虚拟筛选与新药发现 被引量：42

1

作者 李洪林 沈建华 +5 位作者 罗小民 沈旭 朱维良 王希诚 陈凯先 蒋华良 《生命科学》 CSCD 2005年第2期125-131,共7页

虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中。本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用... 虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中。本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用的研究进展,特别介绍了我国这方面研究的状况。 展开更多

关键词 虚拟筛选 分子对接 药物设计 功能基因组

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药物分子设计研究进展 被引量：14

2

作者 罗小民 蒋华良 +1 位作者 沈建华 陈凯先 《中国科学院院刊》 2003年第4期255-259,共5页

综述了药物分子设计研究取得的一些进展,对今后的发展趋势进行了展望,对我院在药物设计方面的发展提出了一些建议。

关键词 药物设计 分子设计 虚拟筛选 分子对策 定量构效关系 药效团模型 发展趋势 研究进展

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雌激素受体和选择性雌激素受体调节剂的研究进展 被引量：16

3

作者 贵春山 沈建华 +3 位作者 罗小民 朱维良 沈旭 蒋华良 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2005年第5期313-320,共8页

雌激素受体属于核受体超家族成员,是一类重要的核转录因子,它在生殖系统、骨组织、心血管和中枢神经系统中发挥着重要的生理作用,是治疗骨质疏松和乳腺癌的重要药物作用靶标。已知的雌激素受体有α和β两种亚型,它们由两个不同的基因编... 雌激素受体属于核受体超家族成员,是一类重要的核转录因子,它在生殖系统、骨组织、心血管和中枢神经系统中发挥着重要的生理作用,是治疗骨质疏松和乳腺癌的重要药物作用靶标。已知的雌激素受体有α和β两种亚型,它们由两个不同的基因编码组成。选择性雌激素受体调节剂是一类在不同的组织细胞中对雌激素受体发挥不同调节作用的化合物,用于治疗绝经后妇女的骨质疏松和乳腺癌等。对近年来有关这两方面的研究情况进行综述。 展开更多

关键词 药物化学 研究进展 综述 雌激素受体 选择性雌激素受体调节剂

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药物分子设计的发展 被引量：9

4

作者 陈凯先 罗小民 蒋华良 《中国科学院院刊》 2000年第4期265-269,共5页

简要回顾了药物分子设计的发展 ,重点评述了间接药物设计方法和直接药物设计方法 ,并列举了若干药物分子设计的成功例子 ,最后提出了该领域在 2

关键词 药物分子设计 发展 药物设计

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后基因组时代的药物发现:趋势和实践 被引量：19

5

作者 陈凯先 蒋华良 +1 位作者 罗小民 沈建华 《中国天然药物》 SCIE CAS CSCD 2004年第5期257-260,共4页

人类基因组计划深刻地影响了药物研究和开发的思路和策略 ,生命科学的研究方法和技术与药物研究的结合日益紧密 ,计算机信息技术也越来越多应用到药物研究过程中来。本文以实例说明了虚拟筛选。

关键词 药物研究 药物发现 虚拟筛选 后基因组时代 靶标 配体垂钓

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PPARγ激动剂的研究进展 被引量：15

6

作者 成峰 沈建华 +5 位作者 罗小民 沈竞康 杨一鸣 沈旭 蒋华良 陈凯先 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2003年第2期110-118,124,共10页

过氧化物酶体增殖剂活化受体γ(PPARγ)是一个由配体激活的核转录因子 ,属于核激素受体 (nuclearhormonereceptor)超家族。被激动剂激活以后 ,该受体可以促进葡萄糖的利用以及胰岛素的增敏。因此 ,PPARγ激动剂有希望成为一类全新的Ⅱ... 过氧化物酶体增殖剂活化受体γ(PPARγ)是一个由配体激活的核转录因子 ,属于核激素受体 (nuclearhormonereceptor)超家族。被激动剂激活以后 ,该受体可以促进葡萄糖的利用以及胰岛素的增敏。因此 ,PPARγ激动剂有希望成为一类全新的Ⅱ型糖尿病治疗药物。 展开更多

