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日本蛇根草转录组数据的功能注释及SSR标记开发
1
作者 张子楠 张潮 +3 位作者 唐汉青 相孟达 董溪 汤晓辛 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第5期1614-1623,共10页
日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica)具有很好的观赏价值和药用价值,但基因组信息相对缺乏,导致其分子生物学和基因功能的研究受到限制。为了获得和挖掘日本蛇根草的基因数据和功能,本研究利用日本蛇根草RNA-seq转录组数据进行分析,总共产... 日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica)具有很好的观赏价值和药用价值,但基因组信息相对缺乏,导致其分子生物学和基因功能的研究受到限制。为了获得和挖掘日本蛇根草的基因数据和功能,本研究利用日本蛇根草RNA-seq转录组数据进行分析,总共产生8.48 GB数据;对所有单基因在KEGG通路数据库进行分析,共有131913个单基因被分配给KO(KEGG orthology),并定位到20个二层通路129个不同的通路。Unigene功能注释,获得GO分类条目134644条Unigenes;获得COG注释Unigenes 67961条,其中通用预测Unigenes最多。在28483条单基因簇中获得37070个简单重复序列(SSR),出现频率为16.25%,发生频率为12.49%,其平均长度为20 bp。通过设计进行筛选获取20379对SSR引物,随机筛选50对引物进行验证证明SSR引物具备有效性,日本蛇根草SSR位点具有较高的多态性潜能,对遗传多样性的鉴定具有潜在的开发价值。综上所述,本研究提供了有价值的基因研究和分子研究的信息来源,将为功能基因的克隆、基因表达、分子标记开发和遗传多样性研究提供帮助。 展开更多
关键词 日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica) 转录组 SSR 生物信息学 功能注释
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走进“侏罗纪秘境”
2
作者 相孟达 李柏株 《大众科学》 2021年第2期62-63,共2页
曾几何时,你是否会在看到电影中庞大的远古生物时感到震撼?你是否想过在时间长河中掬起一抔河水,与远古时代进行一次对话?地球悠悠几十亿年的岁月,无数生命消逝在过往中,最后只化为冷冰冰的石头,待后人发掘后,从上面找到一些过去的蛛丝... 曾几何时,你是否会在看到电影中庞大的远古生物时感到震撼?你是否想过在时间长河中掬起一抔河水,与远古时代进行一次对话?地球悠悠几十亿年的岁月,无数生命消逝在过往中,最后只化为冷冰冰的石头,待后人发掘后,从上面找到一些过去的蛛丝马迹。岁月无情,往日难现,但终究还是给我们留下了一些“秘境”,让我们还能从中去寻找、去发现、去感受逝去的远古,下面就和我一起走进“侏罗纪时代的秘境”——赤水桫椤国家级自然保护区。 展开更多
关键词 秘境 国家级自然保护区 侏罗纪 曾几何时 远古时代 走进
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花溪饮用水源保护区植物多样性特征及区系分析 被引量：6
3
作者 杨丹 相孟达 +4 位作者 邓伟 聂雪婷 张潮 金毅 汤晓辛 《中国野生植物资源》 CSCD 2022年第1期82-89,共8页
探究花溪饮用水源保护区内植被物种组成、区系特点及物种多样性的变化规律,对花溪饮用水源地和湿地生态系统的保护具有重要意义。以花溪饮用水源保护区陆生植物群落为对象,从水库为起始点,选取8个样地进行乔木、灌木、草本植物进行样方... 探究花溪饮用水源保护区内植被物种组成、区系特点及物种多样性的变化规律,对花溪饮用水源地和湿地生态系统的保护具有重要意义。以花溪饮用水源保护区陆生植物群落为对象,从水库为起始点,选取8个样地进行乔木、灌木、草本植物进行样方调查。结果表明,样地内共有被子植物213种,蕨类植物11种,共计224种,隶属于71科154属;植物区系组成分科级和属级,分布区类型多样,科级水平上有11个类型,以热带地理成分占明显优势,世界分布次之;属级水平上有13个类型,以泛热带分布最多,其次是温带分布;α多样性的变化受水分和物种种类及人类活动的影响,存在一定差异,靠近水库的地方,物种丰富度呈现较高水平,也鲜少受其他因素的影响;Sorensen相似性系数表明样地相邻越近植物共有种就越多,但是随样地间的距离增加,相似性系数也存在不规律变化。 展开更多
