目的:运用计算机虚拟筛选技术从传统中药数据库(TCMSP)中寻找埃博拉病毒三聚体糖蛋白(Trimeric glycoprotein of the Ebola virus,TGP-EBOV)的中药小分子抑制剂。方法:以TGP-EBOV为靶点,基于共识评分策略,采用GOLD和AutoDock两种算法的...目的:运用计算机虚拟筛选技术从传统中药数据库(TCMSP)中寻找埃博拉病毒三聚体糖蛋白(Trimeric glycoprotein of the Ebola virus,TGP-EBOV)的中药小分子抑制剂。方法:以TGP-EBOV为靶点,基于共识评分策略,采用GOLD和AutoDock两种算法的分子对接计算进行首轮筛选,然后运用ADME/T预测进行再次筛选,最后基于靶点与药物相互作用位点对候选药效分子进行相互作用分析。结果:以前人研究候选药效分子决奈达隆与胺碘酮为阳性对照,筛选出1个类药性良好的天然小分子化合物卫矛双糖甙(evobioside),它与靶标TGB-EBOV结合自由能低于决奈达隆与胺碘酮,并且确定了其中草药来源。结论:创新地采用共识评分策略进行高通量虚拟筛选TGP-EBOV抑制剂,该研究结果可促进从传统中药库中提取、设计以及实验合成抗埃博拉病毒的药效分子。展开更多
文摘目的:运用计算机虚拟筛选技术从传统中药数据库(TCMSP)中寻找埃博拉病毒三聚体糖蛋白(Trimeric glycoprotein of the Ebola virus,TGP-EBOV)的中药小分子抑制剂。方法:以TGP-EBOV为靶点,基于共识评分策略,采用GOLD和AutoDock两种算法的分子对接计算进行首轮筛选,然后运用ADME/T预测进行再次筛选,最后基于靶点与药物相互作用位点对候选药效分子进行相互作用分析。结果:以前人研究候选药效分子决奈达隆与胺碘酮为阳性对照,筛选出1个类药性良好的天然小分子化合物卫矛双糖甙(evobioside),它与靶标TGB-EBOV结合自由能低于决奈达隆与胺碘酮,并且确定了其中草药来源。结论:创新地采用共识评分策略进行高通量虚拟筛选TGP-EBOV抑制剂,该研究结果可促进从传统中药库中提取、设计以及实验合成抗埃博拉病毒的药效分子。
