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陕西宁强铅锌尾矿中细菌的分离、鉴定及金属离子耐受性评价
被引量:
2
1
作者
罗强
解修超
+4 位作者
陈文强
邓百万
彭浩
姜午春
田
越
欣
《陕西理工大学学报(自然科学版)》
2017年第4期75-80,88,共7页
对陕西宁强铅锌尾矿附近土壤中的细菌进行分离,研究铅锌尾矿附近细菌对重金属离子耐受性,为铅锌尾矿污染地区微生物资源的研究提供理论依据。采用稀释涂布法对细菌进行分离纯化,然后进行16S rRNA序列扩增与校准并构建系统发育树。选择4...
对陕西宁强铅锌尾矿附近土壤中的细菌进行分离,研究铅锌尾矿附近细菌对重金属离子耐受性,为铅锌尾矿污染地区微生物资源的研究提供理论依据。采用稀释涂布法对细菌进行分离纯化,然后进行16S rRNA序列扩增与校准并构建系统发育树。选择4种金属离子(Pb^(2+),Cu^(2+),Hg^(2+),Zn^(2+))对菌株进行耐受性研究。结果表明:从尾矿土壤中共分离纯化出12株细菌,结合形态学与16S rRNA测序结果,所得菌株分属葡萄球菌属(Staphylococcus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、土壤球菌属(Agrococcus)、芽孢杆菌属(Bacillus)和红球菌属(Rhodococcus)。其中有10株细菌表现出不同程度耐金属离子Pb^(2+),Cu^(2+),Hg^(2+),Zn^(2+)特性,占总检测菌株的83.33%。特别是L2,L6,L7,L8这4株细菌耐金属离子特性较高,占总检测菌株的33.33%。
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关键词
铅锌尾矿
细菌
鉴定
金属离子耐受性
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职称材料
基于转录组分析铜绿假单胞菌DN1降解荧蒽特性
被引量:
2
2
作者
李艳鹏
田
越
欣
+1 位作者
郝志丹
马艳玲
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期54-65,共12页
[背景]铜绿假单胞菌DN1是一株从石油污染土壤中分离筛选到的具有广谱降解功能的菌株。[目的]深入了解荧蒽胁迫条件下铜绿假单胞菌DN1降解污染物过程中重要的降解相关基因信息。[方法]通过高通量测序技术对铜绿假单胞菌DN1进行转录组测序...
[背景]铜绿假单胞菌DN1是一株从石油污染土壤中分离筛选到的具有广谱降解功能的菌株。[目的]深入了解荧蒽胁迫条件下铜绿假单胞菌DN1降解污染物过程中重要的降解相关基因信息。[方法]通过高通量测序技术对铜绿假单胞菌DN1进行转录组测序,对其所有的转录本进行KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)分类和Pathway注释、GO (gene ontology)分类和富集分析。[结果]转录组测序显示:与对照组相比,荧蒽诱导组检测到6 189个基因,其中1 919个基因上调表达,1 603个基因下调表达。KEGG注释分析显示差异上调表达基因匹配到了112个KEGG代谢途径,注释到"代谢途径"的1 408个基因(约占总差异基因的73.4%)中有317个基因参与了碳氢化合物代谢及含有苯环结构的异源生物质的生物降解,占"代谢途径"的16.53%,暗示了菌株DN1降解荧蒽可能与这些途径有密切关系。另外,主要代谢途径中的差异表达基因主要集中在ABC转运系统、氨基酸生物合成、双组分系统及碳代谢,这些途径大多数参与了底物的识别转运、信号转导及基因表达调控。[结论]进一步拓展了铜绿假单胞菌DN1在荧蒽胁迫条件下的代谢途径和逆境反应,也为微生物修复环境污染物研究夯实了理论基础。
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关键词
铜绿假单胞菌DN1
转录组
荧蒽
降解
基因表达
原文传递
题名
陕西宁强铅锌尾矿中细菌的分离、鉴定及金属离子耐受性评价
被引量:
2
1
作者
罗强
解修超
陈文强
邓百万
彭浩
姜午春
田
越
欣
机构
陕西理工大学生物科学与工程学院
陕西理工大学陕西省食药用菌工程技术研究中心
出处
