龙岩山麻鸭蛋品质性状的全基因组关联研究 被引量：3

1

作者 孙艳发 吴琼 +14 位作者 林如龙 陈红萍 甘秋云 沈玥 王亚茹 薛鹏飞 陈飞帆 刘健涛 周陈鑫 兰诗诗 潘浩哲 邓凡 岳稳 江宵兵 李焰 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期572-586,共15页

【目的】通过全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)技术筛选和鉴定鸭蛋品质性状的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点及候选基因,为龙岩山麻鸭蛋品质性状分子育种提供参考。【方法】试验测定... 【目的】通过全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)技术筛选和鉴定鸭蛋品质性状的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点及候选基因,为龙岩山麻鸭蛋品质性状分子育种提供参考。【方法】试验测定产蛋后期235只龙岩山麻鸭母鸭蛋品质性状,包括蛋重(egg weight,EW)、蛋形指数(egg shaped index,ESI)、蛋壳厚(eggshell thickness,EST)、蛋壳强度(eggshell strength,ESS)、蛋壳颜色L^(*)、a^(*)、b^(*)值(eggshell colour L^(*),a^(*),b^(*),ESCL、ESCA和ESCB)、蛋白高度(albumin height,AH)、哈氏单位(Haugh unit,HU)、蛋黄颜色(egg yolk colour,EYC)、蛋黄重(egg yolk weight,EYW)和蛋黄比例(egg yolk percentage relative to egg weight,EYP)。使用ASReml-R 4.1软件多性状动物模型对蛋品质性状进行遗传参数估计。使用简化基因组测序技术对鸭血液基因组DNA进行SNP分型,分型后进行蛋品质性状与这些SNPs间的GWAS研究。【结果】龙岩山麻鸭蛋品质性状中,EW、ESI、EST、ESL、ESA和AU具有中高等的遗传力,遗传力在0.21—0.70之间。EW与AU存在较强的正遗传相关(rg=0.91±0.37)。ESI与EYC存在较强的遗传负相关(rg=-0.98±1.03)。EST与ESS具有表型正相关(rp=0.41±0.06),与ESA具有遗传和表型负相关(rg=-0.86±0.25和rp=-0.15±0.07),与ESB具有遗传和表型正相关(rg=0.96±0.37和rp=0.18±0.07)。ESA与ESB具有遗传和表型负相关(rg=-0.64±0.28和rp=-0.31±0.06)。GWAS研究结果表明,7个SNPs位点与ESI、EST和EYC达到5%基因组水平显著关联(P<4.74×10^(-6)),涉及6个候选基因。与ESI关联的SNP(chr20:11135563:G:C)位点位于20号染色体含有75A富含亮氨酸重复序列(leucine rich repeat containing 75A)基因内。与EST关联的2个SNPs(chr13:5766560:A:G和chrZ:968819:C:T)位点分别位于13号LOC106014427下游6.86 kb处和Z染色体转录因子4(transcription factor 4)基因内。与EYC关联的4个SNPs位点,其中1个(chr2:38155965:G:A)位于2号染色体钾电压� 展开更多

关键词 龙岩山麻鸭 蛋品质 遗传参数 单核苷酸多态性 全基因组关联研究

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“一中心、两融合、五维度”教学创新实践——以“数据结构”课程为例

2

作者 甘秋云 《工业和信息化教育》 2024年第2期17-22,共6页

针对“数据结构”教学中存在的问题,基于“一中心、两融合、五维度”的教学思路,提出以学生为中心,构建基于信息化的“分享、互动、协作、探究”型教学方式,注重培养学生的理论、实践、学术探究、思维和创新能力。通过改革,不仅有助于... 针对“数据结构”教学中存在的问题,基于“一中心、两融合、五维度”的教学思路,提出以学生为中心,构建基于信息化的“分享、互动、协作、探究”型教学方式,注重培养学生的理论、实践、学术探究、思维和创新能力。通过改革,不仅有助于学生夯实课程的相关理论知识,强化实践动手能力,同时可以提高学生的自主学习能力和创新能力,提高课程的教学质量。 展开更多

关键词 教学改革 实践教学 创新 教学评价

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铁路客运站列车运行图资料自动编制方法与应用

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作者 甘秋云 陈鑫 姚伟 《铁道运输与经济》 北大核心 2024年第1期26-34,共9页