关键词 药物化学 综述 PPARΓ激动剂 过氧化物酶体增长因子活化受体 核激素受体

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先导化合物的发现——整合计算机虚拟筛选、化学合成和生物测试方法 被引量：11

7

作者 叶德举 罗小民 +4 位作者 沈建华 朱维良 沈旭 蒋华良 柳红 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1939-1946,共8页

先导化合物的发现在药物研究中起关键作用。基于分子对接的虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,已成为一种与高通量筛选互补的方法,广泛应用于先导化合物的发现中。本文结合本课题组的研究实例,综述了通过计算机虚拟筛选、化学合... 先导化合物的发现在药物研究中起关键作用。基于分子对接的虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术,已成为一种与高通量筛选互补的方法,广泛应用于先导化合物的发现中。本文结合本课题组的研究实例,综述了通过计算机虚拟筛选、化学合成和生物测试相结合的方法来发现先导化合物的研究工作。 展开更多

关键词 先导化合物 虚拟筛选 分子对接 合成 生物测试

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基质金属蛋白酶抑制剂设计的研究进展 被引量：8

8

作者 成峰 柳红 +4 位作者 罗小民 蒋华良 沈竞康 陈凯先 嵇汝运 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 2001年第4期283-293,共11页

基质金属蛋白酶 ( MMP)是一类含锌的水解酶 ,过量的 MMP会加速细胞外基质的降解并导致一系列的疾病 ,例如癌症、关节炎和多发性硬化症等。因此 MMP抑制剂的研究已成为药物设计研究领域中的一个热门课题。近年来 ,科学家们发展了三种分... 基质金属蛋白酶 ( MMP)是一类含锌的水解酶 ,过量的 MMP会加速细胞外基质的降解并导致一系列的疾病 ,例如癌症、关节炎和多发性硬化症等。因此 MMP抑制剂的研究已成为药物设计研究领域中的一个热门课题。近年来 ,科学家们发展了三种分子设计的方法 ,包括基于底物的药物设计、基于结构的药物设计和组合化学技术。本文介绍了这些方法的原理及其在 展开更多

关键词 基质金属蛋白酶 抑制剂 药物设计 组合化学 TIMP

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拉伸分子动力学模拟配体-受体相互作用 被引量：4

9

作者 许叶春 沈建华 +3 位作者 罗小民 沈旭 陈凯先 蒋华良 《中国科学（B辑）》 CSCD 北大核心 2004年第3期177-187,共11页

配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理,为合理药物设计提供线索.新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时间范围内发生的生物化学过程可以在纳秒尺度内进行模拟,从而动态再现目前实验所无法提供的配体与受体的... 配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理,为合理药物设计提供线索.新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时间范围内发生的生物化学过程可以在纳秒尺度内进行模拟,从而动态再现目前实验所无法提供的配体与受体的结合或解离过程.文中通过详细介绍拉伸分子动力学方法对石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶结合和解离过程以及HIV-1逆转录酶和其非核苷酸类似物抑制剂a-APA解离过程的成功模拟,综述拉伸分子动力学模拟在研究配体和受体相互作用中的应用. 展开更多

关键词 拉伸分子动力学 配体-受体 相互作用 药物设计 结合 解离

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中国药物分子设计40年发展成就 被引量：9

10

作者 谭小芹 熊嘉诚 +13 位作者 朱亭霏 黄子铭 童筱雏 郑明月 罗小民 张健 杨胜勇 李洪林 唐赟 盛春泉 张万年 陈凯先 来鲁华 蒋华良 《中国科学：生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第11期1375-1394,共20页

