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小鼠视网膜神经节细胞在视神经损伤后的基因表达谱分析
1
作者
彭碧燕
梁嘉敏
+15 位作者
韩可伊
王兵玉
甘子
晖
罗丹妮
何丽婷
朱易
黄诗颖
郭晓萍
施维
张俊
孙俊铭
薛康宁
方茜
欧阳轶强
王春苗
张名媛
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第2期168-176,共9页
目的:揭示小鼠视神经损伤后视网膜神经节细胞(RGCs)凋亡的分子机制和潜在的治疗靶点。方法:构建视神经损伤(ONC)小鼠模型,对视网膜组织进行HE染色观察组织病理学改变,并使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测RGCs标志物—具有多重剪接的RNA...
目的:揭示小鼠视神经损伤后视网膜神经节细胞(RGCs)凋亡的分子机制和潜在的治疗靶点。方法:构建视神经损伤(ONC)小鼠模型,对视网膜组织进行HE染色观察组织病理学改变,并使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测RGCs标志物—具有多重剪接的RNA结合蛋白(Rbpms)的mRNA表达水平;透射电镜(TEM)观察RGCs线粒体损伤情况;采用转录组测序分析ONC 7 d组小鼠的视网膜差异表达基因,并对差异表达基因进行Gene Ontology(GO)功能、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路富集和韦恩分析,RT-qPCR检测差异基因mRNA表达水平。结果:与正常组相比,ONC 7 d组RGCs数量显著减少,细胞排列疏松不规则,RGCs标志物Rbpms的mRNA表达水平显著降低(P<0.001),ONC小鼠模型构建成功。透射电镜结果表明,ONC 7 d组RGCs的线粒体出现肿胀,嵴消失;转录组测序结果表明,ONC 7 d组与正常组比,存在562个差异表达基因,其中152个基因表达下调和410个基因表达上调。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析表明ONC后差异表达基因主要富集于神经元损伤修复的多个重要信号通路;RT-qPCR结果显示,与正常组相比,与神经元损伤修复相关的基因Ecel1、Atf3、Sprr1a的表达均在损伤后第4天显著上调(均P<0.05),与测序结果一致。结论:ONC小鼠RGCs凋亡与线粒体损伤有关,而神经元损伤修复相关基因Atf3、Ecel1、Sprr1a在视神经损伤的早期参与了小鼠视神经损伤后RGCs的保护。
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关键词
视神经损伤
视网膜神经节细胞
青光眼
转录组分析
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职称材料
题名
小鼠视网膜神经节细胞在视神经损伤后的基因表达谱分析
1
作者
彭碧燕
梁嘉敏
韩可伊
王兵玉
甘子
晖
罗丹妮
何丽婷
朱易
黄诗颖
郭晓萍
施维
张俊
孙俊铭
薛康宁
方茜
欧阳轶强
王春苗
张名媛
机构
广西医科大学实验动物中心
广西医科大学基础医学院
广西医科大学生命科学研究院
广西医科大学附属肿瘤医院
广西医科大学第一附属医院
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2024年第2期168-176,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.32160137)
广西自然科学基金项目资助(No.2021GXNSFAA220005)
广西医科大学大学生创新创业项目资助(No.X202310598374)。
文摘
目的:揭示小鼠视神经损伤后视网膜神经节细胞(RGCs)凋亡的分子机制和潜在的治疗靶点。方法:构建视神经损伤(ONC)小鼠模型,对视网膜组织进行HE染色观察组织病理学改变,并使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测RGCs标志物—具有多重剪接的RNA结合蛋白(Rbpms)的mRNA表达水平;透射电镜(TEM)观察RGCs线粒体损伤情况;采用转录组测序分析ONC 7 d组小鼠的视网膜差异表达基因,并对差异表达基因进行Gene Ontology(GO)功能、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路富集和韦恩分析,RT-qPCR检测差异基因mRNA表达水平。结果:与正常组相比,ONC 7 d组RGCs数量显著减少,细胞排列疏松不规则,RGCs标志物Rbpms的mRNA表达水平显著降低(P<0.001),ONC小鼠模型构建成功。透射电镜结果表明,ONC 7 d组RGCs的线粒体出现肿胀,嵴消失;转录组测序结果表明,ONC 7 d组与正常组比,存在562个差异表达基因,其中152个基因表达下调和410个基因表达上调。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析表明ONC后差异表达基因主要富集于神经元损伤修复的多个重要信号通路;RT-qPCR结果显示,与正常组相比,与神经元损伤修复相关的基因Ecel1、Atf3、Sprr1a的表达均在损伤后第4天显著上调(均P<0.05),与测序结果一致。结论:ONC小鼠RGCs凋亡与线粒体损伤有关,而神经元损伤修复相关基因Atf3、Ecel1、Sprr1a在视神经损伤的早期参与了小鼠视神经损伤后RGCs的保护。
关键词
视神经损伤
视网膜神经节细胞
青光眼
转录组分析
Keywords
optic nerve crush
retinal ganglion cells
glaucoma
transcriptome analysis
分类号
R774.1 [医药卫生—眼科]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小鼠视网膜神经节细胞在视神经损伤后的基因表达谱分析
彭碧燕
梁嘉敏
韩可伊
王兵玉
甘子
晖
罗丹妮
何丽婷
朱易
黄诗颖
郭晓萍
施维
张俊
孙俊铭
薛康宁
方茜
欧阳轶强
王春苗
张名媛
《广西医科大学学报》
CAS
2024
0
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