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固有无序蛋白与蛋白质相互作用位点残基特征分析
被引量：
6
1
作者
董川
曹赞霞
+2 位作者
赵立岭
索
振
鹏
王吉华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期462-471,共10页
本文对固有无序蛋白(IDPs)与其他蛋白质相互作用位点残基特征进行了研究.首先在数据库中选出满足条件的109条IDPs蛋白质链及与其他配体蛋白形成的299个IDPs-蛋白质复合物,然后提取复合物中作为相互作用位点的IDPs-蛋白质残基.这109条IDP...
本文对固有无序蛋白(IDPs)与其他蛋白质相互作用位点残基特征进行了研究.首先在数据库中选出满足条件的109条IDPs蛋白质链及与其他配体蛋白形成的299个IDPs-蛋白质复合物,然后提取复合物中作为相互作用位点的IDPs-蛋白质残基.这109条IDPs链中共含有50 031个氨基酸残基,其中处于作用位点的残基有4 822个.通过分析发现,20种氨基酸在形成IDPs-蛋白质相互作用位点残基时具有不同的倾向性,根据形成作用位点残基的倾向性,20种氨基酸可分成三大类:倾向型氨基酸(ILE、LEU、ARG、PHE、TYR、MET、TRP)、中间型氨基酸(GLN、GLU、THR、LYS、VAL、ASP、HIS)、非倾向型氨基酸(PRO、SER、GLY、ALA、ASN、CYS).研究结果还进一步表明,不同氨基酸在有序区域与无序区域形成IDPs-蛋白质作用位点残基的倾向性不同.其中,氨基酸TRP、LEU、ILE、CYS在有序和无序区域形成作用位点残基的差异性尤为明显,而氨基酸GLU、PHE、HIS、ALA则基本没有多大差别.对IDPs-蛋白质相互作用位点残基理化特征进行分析发现:疏水性强、侧链净电荷量较少、极性较小、溶剂可及性表面积较大、侧链体积较大、极化率较大的氨基酸比较倾向于形成作用位点残基.主成分分析结果显示,残基的极化率、侧链体积和溶剂可及表面积对作用位点残基影响最大.
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关键词
固有无序蛋白(IDPs)
作用位点残基特征
有序区
无序区
氨基酸的理化性质
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职称材料
最小二乘法与灰度重心结合实现圆度检测
被引量：
5
2
作者
索
振
鹏
宫爱玲
《化工自动化及仪表》
CAS
2016年第9期910-912,共3页
产品检测中若采集到的图像是模糊的,其轮廓边缘均不清晰,常规的边缘检测算法中,二值化处理会导致图像边缘信息丢失,降低图像边缘像素位置的定位精度,最终会影响产品圆度误差计算的精度。针对这一问题,在提取图像的边缘后通过灰度重心法...
产品检测中若采集到的图像是模糊的,其轮廓边缘均不清晰,常规的边缘检测算法中,二值化处理会导致图像边缘信息丢失,降低图像边缘像素位置的定位精度,最终会影响产品圆度误差计算的精度。针对这一问题,在提取图像的边缘后通过灰度重心法进行坐标区域的重新定位,然后对得到的坐标点进行最小二乘法拟合。最后,通过对激光光斑的圆度检测实验,分析拟合结果的圆度误差,证明了该算法的优越性。
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关键词
最小二乘法
圆度检测
灰度重心
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职称材料
基于图像灰度梯度的圆度检测算法
被引量：
2
3
作者
索
振
鹏
宫爱玲
《激光杂志》
北大核心
2016年第8期134-136,共3页
在产品实时检测系统图像采集的过程中,难免采集到一些噪声。提取灰度图像目标边缘进行圆度检测时,就需要进行滤波处理,这样会造成被检测边缘的部分信息丢失,检测精度降低。为减小圆度检测误差,保证产品质量,对图像灰度梯度研究时,提出...
在产品实时检测系统图像采集的过程中,难免采集到一些噪声。提取灰度图像目标边缘进行圆度检测时,就需要进行滤波处理,这样会造成被检测边缘的部分信息丢失,检测精度降低。为减小圆度检测误差,保证产品质量,对图像灰度梯度研究时,提出先将灰度梯度的幅值进行非极大值抑制,然后用理想阈值分割图像,再应用最小二乘圆对结果进行圆度检测的算法。最后,通过激光光斑圆度检测实验,对激光光斑的圆度误差进行评定,证实了算法的优越性。
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关键词
检测
圆度
灰度
梯度幅值
最小二乘圆
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职称材料
高中物理分组实验存在的问题及相关对策
4
作者
索
振
鹏
《高中数理化》
2021年第16期50-51,共2页
1背景分组实验法在高中物理实验教学中被广泛应用,并取得了不错的效果.分组实验法具有激发学生对物理实验的兴趣、解决重难点、提高教学效率等诸多优点.当然,分组实验也存在着许多问题,严重影响着分组实验教学的效果.因此,分析分组实验...
1背景分组实验法在高中物理实验教学中被广泛应用,并取得了不错的效果.分组实验法具有激发学生对物理实验的兴趣、解决重难点、提高教学效率等诸多优点.当然,分组实验也存在着许多问题,严重影响着分组实验教学的效果.因此,分析分组实验教学过程中存在的问题,提出相关的解决方案就显得极为重要.