中国的药物分子设计研究始于20世纪70年代末,兴于21世纪初,经过几代人的努力,整体已处于国际领先水平.在计算机辅助药物设计方法和技术的指导下,我国许多药物已经上市或进入临床研究.本文回顾了中国药物分子设计领域的发展进程,以初创... 中国的药物分子设计研究始于20世纪70年代末,兴于21世纪初,经过几代人的努力,整体已处于国际领先水平.在计算机辅助药物设计方法和技术的指导下,我国许多药物已经上市或进入临床研究.本文回顾了中国药物分子设计领域的发展进程,以初创、成长、发展和壮大4个阶段简述我国改革开放40年来在该领域所取得的主要成就. 展开更多

关键词 药物分子设计 先导化合物 结构活性关系 药物靶标 创新药物研发

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表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析 被引量：5

11

作者 秦智强 钟扬 +6 位作者 张健 何有裕 吴旸 江娟 陈洁敏 罗小民 瞿涤 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第10期948-952,共5页

应用序列同源性比较及功能域分析等生物信息学手段,从表皮葡萄球菌全基因组序列中发现16对双组分调控系统以及2个相对保守的功能域(HATPase_c和REC).通过与金黄色葡萄球菌和枯草杆菌中的双组分调控系统基因比较,预测表皮葡萄球菌中同源... 应用序列同源性比较及功能域分析等生物信息学手段,从表皮葡萄球菌全基因组序列中发现16对双组分调控系统以及2个相对保守的功能域(HATPase_c和REC).通过与金黄色葡萄球菌和枯草杆菌中的双组分调控系统基因比较,预测表皮葡萄球菌中同源双组分调控系统基因可能具有参与调控细菌生长、生物膜形成、毒力因子表达等重要生物学功能.对16对双组分调控系统基因的2个保守性功能域进行空间结构模建,获得4个相似的组氨酸蛋白激酶HATPase_c功能域模拟结构以及13个相似的反应调节蛋白REC功能域模拟结构,其中HATPase_c结构在AMP-PNP的结合部位形成袋状结构,而REC结构中均包含3个天冬氨酸活性位点.初步实验结果表明表皮葡萄球菌双组分调控系统保守性功能域的生物信息学分析可以为进一步开发相关治疗药物提供潜在的靶标。 展开更多

关键词 表皮葡萄球菌 双组分调控系统 生物信息学 组氨酸蛋白激酶 反应调节蛋白 生物学功能

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阳离子-π作用的研究进展 被引量：5

12

作者 程家高 罗小民 +4 位作者 闫秀花 李忠 唐赟 蒋华良 朱维良 《中国科学（B辑）》 CSCD 北大核心 2008年第4期269-277,共9页

阳离子-π作用是一种存在于阳离子和芳香性体系之间的相互作用,与一些经典的作用(如氢键、静电和疏水相互作用)相比,被认为是一种新型分子间作用,普遍存在于生物体系中,对分子识别、蛋白质和核酸的结构与功能起着十分重要的作用.本文结... 阳离子-π作用是一种存在于阳离子和芳香性体系之间的相互作用,与一些经典的作用(如氢键、静电和疏水相互作用)相比,被认为是一种新型分子间作用,普遍存在于生物体系中,对分子识别、蛋白质和核酸的结构与功能起着十分重要的作用.本文结合我们课题组的研究工作,对生物体内存在的典型的阳离子-π作用,以及有关阳离子-π作用的实验与理论计算研究进行综述. 展开更多

关键词 阳离子-π作用 分子间相互作用 非键相互作用

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基于酮醇酸还原异构酶KARI复合物晶体结构的三维数据库搜寻 被引量：6

13

作者 王宝雷 李正名 +3 位作者 a马翼 王建国 罗小民 左之利 《有机化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第8期973-976,共4页

以酮醇酸还原异构酶KARI复合物 0 165nm高分辨率晶体结构为基础 ,采用DOCK 4 0分子对接程序通过MDL/ACD三维数据库搜寻 ,找到了 2 79个与KARI结合能较低的小分子 ,讨论了能量打分较高分子同靶酶的作用模式 .

