题名 微炎症状态与肾性贫血
被引量:34
1
作者
窦 涪 琳
王杨威
崔文鹏
董文鹏
张艺献
苗里宁
机构
吉林大学第二医院肾内科
出处
《中国血液净化》
2016年第3期145-148,共4页
文摘
肾性贫血是慢性。肾衰竭(chronic renal failure,CRF)的主要并发症,与不良的心血管事件和总体预后差相关。目前临床上通过补充重组人红细胞生成素(recombinant human erythropoietinr,HuEPO)及铁剂治疗肾性贫血,疗效确切,但仍有部分患者给予充足治疗后效果不佳。
关键词
肾性贫血
微炎症状态
重组人红细胞生成素
心血管事件
human
肾衰竭
并发症
预后差
分类号
R459.5
[医药卫生—治疗学]
题名 肺腺癌关键基因的生物信息学研究
被引量:7
2
作者
刘冬琦
窦 涪 琳
杨晓东
机构
吉林大学中日联谊医院
山东大学第二医院
出处
《中国实验诊断学》
2020年第4期580-586,共7页
文摘
目的肺癌是世界上发病率和致死率最高的恶性肿瘤,肺腺癌(LUAD)目前已成为肺癌中最主要的病理类型,占所有肺癌患者的80%-85%。本研究应用生物信息学技术,探究肺腺癌潜在的关键基因,最终服务于肺腺癌的诊断、治疗及预后判断。方法从基因表达综合数据库获取到三个包含肺腺癌及正常组织样本的数据集(GSE33532、GSE40791、GSE19188),应用R软件的Limma包筛选出DEGs。使用DAVID数据库对DEGs进行GO及KEGG富集分析,应用STRING及Cytoscape等工具对DEGs构建蛋白相互作用网络,并筛选出hub genes,应用生存曲线及GEPIA对hub genes进行校验及分析。结果共筛选出1354个DEGs,构建出的PPI模型共包含817个节点和5557条连线,并选出三个核心模块,及八个hub genes,包括CDK1、CDC20、CCNA2、CCNB1、BUB1、CCNB2、TOP2A及AURKB,它们都与较差的肺癌预后相关。结论本研究通过生物信息学分析确定了CDK1、CDC20、CCNA2、CCNB1、BUB1、CCNB2、TOP2A及AURKB可能对肺腺癌的发展和预后存在一定影响,可以作为肺腺癌的潜在生物标记物。
关键词
肺腺癌
生物信息学
差异表达基因
生存率
生物标志物
Keywords
lung adenocarcinoma
bioinformatics
differentially expressed genes
survival
biomarker
分类号
R734.2
[医药卫生—肿瘤]
题名 膜性肾病关键基因的生物信息学分析
被引量:3
3
作者
窦 涪 琳
刘庆珍
徐巧莹
刘海英
傅余芹
机构
山东大学第二医院
出处
《山东医药》
CAS
2021年第16期24-29,共6页
文摘
目的基于微阵列数据鉴定膜性肾病(MN)中显著差异表达的基因,并为膜性肾病的诊断与治疗寻找新的潜在基因靶点。方法通过基因表达数据库(GEO)下载GSE108109、GSE115857两个数据集。应用GEO2R工具筛选出正常肾组织与MN患者肾组织的差异表达基因(DEGs)。应用DAVID数据库,对DEGs进行基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集。然后,应用STRING工具和Cytoscape软件构建并可视化DEGs的蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Degree分析识别其中的Hub基因。应用NephonSeqv5在线平台分析Hub基因表达与MN临床特征的关系。结果共筛选出240个DEGs,其中表达上调基因149个,表达下调基因91个。DEGs涉及许多功能和表达途径,如细胞形态调节及细胞骨架的构建。在PPI网络中,共识别出13个Hub基因,包括TP53、PIK3R1、KIT、QSOX1、LAMB1、SHC1、CDK2、APOL1、NES、PTPN6、POLR2A、PRKACA、LTBP1。PRKACA、LTBP1基因表达与蛋白尿呈正相关(r分别为0.858、0.799,P分别为0.006、0.017),POLR2A的表达与蛋白尿呈负相关(r=-0.866,P=0.005)。PRKACA基因表达与血肌酐呈负相关(r=-0.601,P=0.008),POLR2A的表达与血肌酐呈正相关(r=0.583,P=0.011)。结论通过生物信息学分析MN肾组织微阵列数据,发现240个DEGs和13个Hub基因,这些基因可能为MN的诊断与治疗提供潜在基因靶点。
关键词
膜性肾病
生物信息学分析
差异表达基因
关键基因
Keywords
membranous nephropathy
bioinformatics analysis
differentially expressed genes
key genes
分类号
R692.3
[医药卫生—泌尿科学]