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关键词
高中物理实验教学
分组实验教学
物理分组实验
物理实验
分组实验法
重难点
教学过程中存在的问题
相关对策
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职称材料
题名
固有无序蛋白与蛋白质相互作用位点残基特征分析
被引量：
6
1
作者
董川
曹赞霞
赵立岭
索
振
鹏
王吉华
机构
德州学院物理与电子信息学院
山东省功能大分子生物物理重点实验室(德州学院)
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期462-471,共10页
基金
国家自然科学基金(31000324
61271378
+2 种基金
30970561)
山东省自然科学基金(ZR2011FL011
ZR2012CL09)资助项目~~
文摘
本文对固有无序蛋白(IDPs)与其他蛋白质相互作用位点残基特征进行了研究.首先在数据库中选出满足条件的109条IDPs蛋白质链及与其他配体蛋白形成的299个IDPs-蛋白质复合物,然后提取复合物中作为相互作用位点的IDPs-蛋白质残基.这109条IDPs链中共含有50 031个氨基酸残基,其中处于作用位点的残基有4 822个.通过分析发现,20种氨基酸在形成IDPs-蛋白质相互作用位点残基时具有不同的倾向性,根据形成作用位点残基的倾向性,20种氨基酸可分成三大类:倾向型氨基酸(ILE、LEU、ARG、PHE、TYR、MET、TRP)、中间型氨基酸(GLN、GLU、THR、LYS、VAL、ASP、HIS)、非倾向型氨基酸(PRO、SER、GLY、ALA、ASN、CYS).研究结果还进一步表明,不同氨基酸在有序区域与无序区域形成IDPs-蛋白质作用位点残基的倾向性不同.其中,氨基酸TRP、LEU、ILE、CYS在有序和无序区域形成作用位点残基的差异性尤为明显,而氨基酸GLU、PHE、HIS、ALA则基本没有多大差别.对IDPs-蛋白质相互作用位点残基理化特征进行分析发现:疏水性强、侧链净电荷量较少、极性较小、溶剂可及性表面积较大、侧链体积较大、极化率较大的氨基酸比较倾向于形成作用位点残基.主成分分析结果显示,残基的极化率、侧链体积和溶剂可及表面积对作用位点残基影响最大.
关键词
固有无序蛋白(IDPs)
作用位点残基特征
有序区
无序区
氨基酸的理化性质
Keywords
intrinsically disordered protein （IDPs）, residue characteristics of action sites, ordered regions,disordered regions, physical-chemical properties of amino acid
分类号
Q615 [生物学—生物物理学]
Q7
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职称材料
题名
最小二乘法与灰度重心结合实现圆度检测
被引量：
5
2
作者
索
振
鹏
宫爱玲
机构
昆明理工大学理学院
出处
《化工自动化及仪表》
CAS
2016年第9期910-912,共3页
文摘
产品检测中若采集到的图像是模糊的,其轮廓边缘均不清晰,常规的边缘检测算法中,二值化处理会导致图像边缘信息丢失,降低图像边缘像素位置的定位精度,最终会影响产品圆度误差计算的精度。针对这一问题,在提取图像的边缘后通过灰度重心法进行坐标区域的重新定位,然后对得到的坐标点进行最小二乘法拟合。最后,通过对激光光斑的圆度检测实验,分析拟合结果的圆度误差,证明了该算法的优越性。
关键词
最小二乘法
圆度检测
灰度重心
Keywords
least squares method
roundness detection
gray centroid
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
基于图像灰度梯度的圆度检测算法
被引量：
2
3
作者
索
振
鹏
宫爱玲
机构
昆明理工大学理学院
出处
《激光杂志》
北大核心
2016年第8期134-136,共3页
文摘
在产品实时检测系统图像采集的过程中,难免采集到一些噪声。提取灰度图像目标边缘进行圆度检测时,就需要进行滤波处理,这样会造成被检测边缘的部分信息丢失,检测精度降低。为减小圆度检测误差,保证产品质量,对图像灰度梯度研究时,提出先将灰度梯度的幅值进行非极大值抑制,然后用理想阈值分割图像,再应用最小二乘圆对结果进行圆度检测的算法。最后,通过激光光斑圆度检测实验,对激光光斑的圆度误差进行评定,证实了算法的优越性。
关键词
检测
圆度
灰度
梯度幅值
最小二乘圆
Keywords
detection
roundness
gray
gradient magnitude
least square circle
分类号
TN201 [电子电信—物理电子学]
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职称材料
题名
高中物理分组实验存在的问题及相关对策
4
作者
索
振
鹏
机构
山东省青岛西海岸新区第一高级中学
出处
《高中数理化》
2021年第16期50-51,共2页
文摘
1背景分组实验法在高中物理实验教学中被广泛应用,并取得了不错的效果.分组实验法具有激发学生对物理实验的兴趣、解决重难点、提高教学效率等诸多优点.当然,分组实验也存在着许多问题,严重影响着分组实验教学的效果.因此,分析分组实验教学过程中存在的问题,提出相关的解决方案就显得极为重要.
关键词
高中物理实验教学
分组实验教学
物理分组实验
物理实验
分组实验法
重难点
教学过程中存在的问题
相关对策
分类号
G63 [文化科学—教育学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
固有无序蛋白与蛋白质相互作用位点残基特征分析
董川
曹赞霞
赵立岭
索
振
鹏
王吉华
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014
6
下载PDF
职称材料
2
最小二乘法与灰度重心结合实现圆度检测
索
振
鹏
宫爱玲
《化工自动化及仪表》
CAS
2016
5
下载PDF
职称材料
3
基于图像灰度梯度的圆度检测算法
索
振
鹏
宫爱玲
《激光杂志》
北大核心
2016
2
下载PDF
职称材料
4
高中物理分组实验存在的问题及相关对策
索
振
鹏
《高中数理化》
2021
0
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职称材料
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