关键词 酮醇酸 异构酶 晶体结构 三维数据库 分子对接 KARI 抑制剂 除草剂

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我国铁矿资源可持续发展 被引量：2

14

作者 张所续 罗小民 《西部资源》 2008年第5期15-17,共3页

近年来,随着我国经济迅猛发展,以及房地产、加工制造行业等用钢铁大户蓬勃发展,导致国内钢铁需求大大提高,铁矿石需求量迅猛增加。我国虽是一个铁矿石资源大国,但由于铁矿成因类型多,成矿条件复杂;

关键词 进口铁矿石 国外铁矿资源 可持续发展 资源储量 矿石资源 澳大利亚 需求量 成矿条件 加工制造 铁矿石进口

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俄罗斯水资源管理 被引量：3

15

作者 张所续 罗小民 王世义 《西部资源》 2008年第4期53-54,共2页

俄罗斯国土面积约1707.54万平方公里(占原苏联领土面积的76%),是世界上领土面积最大的国家。位于欧洲东部和亚洲北部,其欧洲领土的大部分是东欧平原。东濒太平洋,西接波罗的海芬兰湾,横跨欧亚大陆,东西最长9000公里,南北最宽4000公里。... 俄罗斯国土面积约1707.54万平方公里(占原苏联领土面积的76%),是世界上领土面积最大的国家。位于欧洲东部和亚洲北部,其欧洲领土的大部分是东欧平原。东濒太平洋,西接波罗的海芬兰湾,横跨欧亚大陆,东西最长9000公里,南北最宽4000公里。俄罗斯海岸线长33807公里。大部分地区处于北温带,气候多样。 展开更多

关键词 俄罗斯 水资源量 立方米 饮用水 调水工程 东欧平原 欧亚大陆 水资源管理 大陆性气候 水资源现状

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具体案例分析超层越界开采及其危害 被引量：4

16

作者 张所续 罗小民 《国土资源导刊》 2008年第3期75-76,共2页

案情介绍： 某乡镇企业获得了某矿区的采矿许可证，丌采磷矿。与其矿区相邻的是一家国有磷矿企业。在开采过程中，该乡镇企业改变了原开采设计方案，将巷道故意偏向国有矿山的矿区范围，后超出自己矿区范围直接与国有矿山打通，造成国... 案情介绍： 某乡镇企业获得了某矿区的采矿许可证，丌采磷矿。与其矿区相邻的是一家国有磷矿企业。在开采过程中，该乡镇企业改变了原开采设计方案，将巷道故意偏向国有矿山的矿区范围，后超出自己矿区范围直接与国有矿山打通，造成国有矿山保安矿柱破坏。经群众举报，该市国土资源局及时出面进行制止，责令其停止开采。经测量，该乡镇企业超出自己矿区范围30多米。 展开更多

关键词 开采过程 案例分析 乡镇企业 裁判 行政 英国 危害 国有矿山

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浅谈矿产资源规划的法律制度建设和编制实施 被引量：4

17

作者 陈宁 罗小民 《中国国土资源经济》 2009年第3期9-10,共2页

我国矿产资源规划法律制度建设已经不能适应新的发展要求,新一轮的矿产资源规划颁布实施对矿产资源规划法律制度提出了要求,文章从我国矿产资源规划的法律地位切入,在法律制度建设如何保障我国矿产资源规划的编制、实施方面进行初步分析... 我国矿产资源规划法律制度建设已经不能适应新的发展要求,新一轮的矿产资源规划颁布实施对矿产资源规划法律制度提出了要求,文章从我国矿产资源规划的法律地位切入,在法律制度建设如何保障我国矿产资源规划的编制、实施方面进行初步分析,提出了矿产资源规划法律制度建设和规划编制实施的建议。 展开更多

关键词 矿产资源规划 法律制度 建设 编制 实施

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肺炎链球菌双组份系统中的组氨酸激酶(YycG)的同源模建与分析 被引量：3

