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基于指纹图谱和网络药理学的南柴胡质量标志物预测分析 被引量:15
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作者 曲中原 吴双 +5 位作者 郑岩 罗龙 邴一凡 邹翔 李雪 李文兰 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期2678-2686,共9页
目的基于指纹图谱和网络药理学分析南柴胡Bupleurumscorzonerifolium中潜在的质量标志物(qualitymarker,Q-Marker)并测定其含量。方法运用高效液相色谱法建立南柴胡药材指纹图谱,确认共有峰并进行指认,再运用网络药理学方法构建"... 目的基于指纹图谱和网络药理学分析南柴胡Bupleurumscorzonerifolium中潜在的质量标志物(qualitymarker,Q-Marker)并测定其含量。方法运用高效液相色谱法建立南柴胡药材指纹图谱,确认共有峰并进行指认,再运用网络药理学方法构建"活性成分-靶点-通路"网络,预测Q-Marker,并测定其含量。结果建立了12批南柴胡药材指纹图谱,确认了13个共有峰,通过柴胡皂苷对照品指认5个色谱峰,分别为柴胡皂苷a、柴胡皂苷b2、柴胡皂苷c、柴胡皂苷d、柴胡皂苷f;经网络药理学确认以上5种成分为活性成分,可作用于14个核心靶点、20条关键通路发挥抗炎、抗抑郁、抗肿瘤作用,初步预测柴胡皂苷a、柴胡皂苷b2、柴胡皂苷c、柴胡皂苷d、柴胡皂苷f为南柴胡潜在的Q-Marker,南柴胡药材中其总质量分数不低于0.10%。结论南柴胡Q-Marker预测分析为药材质量评价提供参考,为阐明其药效物质基础的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 南柴胡 质量标志物 指纹图谱 网络药理学 柴胡皂苷A 柴胡皂苷b2 柴胡皂苷c 柴胡皂苷D 柴胡皂苷f
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基于UPLC-Q-TOF-MS/MS和网络药理学方法探讨五味子藤茎保肝的潜在药效物质及作用机制 被引量:8
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作者 曲中原 罗龙 +6 位作者 张文君 胡扬 杨小龙 邴一凡 王淇漩 李文兰 邹翔 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期2407-2416,共10页
目的基于高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱法(UPLC-Q-TOF-MS/MS)分析五味子Schisandra chinensis藤茎的主要成分,并结合网络药理学和分子对接方法预测保肝药效物质和潜在的作用靶点及通路。方法根据UPLC-Q-TOF-MS/MS二级质谱裂解碎... 目的基于高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱法(UPLC-Q-TOF-MS/MS)分析五味子Schisandra chinensis藤茎的主要成分,并结合网络药理学和分子对接方法预测保肝药效物质和潜在的作用靶点及通路。方法根据UPLC-Q-TOF-MS/MS二级质谱裂解碎片信息,并结合文献数据,对五味子藤茎化学成分进行分析鉴定;通过中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP),从鉴定获得的化学成分中筛选出口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%且符合类药五原则的活性成分;运用TCSMP数据库和SwissTargetPrediction数据库查找和预测五味子藤茎的成分靶点;通过在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、GeneCards数据库和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库筛选疾病靶点。采用String11.5数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络,并筛选核心靶点。利用DAVID 6.8进行基因本体(gene ontology,GO)注释和KEGG通路富集分析,并通过AutoDockTools 1.5.6软件对五味子藤茎的活性成分与作用靶点进行分子对接验证。构建酒精致肝细胞损伤体外模型,并考察五味子藤茎提取物对肝损伤细胞的保护作用。结果从五味子藤茎中共鉴定出40个主要成分,包括木脂素类、黄酮类、有机酸类化合物;进一步筛选出活性成分12个,活性成分与疾病交集靶点118个;通过网络拓扑筛选获得核心靶点16个;富集分析发现五味子藤茎保肝作用主要涉及的通路包括:肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、丙型肝炎(hepatitis C)、乙型肝炎(hepatitis B)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路等。分子对接结果表明,五味子甲素、五味子乙素、五味子丙素、五味子酯甲、槲皮素、戈米辛M2、戈米辛R等成分可与表皮生长因子(epidermal growth facto 展开更多
关键词 五味子藤茎 保肝 活性成分 网络药理学 分子对接 五味子甲素 五味子乙素 五味子丙素 五味子酯甲 槲皮素 戈米辛M2 戈米辛R
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南柴胡地上部分不同极性部位抗菌作用及活性成分相关性研究
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作者 曲中原 杨小龙 +5 位作者 孙向明 邴一凡 王淇漩 汲晓玲 罗龙 邹翔 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1637-1644,1690,共9页
目的 探究南柴胡地上部分不同极性部位抗菌作用及活性成分相关性,阐明抗菌药效物质。方法 采用不同浓度乙醇提取及体积分数为95%的乙醇溶液提取后用乙酸乙酯和正丁醇萃取得到10个极性部位,以金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大... 目的 探究南柴胡地上部分不同极性部位抗菌作用及活性成分相关性,阐明抗菌药效物质。方法 采用不同浓度乙醇提取及体积分数为95%的乙醇溶液提取后用乙酸乙酯和正丁醇萃取得到10个极性部位,以金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大肠杆菌(Escherichia coli)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、白色念珠菌(Candida albican)为对象,以药敏试验、最低抑菌浓度(minimun inhibitory concentration, MIC)、最小杀菌浓度(minimun bactericidal concentration, MBC)为指标,阐释抗菌活性部位。通过UPLC-Q-TOF-MS/MS对不同极性部位进行分析,确定共有成分,用双变量相关分析和灰色关联度分析,建立共有峰峰面积与MIC之间的相关性,筛选药效物质。结果 乙酸乙酯萃取部位为最佳抗菌部位。原儿茶酸、绿原酸、金丝桃苷、亚油酸、山奈酚、异槲皮苷、水仙苷、山奈素、柴胡色原酮酸9个成分与抗菌作用高度相关。结论 本研究为南柴胡地上部分在抗菌产品开发方面提供理论支撑。 展开更多
关键词 南柴地上部分 抗菌部位 抗菌作用 UPLC-Q-TOF-MS/MS 相关性分析
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