随着中国铁路的高速发展,铁路运能的利用越来越精细化,国铁集团对站段列车运行图调整优化提出了更高的要求。目前,基层客运站主要采用人工编制核对列车运行图资料,存在工作量大、效率低、易出错且文档不规范等问题。如何提高铁路列车运... 随着中国铁路的高速发展,铁路运能的利用越来越精细化,国铁集团对站段列车运行图调整优化提出了更高的要求。目前,基层客运站主要采用人工编制核对列车运行图资料,存在工作量大、效率低、易出错且文档不规范等问题。如何提高铁路列车运行图资料编制效率,保证结果的准确性,是目前客运站从业人员面临的一项重要挑战。基于VBA,使用excel工具实现客运站列车运行图资料的自动编制,包括列车时刻表自动编制、列车时刻表新旧对比、动车组接发列车固定股道表自动编制及基本进路图自动编制4个功能。结果表明,借助自动编制软件生成的运行图相关资料不仅正确率为100%,工作效率提高98%以上,而且能够保证各个车站编制资料的规范化和标准化,具有一定的应用价值。 展开更多

关键词 铁路 客运站 列车时刻表 运行图 自动编制

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番茄红素对玉米赤霉烯酮、呕吐毒素和黄曲霉毒素B_1联合暴露小鼠回肠损伤的保护作用

4

作者 甘秋云 梁天增 +5 位作者 温礼键 左翠歌 刘玉兰 刘金松 杨彩梅 林佳 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期3306-3316,共11页

本试验旨在探究番茄红素(LYC)对玉米赤霉烯酮(ZEN)、呕吐毒素(DON)和黄曲霉毒素B1(AFB1)联合暴露小鼠回肠损伤的保护作用及机制。选用80只6周龄无特异病原体(SPF)的ICR雄性小鼠[体重为(31.01±0.29) g],随机分为4组(每组20只),分别... 本试验旨在探究番茄红素(LYC)对玉米赤霉烯酮(ZEN)、呕吐毒素(DON)和黄曲霉毒素B1(AFB1)联合暴露小鼠回肠损伤的保护作用及机制。选用80只6周龄无特异病原体(SPF)的ICR雄性小鼠[体重为(31.01±0.29) g],随机分为4组(每组20只),分别为:对照组、LYC组、霉菌毒素组和LYC+霉菌毒素组。将小鼠适应性饲养10 d后,连续灌胃10 mg/kg LYC或等量其溶剂14 d,随后腹腔注射10 mg/kg ZEN+1 mg/kg DON+0.5 mg/kg AFB1或等量溶剂。在处理结束时,小鼠禁食24 h后称重并处死,立即收集回肠样本待测。结果表明:1)与对照组相比,霉菌毒素组小鼠回肠隐窝深度极显著提高(P<0.01),回肠绒毛高度/隐窝深度值显著降低(P<0.05);与霉菌毒素组相比,LYC+霉菌毒素组回肠绒毛高度有提高趋势(P>0.05),回肠隐窝深度有降低趋势(P>0.05)。2)与对照组相比,霉菌毒素组小鼠回肠封闭蛋白-1(claudin-1)、闭锁小带蛋白-1(ZO-1)和闭合蛋白(occludin)的分布减少;与霉菌毒素组相比,LYC+霉菌毒素组回肠claudin-1、ZO-1和occludin的分布增加。3)与对照组相比,霉菌毒素组小鼠回肠上皮细胞紧密连接模糊化,线粒体膜溶解,嵴断裂,且线粒体肿胀、空泡化严重;与霉菌毒素组相比,LYC+霉菌毒素组回肠上皮细胞紧密连接完整清晰,线粒体出现轻微的肿胀、空泡化。4)与对照组相比,霉菌毒素组小鼠回肠受体相互作用蛋白3 (RIP3)和混合系列蛋白激酶结构域样蛋白(MLKL)蛋白表达量显著或极显著提高(P<0.05或P<0.01);与霉菌毒素组相比,LYC+霉菌毒素组回肠RIP3蛋白表达量显著降低(P<0.05)。5)与对照组相比,霉菌毒素组小鼠回肠受体相互作用蛋白1(RIP1)、RIP3和MLKL的mRNA表达量极显著提高(P<0.01);与霉菌毒素组相比,LYC+霉菌毒素组回肠RIP1和RIP3的mRNA表达量极显著降低(P<0.01)。综上所述,LYC可通过维持肠道黏膜屏障及线粒体结构的完整性,抑制回肠程序性坏死信号通路,以减轻ZEN、DO 展开更多

