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欧李ChUFGT基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
被引量：
1
1
作者
王迪
成冠超
+3 位作者
祝利伟
刘宇涵
笈
小龙
宋兴舜
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第3期782-788,共7页
为从分子水平上揭示欧李中3-O-类黄酮葡萄糖基转移酶(UFGT)基因的空间表达情况,以欧李叶片为试材,根据欧李的转录组序列设计特异性引物,通过PCR获得ChUFGT基因序列,并进行生物信息学分析及亚细胞定位分析。结果表明,ChUFGT基因DNA开放...
为从分子水平上揭示欧李中3-O-类黄酮葡萄糖基转移酶(UFGT)基因的空间表达情况,以欧李叶片为试材,根据欧李的转录组序列设计特异性引物,通过PCR获得ChUFGT基因序列,并进行生物信息学分析及亚细胞定位分析。结果表明,ChUFGT基因DNA开放阅读框为1425 bp(不含终止子),相对分子质量为51.63 kD,编码475个氨基酸,其对应的蛋白质是带正电荷的稳定疏水性蛋白。与近缘物种的蛋白质序列比对分析显示,欧李、李和樱桃李的UFGT氨基酸序列相似度达到97.22%和96.62%,整个系统发育树存在两个大分支,其中ChUFGT与同科植物的亲缘关系最近,其次是与白梨、西洋梨、荔枝等其他科植物相对较近,与葡萄、刺葡萄、石榴等植物的亲缘关系最远。ChUFGT的亚细胞定位结果分析显示,在洋葱内表皮细胞的细胞核和细胞质中都表达该基因。本研究结果为进一步阐明ChUFGT调控欧李细胞花色素苷的合成机制提供了理论基础。
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关键词
欧李(Cerasus
humilis)
UFGT基因
基因克隆
生物信息学分析
亚细胞定位
原文传递
欧李再生和遗传转化体系的研究进展
2
作者
郎绍裕
任静
+2 位作者
王迪
笈
小龙
宋兴舜
《林业科技》
2021年第3期33-37,共5页
通过总结近年来对欧李再生体系和遗传转化体系的研究结果发现:1.带有芽点的茎段是构建无性系的主要材料;2.叶片更适合诱导愈伤组织产生;3.培养基中添加细胞分裂素和生长素的比例接近时有利于诱导愈伤组织产生,比例升高时会促进愈伤组织...
通过总结近年来对欧李再生体系和遗传转化体系的研究结果发现:1.带有芽点的茎段是构建无性系的主要材料;2.叶片更适合诱导愈伤组织产生;3.培养基中添加细胞分裂素和生长素的比例接近时有利于诱导愈伤组织产生,比例升高时会促进愈伤组织的分化;4.单独添加生长素可以诱导生根;5.欧李遗传转化的方法是农杆菌介导法。同时总结和讨论了影响欧李再生率、转化率的主要因素。
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关键词
欧李
组织培养
植株再生
遗传转化
外植体
下载PDF
职称材料
坡柳(Dodonaea viscosa L.)丛枝植原体新病原的分子鉴定
被引量：
1
3
作者
笈
小龙
吴育鹏
+4 位作者
谢慧敏
余乃通
王健华
张秀春
刘志昕
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期2423-2429,共7页
从四川攀枝花芒果园中表现为丛枝、小叶和黄花等症状的坡柳植株发病样品中,利用植原体16S rDNA基因的通用引物R16m F2/R16m R1和R16F2n/R16R2,对发病植株总DNA进行巢式PCR检测,同时设计植原体抗原膜蛋白基因（AntMP）的保守引物AntMP-F/...
从四川攀枝花芒果园中表现为丛枝、小叶和黄花等症状的坡柳植株发病样品中,利用植原体16S rDNA基因的通用引物R16m F2/R16m R1和R16F2n/R16R2,对发病植株总DNA进行巢式PCR检测,同时设计植原体抗原膜蛋白基因（AntMP）的保守引物AntMP-F/AntMP-R进行PCR验证。结果显示,坡柳样品巢式PCR的第一轮、第二轮DNA条带大小分别为1 400 bp和1 200 bp左右,经NCBI序列相似性比较均为植原体16S rDNA序列,Gen Bank登录号为KT957205和KT957206;PCR结果显示抗原膜蛋白基因大小约600 bp,与目标基因大小一致。将测得的16S rDNA基因序列与Gen Bank数据库中登录的16SrⅠ～ⅩⅤ组植原体16S rDNA序列进行同源性比对,构建系统进化树,结果显示四川坡柳丛枝植原体（DOVI-SC）属于16SrⅠ组（即翠菊黄花组）,与已报道的5个16SrⅠ组（AY101386,AY566302,AY389822,L33760和KP662119）同属一个组。利用植原体亚组分类鉴定软件iPhy Classfier对获得的2条植原体16S rDNA序列进行虚拟RFLP分析,结果显示KT957205,KT957206与16SrⅠ-B亚组洋葱黄化植原体（NC-005303）相似度分为1.0、0.97,归属于16SrⅠ-B亚组。本研究对引起四川坡柳丛枝的植原体病原进行检测,为坡柳植原体病害的早期诊断、快速检测以及预防措施制定提供科学线索。
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关键词
坡柳
植原体
分子鉴定
系统进化树
原文传递
题名
欧李ChUFGT基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
被引量：
1
1
作者
王迪
成冠超
祝利伟
刘宇涵
笈
小龙
宋兴舜
机构
东北林业大学生命科学学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第3期782-788,共7页
基金
科技基础资源调查专项(2019FY100502-5)
