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题名中国人群肝功能检测指标全基因组关联分析研究
被引量：4
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作者
孙一丹
田子钊
周伟
李沫
怀聪
贺林
秦胜营
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机构
上海交通大学Bio-X研究院
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期249-260,共12页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:81773818,82003856)资助。
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文摘
肝功能检测(liver function test,LFTs)指标是受遗传和环境影响的复杂性状,具有个体差异性。为系统性研究中国人群全基因组范围内单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与肝功能指标之间的联系,本研究利用英国生物银行(UK Biobank)中1653名中国人的基因分型数据和表型数据为研究对象,利用PLINK软件进行全关联分析研究(genome-wide association study,GWAS),发现229个SNP与中国人群血液中的总胆红素(total bilirubin,TB)相关,27个SNP与中国人群血液中碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)相关,36个SNP与中国人群血液中的γ-谷氨酰转肽酶(γ-glutamyl transpeptidase,GGT)相关,1个SNP与中国人群血液中的门冬氨酸氨基转移酶(aspartate transaminase,AST)相关,最显著的位点中有11个位点是新的LFTs关联位点。通过功能基因组分析,发现这些位点的临床意义(如吉尔伯特综合征),确定了候选基因(UGT1A,ABO,GGT1),为从遗传角度理解中国人群LFTs的个体差异性和肝功能指标临床精准检测提供了前期研究基础。
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关键词
肝功能检测
总胆红素
碱性磷酸酶
Γ-谷氨酰转肽酶
全基因组关联分析
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Keywords
Liver function tests
total bilirubin
alkaline phosphatase
γ-glutamyl transpeptidase
genome-wide association study
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分类号
R575
[医药卫生—消化系统]
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题名通过时间基因表达谱分析探究异烟肼引起肝损伤的机制
被引量：1
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作者
田子钊
周晨希
周伟
李沫
褚云鹏
怀聪
秦胜营
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机构
上海交通大学Bio-X研究院
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期501-509,共9页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:81773818,82003856)资助。
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文摘
抗结核药物异烟肼具有肝脏毒性,其发生机制需要进一步阐明。本研究使用异烟肼处理肝细胞,分析不同处理时间表达谱的差异。通过对差异表达基因进行聚类分析和功能富集分析,共得到6个与肝脏毒性相关的基因簇和一系列相关通路;进一步通过蛋白互作分析和时间序列差异分析方法,筛选出表达水平具有时间依赖性的13个关键基因。本研究结果为理解异烟肼引发肝脏毒性过程提供了思路,为今后药物性肝脏毒性的监测以及治疗提供了新的靶基因。
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关键词
异烟肼
肝细胞
肝脏毒性
时间序列分析
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Keywords
isoniazid
hepatocytes
liver toxicity
time series analysis
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分类号
R96
[医药卫生—药理学]
Q811.4
[医药卫生—药学]
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