关键词 番茄红素 霉菌毒素 小鼠 回肠损伤 线粒体损伤 程序性坏死

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m^(6)A去甲基化酶ALKBH5在结直肠癌组织中的差异表达分析

5

作者 郑志忠 张凌微 +1 位作者 邱德辉 甘秋云 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第12期2234-2239,共6页

目的:探讨ALKBH5在结直肠癌(colorectal cancer, CRC)及其癌旁组织中的差异表达,评估其作为CRC诊断肿瘤标志物的潜在应用。方法:通过GEPIA2数据库和UALCAN网站检索ALKBH5在CRC和癌旁组织中的表达水平,结合PCR和琼脂糖凝胶电泳验证ALKBH5... 目的:探讨ALKBH5在结直肠癌(colorectal cancer, CRC)及其癌旁组织中的差异表达,评估其作为CRC诊断肿瘤标志物的潜在应用。方法:通过GEPIA2数据库和UALCAN网站检索ALKBH5在CRC和癌旁组织中的表达水平,结合PCR和琼脂糖凝胶电泳验证ALKBH5 cDNA引物的特异性,并通过RT-qPCR分析ALKBH5的熔解温度曲线图。结果:ALKBH5在不同癌症中的表达水平和作用功能存在差异,在CRC中的相对表达量较低,而在癌旁组织中则较高,但与患者预后无显著相关性。PCR产物片段大小与ALKBH5 cDNA的121 bp一致,电泳条带清晰且单一,表明引物特异性良好。熔解温度曲线图显示RT-qPCR产物特异性良好,未产生引物二聚体。AUC值为0.945 8,表明ALKBH5具有较高的辅助诊断效能。结论:ALKBH5有望作为CRC诊断的肿瘤标志物,但ALKBH5 mRNA表达量难以单独作为CRC患者治疗靶点,需要综合考虑其表达产物的多样性。 展开更多

关键词 ALKBH5 结直肠癌 m6A RT-QPCR 表达水平

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冷却调度参数对模拟退火算法性能的影响分析 被引量：1

6

作者 甘秋云 李兢思 杨佳翰 《蚌埠学院学报》 2023年第5期47-52,共6页

通过模拟仿真实验,研究了不同冷却调度参数对模拟退火算法性能的影响。结果表明:在5种不同的冷却调度下,不同的降温参数对算法的收敛效果存在差异。其中,线性冷却的降温速率呈等速率直线下降,并不能很好地控制收敛速率;指数冷却的冷却... 通过模拟仿真实验,研究了不同冷却调度参数对模拟退火算法性能的影响。结果表明:在5种不同的冷却调度下,不同的降温参数对算法的收敛效果存在差异。其中,线性冷却的降温速率呈等速率直线下降,并不能很好地控制收敛速率;指数冷却的冷却速率对降温参数的变化敏感,参数越小,冷却速率越快;逆冷却降温参数过大或过小均不利于算法的收敛效果;对数冷却和逆线性冷却在最初的迭代过程中,冷却速率较快,随后冷却速率变得极为缓慢,算法的收敛性较差。 展开更多

关键词 模拟退火算法 冷却调度 收敛性 组合优化

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基于“以生为本、以终为始、持续改进”教学理念下数据结构教学改革与实践

7

作者 甘秋云 李兢思 《内江科技》 2023年第9期48-49,108,共3页

针对当前数据结构教学中所面临的问题,基于“以生为本、以终为始、持续改进”的教学理念,倡导“教、学、做”为一体的新的教学模式,阐述如何从教师队伍、教学内容、教学方法、考核评价四个方面对数据结构进行教学改革,通过教学创新成果... 针对当前数据结构教学中所面临的问题,基于“以生为本、以终为始、持续改进”的教学理念,倡导“教、学、做”为一体的新的教学模式,阐述如何从教师队伍、教学内容、教学方法、考核评价四个方面对数据结构进行教学改革,通过教学创新成果,表明四维融合的教学改革能激发学生的学习积极性和主动能动性,有利于提高课程的教学质量和培养学生的综合素质。 展开更多