东北林业大学国家级大学生创新训练项目(202010225037)共同资助。
文摘
为从分子水平上揭示欧李中3-O-类黄酮葡萄糖基转移酶(UFGT)基因的空间表达情况,以欧李叶片为试材,根据欧李的转录组序列设计特异性引物,通过PCR获得ChUFGT基因序列,并进行生物信息学分析及亚细胞定位分析。结果表明,ChUFGT基因DNA开放阅读框为1425 bp(不含终止子),相对分子质量为51.63 kD,编码475个氨基酸,其对应的蛋白质是带正电荷的稳定疏水性蛋白。与近缘物种的蛋白质序列比对分析显示,欧李、李和樱桃李的UFGT氨基酸序列相似度达到97.22%和96.62%,整个系统发育树存在两个大分支,其中ChUFGT与同科植物的亲缘关系最近,其次是与白梨、西洋梨、荔枝等其他科植物相对较近,与葡萄、刺葡萄、石榴等植物的亲缘关系最远。ChUFGT的亚细胞定位结果分析显示,在洋葱内表皮细胞的细胞核和细胞质中都表达该基因。本研究结果为进一步阐明ChUFGT调控欧李细胞花色素苷的合成机制提供了理论基础。
关键词
欧李(Cerasus
humilis)
UFGT基因
基因克隆
生物信息学分析
亚细胞定位
Keywords
Cerasus humilis
UFGT gene
Gene cloning
Bioinformatics analysis
Subcellular localization
分类号
S662.5 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
欧李再生和遗传转化体系的研究进展
2
作者
郎绍裕
任静
王迪
笈
小龙
宋兴舜
机构
东北林业大学生命科学学院
东北农业大学食品学院
出处
《林业科技》
2021年第3期33-37,共5页
文摘
通过总结近年来对欧李再生体系和遗传转化体系的研究结果发现:1.带有芽点的茎段是构建无性系的主要材料;2.叶片更适合诱导愈伤组织产生;3.培养基中添加细胞分裂素和生长素的比例接近时有利于诱导愈伤组织产生,比例升高时会促进愈伤组织的分化;4.单独添加生长素可以诱导生根;5.欧李遗传转化的方法是农杆菌介导法。同时总结和讨论了影响欧李再生率、转化率的主要因素。
关键词
欧李
组织培养
植株再生
遗传转化
外植体
分类号
S662.5 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
坡柳(Dodonaea viscosa L.)丛枝植原体新病原的分子鉴定
被引量：
1
3
作者
笈
小龙
吴育鹏
谢慧敏
余乃通
王健华
张秀春
刘志昕
机构
海南大学热带农林学院
中国热带农业科学院热带生物技术研究所、农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室
文昌市农产品质量安全检验检测站
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期2423-2429,共7页
基金
海南省重大科技计划项目(ZDKJ2017003)
海南省热带果树生物学重点实验室开放课题(KFZX2017002)
中国热带作物学会青年人才托举工程项目(CSTC-QN2017004)共同资助
文摘
从四川攀枝花芒果园中表现为丛枝、小叶和黄花等症状的坡柳植株发病样品中,利用植原体16S rDNA基因的通用引物R16m F2/R16m R1和R16F2n/R16R2,对发病植株总DNA进行巢式PCR检测,同时设计植原体抗原膜蛋白基因（AntMP）的保守引物AntMP-F/AntMP-R进行PCR验证。结果显示,坡柳样品巢式PCR的第一轮、第二轮DNA条带大小分别为1 400 bp和1 200 bp左右,经NCBI序列相似性比较均为植原体16S rDNA序列,Gen Bank登录号为KT957205和KT957206;PCR结果显示抗原膜蛋白基因大小约600 bp,与目标基因大小一致。将测得的16S rDNA基因序列与Gen Bank数据库中登录的16SrⅠ～ⅩⅤ组植原体16S rDNA序列进行同源性比对,构建系统进化树,结果显示四川坡柳丛枝植原体（DOVI-SC）属于16SrⅠ组（即翠菊黄花组）,与已报道的5个16SrⅠ组（AY101386,AY566302,AY389822,L33760和KP662119）同属一个组。利用植原体亚组分类鉴定软件iPhy Classfier对获得的2条植原体16S rDNA序列进行虚拟RFLP分析,结果显示KT957205,KT957206与16SrⅠ-B亚组洋葱黄化植原体（NC-005303）相似度分为1.0、0.97,归属于16SrⅠ-B亚组。本研究对引起四川坡柳丛枝的植原体病原进行检测,为坡柳植原体病害的早期诊断、快速检测以及预防措施制定提供科学线索。
关键词
坡柳
植原体
分子鉴定
系统进化树
Keywords
Dodonaea viscosa L.
Phytoplasma
Molecular identification
Phylogenetic tree
分类号
S763.7 [农业科学—森林保护学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
欧李ChUFGT基因的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
王迪
成冠超
祝利伟
刘宇涵
笈
小龙
宋兴舜
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023
1
原文传递
2
欧李再生和遗传转化体系的研究进展
郎绍裕
任静
王迪
笈
小龙
宋兴舜
《林业科技》
2021
0
下载PDF
职称材料
3
坡柳(Dodonaea viscosa L.)丛枝植原体新病原的分子鉴定
笈
小龙
吴育鹏
谢慧敏
余乃通
王健华
张秀春
刘志昕
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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