关键词 水源保护区 湿地生态系统 植物群落 区系特征 物种多样性
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多星韭( Allium wallichii )的传粉生态学初探 被引量：1
4
作者 唐汉青 王晓月 +3 位作者 张子楠 相孟达 张祥棵 汤晓辛 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1613-1622,共10页
韭菜坪地区是世界最大的野生韭菜花带,全国唯一的野生韭菜花保护区。为探讨多星韭在该地区的传粉生态学特性以及生态适应性,该研究对多星韭的花期、形态特征、访花者进行了定点观察实验,通过人工授粉实验探究其繁育系统;通过海洋光谱仪... 韭菜坪地区是世界最大的野生韭菜花带,全国唯一的野生韭菜花保护区。为探讨多星韭在该地区的传粉生态学特性以及生态适应性,该研究对多星韭的花期、形态特征、访花者进行了定点观察实验,通过人工授粉实验探究其繁育系统;通过海洋光谱仪检测蜜蜂视觉对两种花色的显著性;通过气相色谱进行测定其各部分的次级代谢产物的组成。结果表明:多星韭花为雄先熟,单花期为7~8 d,花序持续开花时间为25~28 d;花蜜量为(0.61±0.07)μL;中华蜜蜂(Apis cerana)为主要有效传粉者,隧蜂、食蚜蝇、蝇类为偶见访花者;海洋光谱仪的测定结果表明紫花色在绿叶中对蜜蜂视觉来说更显著。访花者在不同花色间的访花频率有显著性差异,但单次访花频率无差异。当两种花色同时存在时中华蜜蜂会优先访问紫色花的多星韭,在访紫花时,由于受到气味的影响,大部分蜜蜂也会访相邻的白花多星韭。多星韭的次级代谢产物分析结果表明,茎、子房和花梗含有多种刺激性含硫代谢物,花器官以及花蜜拥有多种花香类次级代谢物;其有性繁殖为自交和异交混合交配系统,具有无融合生殖。综上结果表明,多星韭在该地区不存在花粉限制,多星韭的繁殖学特征表明其具有能较好的环境适应性。 展开更多
关键词 多星韭 传粉生物学 次生代谢物 气相色谱 反射光谱
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长柱型日本蛇根草花冠筒内横生绒毛作用探究
5
作者 相孟达 严洁 +3 位作者 李玉 邓伟 聂雪婷 汤晓辛 《中国野生植物资源》 CSCD 2021年第1期65-70,共6页
目的:日本蛇根草有长柱型和短柱型两种花型,且长柱型花筒内有一圈横生绒毛,而短柱型则无,因此对长柱型日本蛇根草花筒内绒毛结构的作用进行探究。方法:通过热成像仪记录长柱型、短柱型、去除绒毛长柱型花筒区域的温度变化;利用TTC染色... 目的:日本蛇根草有长柱型和短柱型两种花型,且长柱型花筒内有一圈横生绒毛,而短柱型则无,因此对长柱型日本蛇根草花筒内绒毛结构的作用进行探究。方法:通过热成像仪记录长柱型、短柱型、去除绒毛长柱型花筒区域的温度变化;利用TTC染色法比较长短柱型花粉活力强弱;使用联苯胺-过氧化氢溶液检测长短柱型柱头可授性持续时长;同时将不同柱型同开放时长的花药浸水一定时长后,用TTC染色法对花粉染色,比较不同柱型花粉的耐水性;最后进行自然和自交情况下的授粉处理,收取种子,比较不同柱型的种子数。结果:长柱型日本蛇根草花筒区域温度整体水平上高于短柱型和去除绒毛长柱型;长柱型花粉活力较强,且花粉寿命长于短柱型;长短柱型柱头可授性持续时长均在6天左右,且都在第3天后可授性急剧下降;长柱型花粉耐水性比短柱型强;长柱型自然和自交授粉处理所结种子数均高于短柱型。结论:长柱型的绒毛结构具有保温作用,同时也在其花粉活力和防止自交等方面有一定影响。 展开更多
关键词 日本蛇根草 长柱型 绒毛结构 保温 花粉活力
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