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辣椒HD-Zip基因家族鉴定、系统进化及表达分析 被引量：6
1
作者 邵晨冰 黄志楠 +2 位作者 白雪滢 王云鹏 段伟科 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1004-1017,共14页
【目的】鉴定辣椒HD-Zip基因家族,并利用生物信息学方法系统分析其在基因组中的分布、基因结构、进化分化特征及在不同组织中的时空表达特异性,解析该家族的进化特征及生物学功能。【方法】根据已报道及PlantTFDB数据库中的拟南芥HD-Zi... 【目的】鉴定辣椒HD-Zip基因家族,并利用生物信息学方法系统分析其在基因组中的分布、基因结构、进化分化特征及在不同组织中的时空表达特异性,解析该家族的进化特征及生物学功能。【方法】根据已报道及PlantTFDB数据库中的拟南芥HD-Zip序列,利用本地BLAST工具在我国辣椒测序品种‘遵辣1号’基因组中比对,并利用Pfam、SMART工具进一步验证。采用EMBOSS Programs、MEGA、GSDS、MEME、MCScanX、OrthoMCL、Circos等软件预测辣椒HD-Zip基因家族成员蛋白理化性质,构建系统进化树,定位染色体,分析基因结构、基因复制类型及直系、旁系同源基因。基于GEO数据库,运用R软件、本地perl语言及Cytoscape分析辣椒HD-Zip组织表达差异并绘制共表达网络。【结果】本研究在‘遵辣1号’基因组中鉴定获得42条辣椒HD-Zip,命名为CaHDZ01-CaHDZ42。CaHDZs长度跨度较大,70%CaHDZ蛋白的pI小于7.0。除CaHDZ42,其余基因不均匀地分布在12条染色体上,部分基因为片段复制。该基因家族可分为4个亚族,分别含有18、9、5、10个HD-Zip,基因结构及蛋白结构域差别显著。辣椒、番茄和拟南芥3个物种中的直系同源基因对数目大体相同,但同为茄科的辣椒和番茄之间的稍多;辣椒中的旁系同源基因少于番茄和拟南芥,说明辣椒基因组的倍增事件并没有使CaHDZs明显扩增。对无油樟、水稻、玉米、番茄、马铃薯、辣椒‘CM334’、辣椒‘Zunla-1’、毛果杨、葡萄以及拟南芥9个代表物种的HD-Zip进化特征分析结果表明,从被子植物开始,HD-Zip基因家族就稳定存在4个亚族。推测在形成4个亚族前,HD-Zip分为两组,其中一组分化成Ⅰ和Ⅱ亚族,而另一组则分化成为Ⅲ和Ⅳ亚族。CaHDZs在根、茎、叶、花芽、花和果实不同发育时期的表达模式分析结果显示,4个亚族具有不同程度的表达趋势。其中Ⅰ亚族基因在辣椒不同组织中的表达量均较高 展开更多
关键词 辣椒 HD-Zip基因家族 系统进化 表达分析
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辣椒碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)家族基因的鉴定和表达分析 被引量：3
2
作者 黄志楠 段伟科 +5 位作者 白雪滢 周怡 祝梦全 刘思勤 鞠佳 潘国庆 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2132-2144,共13页
利用生物信息学手段,在辣椒‘遵辣1号’中鉴定到12个碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)基因,命名为CaNAT01~CaNAT12,它们不均等的分布在7条染色体上,片段复制和串联复制是其扩增的原因。CaNATs包含多个跨膜结构域,等电点主要集中在8.39~10.15... 利用生物信息学手段,在辣椒‘遵辣1号’中鉴定到12个碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)基因,命名为CaNAT01~CaNAT12,它们不均等的分布在7条染色体上,片段复制和串联复制是其扩增的原因。CaNATs包含多个跨膜结构域,等电点主要集中在8.39~10.15。系统进化分析发现植物中的NAT起源于D亚组基因,后经过分化,在双子叶植物中稳定存在4个亚组,C亚组基因间的核苷酸差异最小,在进化过程中最保守,CaNATs在这4个亚组均有不同分布。辣椒NAT家族基因具有明显的组织表达差异性,部分基因在根、茎以及果实发育过程中具有重要的调控作用。在低温、高温、干旱和盐胁迫下通过qRT-PCR分析发现Ca NATs具有不同程度的响应,对低温和高温具有较强的响应。 展开更多
关键词 辣椒 NAT基因家族 系统进化 表达分析
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大学书法教学中学生创新意识的培养
3
作者 白雪滢 《美与时代（美术学刊）（中）》 2021年第12期106-107,共2页
随着社会的不断发展与进步,我国高校对学生的教育已不单单只是重视学生的学习成绩,也开始注重学生的素质教育。但是如何培养学生,使学生的综合素质得以提升,是当前教学的重要课题。书法教学是学生素质教育中的一项重要内容,也是传承中... 随着社会的不断发展与进步,我国高校对学生的教育已不单单只是重视学生的学习成绩,也开始注重学生的素质教育。但是如何培养学生,使学生的综合素质得以提升,是当前教学的重要课题。书法教学是学生素质教育中的一项重要内容,也是传承中华传统文化的重要方式。开展书法教学有助于学生在今后的学习与生活中积极地了解与弘扬中华优秀传统文化,提升学生的综合素质。 展开更多
关键词 书法教学 创新意识 大学生
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