关键词 数据结构 以生为本 教学改革与实践 持续改进 教学创新 教学理念 教学方法 教学质量

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基于动态规划的Needleman-Wunsch双序列比对算法的分析与研究 被引量：3

8

作者 甘秋云 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2021年第2期340-346,共7页

生物序列比对是生物信息学中最基础的研究课题之一。基于动态规划的Needleman-Wunsch双序列比对算法主要采用迭代算法及空位罚分规则对基因序列进行逐一比对,计算二者相似性得分,最后通过回溯分析得出序列之间的最佳比对。虽然该算法可... 生物序列比对是生物信息学中最基础的研究课题之一。基于动态规划的Needleman-Wunsch双序列比对算法主要采用迭代算法及空位罚分规则对基因序列进行逐一比对,计算二者相似性得分,最后通过回溯分析得出序列之间的最佳比对。虽然该算法可以得到最佳比对结果,但是时间复杂度和空间复杂度较高。首先对原算法进行分析,对计算得分和回溯进行改进。接着设计2次实验,以金黄色葡萄球菌和银葡萄球菌分别作为目标序列和待比对序列,分别生成序列长度范围相同和不同的5组数据进行实验测试。最后通过对新型冠状病毒和SARS病毒全序列进行比对,进一步验证了改进算法的有效性。实验结果表明,改进后的算法可以缩短序列比对时间,提高序列比对效率。 展开更多

关键词 序列比对 动态规划 相似性

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基于0BE-CDI教学模式的研究与实践——以《数据结构》课程为例 被引量：2

9

作者 甘秋云 郑春聪 《内江科技》 2021年第1期153-154,共2页

OBE-CDI的组合教学是以学生为本,基于学习成果下,教师站在现代教育理论发展的前沿来看待、评价、设计自己的教学活动,在教学过程中倡导"教、学、做"为一体的新的教学模式,最后采用多种综合方式有效地评价学生的学习产出。本... OBE-CDI的组合教学是以学生为本,基于学习成果下,教师站在现代教育理论发展的前沿来看待、评价、设计自己的教学活动,在教学过程中倡导"教、学、做"为一体的新的教学模式,最后采用多种综合方式有效地评价学生的学习产出。本文主要以《数据结构》课程为例,结合本科高校教学经验,探讨基于OBE-CDI教学模式下的课程改革实践。 展开更多

关键词 现代教育理论 组合教学 本科高校 以学生为本 教学模式 《数据结构》课程 CDI OBE

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透明质酸用于伤口敷料的研究进展 被引量：1

10

作者 李兢思 甘秋云 +3 位作者 朱琳艳 张靖超 谢颖 郭珍珍 《化纤与纺织技术》 2022年第7期18-21,共4页

近年来,伤口敷料因具有成本低、使用方便、价格低廉、效果显著等优点,引起了国内外研究者的广泛关注。透明质酸是一种由D-葡萄糖醛酸和N-乙酰氨基葡萄糖胺交替连接组成的阴离子黏多糖,作为一种智能保湿因子,其在医美、化妆品行业应用广... 近年来,伤口敷料因具有成本低、使用方便、价格低廉、效果显著等优点,引起了国内外研究者的广泛关注。透明质酸是一种由D-葡萄糖醛酸和N-乙酰氨基葡萄糖胺交替连接组成的阴离子黏多糖,作为一种智能保湿因子,其在医美、化妆品行业应用广泛。由于其独特的理化性质和生物学性质,透明质酸已被成功用于伤口敷料的开发中。文章系统地总结了透明质酸用于不同类型的伤口敷料,如海绵型、薄膜型、水凝胶型和静电纺丝型等的最新进展,旨在为新型智能敷料的开发提供思路。 展开更多

关键词 透明质酸 伤口敷料 伤口愈合 新型智能敷料

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ED算法和SNP-index算法计算SNP位点的比较分析——以拟南芥为例