18

作者 李南 王非 +5 位作者 胥文春 王虹 罗小民 朱维良 尹一兵 张雪梅 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期207-214,共8页

对肺炎链球菌双组份系统中的组氨酸激酶YycG进行同源模建,并分析其与底物ADP的相互作用,为寻找特异性的激酶抑制剂提供了理论依据。采用同源模建的方法构建YycG蛋白的三维结构,并用ProCheck、Profile_3D软件对此结构模型的合理性进行验... 对肺炎链球菌双组份系统中的组氨酸激酶YycG进行同源模建,并分析其与底物ADP的相互作用,为寻找特异性的激酶抑制剂提供了理论依据。采用同源模建的方法构建YycG蛋白的三维结构,并用ProCheck、Profile_3D软件对此结构模型的合理性进行验证;用Autodock4.0软件将结构模型与ADP进行自动对接,分析二者之间的相互作用。序列比对结果显示肺炎链球菌YycG蛋白与Thermotoga maritima X-ray晶体结构序列的同一性达33%;YycG模建后的结构与模板能很好的叠合;在活性口袋处的保守的氨基酸残基Asn145、Asn149、Lys152以及口袋内部的疏水残基在结合、水解底物ADP的过程中发挥重要作用。组氨酸激酶YycG的模建合理,该结构模型可作为设计抗菌药的研究起点。 展开更多

关键词 肺炎链球菌 双组份系统 组氨酸激酶 同源模建 分子对接

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科研信息化助力合理药物设计新发展 被引量：4

19

作者 胡骏驰 徐盼 +10 位作者 陈彦韬 刘婷婷 陆冬 徐圆 阳怀宇 罗小民 朱维良 郑明月 于坤千 罗成 蒋华良 《中国科学院院刊》 CSCD 2016年第6期624-638,共15页

大数据时代,超级计算机促进了合理药物设计研发,这种药物研究模式的转变推动了创新新药发现又一个春天的到来。科研信息化基础设施的升级,包括高性能计算机处理器技术的不断更新,新的资源模式的出现,使得超算技术与计算生物学、计算化... 大数据时代,超级计算机促进了合理药物设计研发,这种药物研究模式的转变推动了创新新药发现又一个春天的到来。科研信息化基础设施的升级,包括高性能计算机处理器技术的不断更新,新的资源模式的出现,使得超算技术与计算生物学、计算化学密切结合,进一步为传统的药物发现和计算机辅助药物设计增添了新功能,加速了分子动力学模拟和虚拟筛选等的研究进程。文章从药物设计学方法研究、药代动力学模型设计和药物设计方法的具体应用三个方面对当今合理药物设计领域的新发展进行了评述,详尽阐释了科研信息化在提高效率、降低成本、加快进程、管控风险及提升研发价值和创新能力方面的优势。 展开更多

关键词 科研信息化 合理药物设计 计算机辅助药物设计

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论矿产资源产权法律意识和制度选择 被引量：3

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作者 罗小民 杜久钲 《中国国土资源经济》 2018年第7期19-23,56,共6页

对矿产资源集中统一管理,提高资源利用效率,是中国特色社会主义市场经济和全面推进生态文明建设条件下资源与环境协调发展的重要内容。文章从矿产资源产权制度发展历史和逻辑角度,分析了矿产资源产权制度存在的历史必然性、发展趋势和... 对矿产资源集中统一管理,提高资源利用效率,是中国特色社会主义市场经济和全面推进生态文明建设条件下资源与环境协调发展的重要内容。文章从矿产资源产权制度发展历史和逻辑角度,分析了矿产资源产权制度存在的历史必然性、发展趋势和制度逻辑;针对当前我国矿产资源法律制度在产权意识和制度设计逻辑关系上的突出问题,从明确矿产资源产权法律制度主体地位,区分行政许可的资源配置和产权约束功能等方面,提出了完善矿产资源法律制度的思路和相关建议。 展开更多

关键词 自然资源 产权 矿产资源 法律制度

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