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东北马鹿ELK1基因CDS序列克隆及其生物信息学分析
1
作者
武世瑶
罗兆聪
+5 位作者
高仰
韩青
索靖
媛
金庆梅
郑冬
刘学东
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023年第9期116-120,134,共6页
为探究东北马鹿ELK1基因CDS序列信息,试验进行了mRNA反转录、CDS序列扩增,测定ELK1基因CDS序列,克隆并构建蛋白表达载体,利用生物信息学方法对该基因编码的蛋白质结构及理化性质等进行了预测与分析。结果表明:东北马鹿ELK1基因转录产物...
为探究东北马鹿ELK1基因CDS序列信息,试验进行了mRNA反转录、CDS序列扩增,测定ELK1基因CDS序列,克隆并构建蛋白表达载体,利用生物信息学方法对该基因编码的蛋白质结构及理化性质等进行了预测与分析。结果表明:东北马鹿ELK1基因转录产物CDS序列全长为1323 bp(GenBank登录号为ON212657),编码440个氨基酸,分子量为46200.42 u。核酸序列具有进化保守性,与牛ELK1基因同源性最高,为97.99%。ELK1多肽链具有亲水性,没有分泌信号肽结构,等电点为5.81,蛋白质为不稳定蛋白。ELK1蛋白的二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链、β-折叠组成,存在ETS DNA结合域,亚细胞定位于细胞核。
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关键词
马鹿
鹿茸
软骨
ELK1
CDS序列
生物信息学分析
原文传递
题名
东北马鹿ELK1基因CDS序列克隆及其生物信息学分析
1
作者
武世瑶
罗兆聪
高仰
韩青
索靖
媛
金庆梅
郑冬
刘学东
机构
东北林业大学野生动物与自然保护地学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023年第9期116-120,134,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31671283)
中央高校基本科研业务费专项(2572019BE01)。
文摘
为探究东北马鹿ELK1基因CDS序列信息,试验进行了mRNA反转录、CDS序列扩增,测定ELK1基因CDS序列,克隆并构建蛋白表达载体,利用生物信息学方法对该基因编码的蛋白质结构及理化性质等进行了预测与分析。结果表明:东北马鹿ELK1基因转录产物CDS序列全长为1323 bp(GenBank登录号为ON212657),编码440个氨基酸,分子量为46200.42 u。核酸序列具有进化保守性,与牛ELK1基因同源性最高,为97.99%。ELK1多肽链具有亲水性,没有分泌信号肽结构,等电点为5.81,蛋白质为不稳定蛋白。ELK1蛋白的二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链、β-折叠组成,存在ETS DNA结合域,亚细胞定位于细胞核。
关键词
马鹿
鹿茸
软骨
ELK1
CDS序列
生物信息学分析
Keywords
Red deer
antler
cartilage
ELKI
CDS sequence
bioinformatics analysis
分类号
S825 [农业科学—畜牧学]
Q344.13 [农业科学—畜牧兽医]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东北马鹿ELK1基因CDS序列克隆及其生物信息学分析
武世瑶
罗兆聪
高仰
韩青
索靖
媛
金庆梅
郑冬
刘学东
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2023
0
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