11

作者 甘秋云 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2022年第4期707-712,共6页

SNP(单核苷酸多态性)是发生在DNA序列上单个核苷酸碱基之间的变异,是生物可遗传变异中最常见的一种变异。ED算法和SNP-index算法是计算SNP位点的2种常用算法。由高通量测序获得拟南芥F_(2)代全基因组测序数据,基于Linux平台对测序数据... SNP(单核苷酸多态性)是发生在DNA序列上单个核苷酸碱基之间的变异,是生物可遗传变异中最常见的一种变异。ED算法和SNP-index算法是计算SNP位点的2种常用算法。由高通量测序获得拟南芥F_(2)代全基因组测序数据,基于Linux平台对测序数据进行过滤、筛选和比对,通过算法实现结果,比较不同算法检测得到的SNP位点数量和SNP基因型比例。实验结果表明,通过ED算法得到的SNP位点数量更多,分布更广,相对分布密度大于SNP-index算法的,但是2种算法得到的SNP位点数量和SNP基因型比例相近。 展开更多

关键词 单核苷酸多态性(SNP) 生物信息 ED算法 SNP-index算法

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拟南芥突变基因位置的Linux大数据分析

12

作者 甘秋云 《唐山师范学院学报》 2019年第3期60-63,共4页

以拟南芥为实例,通过野生型和突变型杂交,对二代群体DNA进行深度测序,获取海量DNA数据。以SNP为分子标记,利用生物信息学方法对测序数据进行单核苷酸多态性(SNP)检测。通过置换测验对基因组区段内的等位基因频率进行差异显著分析,并利... 以拟南芥为实例,通过野生型和突变型杂交,对二代群体DNA进行深度测序,获取海量DNA数据。以SNP为分子标记,利用生物信息学方法对测序数据进行单核苷酸多态性(SNP)检测。通过置换测验对基因组区段内的等位基因频率进行差异显著分析,并利用生物统计学方法对具有显著性差异的数据进行显著性检验,预估拟南芥的突变位点的位置在1号染色体的末端位置,范围为2853000~2898000。 展开更多

关键词 基因突变 基因定位 等位基因 高通量测序

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浅析C++动态内存的分配及释放

13

作者 甘秋云 《蚌埠学院学报》 2018年第5期38-41,共4页

针对简单数据类型和复杂数据类型,通过测试程序及汇编码分别对new/delete、new[]/delete[]的作用机制进行说明,深入分析C++中内存分配及释放的实现原理。

关键词 new键 delete键 内存 申请 释放

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基于TF-IDF向量空间模型文本相似度算法的分析 被引量：6

14

作者 甘秋云 《池州学院学报》 2018年第3期41-43,共3页

相似度算法可以计算不同字符串之间的相似程度,基于向量空间模型和基于词条空间是目前衡量文本相似度的主要方法。本文主要通过向量空间模型(VSM)文本相似度算法及TF-IDF词频统计方法,分析探讨基于TF-IDF的文本相似度算法的实现,通过实... 相似度算法可以计算不同字符串之间的相似程度,基于向量空间模型和基于词条空间是目前衡量文本相似度的主要方法。本文主要通过向量空间模型(VSM)文本相似度算法及TF-IDF词频统计方法,分析探讨基于TF-IDF的文本相似度算法的实现,通过实验结果验证了该算法的有效性。 展开更多

关键词 向量空间 文本相似度 TF-IDF

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中文分词算法概述 被引量：3

15

作者 甘秋云 《唐山师范学院学报》 2013年第5期55-57,共3页

由于中文语言的复杂性,给中文分词系统带来了较大的困难,不论哪种分词系统都不能百分百的解决分词问题。针对目前中文分词存在的困难与问题,主要探讨了几种常见的中文分词算法及各自的优缺点。

关键词 中文分词 分词算法 分词方法

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基于最短路径的二元语法中文词语粗分模型的研究 被引量：1

16

作者 甘秋云 《现代计算机》 2013年第17期7-10,共4页

词语粗分是分词后续处理的基础和前提,直接影响到分词系统最终的准确率和召回率。针对目前常用分词方法单一使用时存在的不足,综合机械分词的高效性和统计分词的灵活性,设计一种基于最短路径的二元语法中文词语粗分模型。实验结果表明,... 词语粗分是分词后续处理的基础和前提,直接影响到分词系统最终的准确率和召回率。针对目前常用分词方法单一使用时存在的不足,综合机械分词的高效性和统计分词的灵活性,设计一种基于最短路径的二元语法中文词语粗分模型。实验结果表明,此粗分模型无论在封闭测试和开放测试中,还是在不同粗分模型对比测试和不同领域的开放测试中,都有较好的句子召回率。 展开更多

关键词 中文分词 最短路径 二元语法 词语粗分模型

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