《陕西理工大学学报(自然科学版)》
2017年第4期75-80,88,共7页
基金
陕西理工大学研究生创新基金资助项目(SLGYCX1620)
文摘
对陕西宁强铅锌尾矿附近土壤中的细菌进行分离,研究铅锌尾矿附近细菌对重金属离子耐受性,为铅锌尾矿污染地区微生物资源的研究提供理论依据。采用稀释涂布法对细菌进行分离纯化,然后进行16S rRNA序列扩增与校准并构建系统发育树。选择4种金属离子(Pb^(2+),Cu^(2+),Hg^(2+),Zn^(2+))对菌株进行耐受性研究。结果表明:从尾矿土壤中共分离纯化出12株细菌,结合形态学与16S rRNA测序结果,所得菌株分属葡萄球菌属(Staphylococcus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、土壤球菌属(Agrococcus)、芽孢杆菌属(Bacillus)和红球菌属(Rhodococcus)。其中有10株细菌表现出不同程度耐金属离子Pb^(2+),Cu^(2+),Hg^(2+),Zn^(2+)特性,占总检测菌株的83.33%。特别是L2,L6,L7,L8这4株细菌耐金属离子特性较高,占总检测菌株的33.33%。
关键词
铅锌尾矿
细菌
鉴定
金属离子耐受性
Keywords
lead-zinc tailings
bacteria
identification
metal ion tolerance
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于转录组分析铜绿假单胞菌DN1降解荧蒽特性
被引量:
2
2
作者
李艳鹏
田
越
欣
郝志丹
马艳玲
机构
西部资源与现代生物技术教育部重点实验室陕西省生物技术重点实验室西北大学生命科学学院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期54-65,共12页
基金
国家自然科学基金(31000069)
陕西省重点研发计划重点项目(2017ZDXM-SF-105)~~
文摘
[背景]铜绿假单胞菌DN1是一株从石油污染土壤中分离筛选到的具有广谱降解功能的菌株。[目的]深入了解荧蒽胁迫条件下铜绿假单胞菌DN1降解污染物过程中重要的降解相关基因信息。[方法]通过高通量测序技术对铜绿假单胞菌DN1进行转录组测序,对其所有的转录本进行KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)分类和Pathway注释、GO (gene ontology)分类和富集分析。[结果]转录组测序显示:与对照组相比,荧蒽诱导组检测到6 189个基因,其中1 919个基因上调表达,1 603个基因下调表达。KEGG注释分析显示差异上调表达基因匹配到了112个KEGG代谢途径,注释到"代谢途径"的1 408个基因(约占总差异基因的73.4%)中有317个基因参与了碳氢化合物代谢及含有苯环结构的异源生物质的生物降解,占"代谢途径"的16.53%,暗示了菌株DN1降解荧蒽可能与这些途径有密切关系。另外,主要代谢途径中的差异表达基因主要集中在ABC转运系统、氨基酸生物合成、双组分系统及碳代谢,这些途径大多数参与了底物的识别转运、信号转导及基因表达调控。[结论]进一步拓展了铜绿假单胞菌DN1在荧蒽胁迫条件下的代谢途径和逆境反应,也为微生物修复环境污染物研究夯实了理论基础。
关键词
铜绿假单胞菌DN1
转录组
荧蒽
降解
基因表达
Keywords
Pseudomonas aeruginosa DN1
Transcriptome
Fluoranthene
Degradation
Gene expression
分类号
X53 [环境科学与工程—环境工程]
X172
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陕西宁强铅锌尾矿中细菌的分离、鉴定及金属离子耐受性评价
罗强
解修超
陈文强
邓百万
彭浩
姜午春
田
越
欣
《陕西理工大学学报(自然科学版)》
2017
2
下载PDF
职称材料
2
基于转录组分析铜绿假单胞菌DN1降解荧蒽特性
李艳鹏
田
越
欣
郝志丹
马艳玲
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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