,可能参与病菌对寄主的识别与对抗;肌动蛋白纤维长度调控子网则可能与病菌菌丝在寄主细胞间的延伸有关。
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关键词
刺盘孢菌
蛋白互作
侵染早期
共表达模块
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Keywords
Colletotrichum sp.
protein-protein interaction
early stage of infection
co-expression module
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分类号
S432.44
[农业科学—植物病理学]
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