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基于两层分类器的抗微生物肽种类预测
被引量：
2
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作者
李凤敏
王
晓茜
王
星
支
《内蒙古农业大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2014年第4期148-152,共5页
抗微生物肽是由宿主产生的一类能够抵御外界病原体感染的小分子多肽,由于其特殊的防御机制和不易产生抗药性,已经成为医学与生物学研究的热点。抗微生物肽应用于医学主要依靠其独特的生物学功能,所以从其功能层面对抗微生物肽进行预测...
抗微生物肽是由宿主产生的一类能够抵御外界病原体感染的小分子多肽,由于其特殊的防御机制和不易产生抗药性,已经成为医学与生物学研究的热点。抗微生物肽应用于医学主要依靠其独特的生物学功能,所以从其功能层面对抗微生物肽进行预测十分必要。本文选取氨基酸组分和伪氨基酸组分信息为特征向量,分别利用随机森林(RF)和k-近邻(KNN)算法,采用两层分类器对抗微生物肽种类进行预测,第一层分类器预测是否为抗微生物肽,成功率达到93.14%,第二层分类器针对抗微生物肽的五种生物学功能进行分类预测,成功率达到83.65%。
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关键词
抗微生物肽
伪氨基酸
随机森林
K-近邻
原文传递
蛋白质亚叶绿体和亚线粒体定位预测研究进展
2
作者
王
星
支
李凤敏
王
晓茜
《生物信息学》
2014年第4期276-280,共5页
蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能,因此蛋白质的功能与其亚细胞定位有着密切的联系,通过确定蛋白质在细胞中的位置可以获取蛋白质功能和结构的信息。在近二十年中,...
蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能,因此蛋白质的功能与其亚细胞定位有着密切的联系,通过确定蛋白质在细胞中的位置可以获取蛋白质功能和结构的信息。在近二十年中,蛋白质亚细胞定位预测算法研究已经取得很大的成绩,在此基础上,蛋白质在细胞器内亚结构的定位预测研究,如对蛋白质亚线粒体和亚叶绿体定位的研究成为更深层次的问题,本文简要介绍国内外在蛋白质亚叶绿体和亚线粒体定位预测方面的研究进展。
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关键词
亚线粒体
亚叶绿体
定位
预测
进展
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职称材料
题名
基于两层分类器的抗微生物肽种类预测
被引量：
2
1
作者
李凤敏
王
晓茜
王
星
支
机构
内蒙古农业大学理学院
出处
《内蒙古农业大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2014年第4期148-152,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31360206)
内蒙古自治区自然科学基金项目(2010MS0103)
内蒙古农业大学科技创新团队(NDPYTD2010-7)
文摘
抗微生物肽是由宿主产生的一类能够抵御外界病原体感染的小分子多肽,由于其特殊的防御机制和不易产生抗药性,已经成为医学与生物学研究的热点。抗微生物肽应用于医学主要依靠其独特的生物学功能,所以从其功能层面对抗微生物肽进行预测十分必要。本文选取氨基酸组分和伪氨基酸组分信息为特征向量,分别利用随机森林(RF)和k-近邻(KNN)算法,采用两层分类器对抗微生物肽种类进行预测,第一层分类器预测是否为抗微生物肽,成功率达到93.14%,第二层分类器针对抗微生物肽的五种生物学功能进行分类预测,成功率达到83.65%。
关键词
抗微生物肽
伪氨基酸
随机森林
K-近邻
Keywords
Antimicrobial peptides
pseudo amino acid composition
random forest
k-nearest neighbors
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
原文传递
题名
蛋白质亚叶绿体和亚线粒体定位预测研究进展
2
作者
王
星
支
李凤敏
王
晓茜
机构
内蒙古农业大学理学院
出处
《生物信息学》
2014年第4期276-280,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31360206)资助
内蒙古自治区人才开发基金资助
文摘
蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能,因此蛋白质的功能与其亚细胞定位有着密切的联系,通过确定蛋白质在细胞中的位置可以获取蛋白质功能和结构的信息。在近二十年中,蛋白质亚细胞定位预测算法研究已经取得很大的成绩,在此基础上,蛋白质在细胞器内亚结构的定位预测研究,如对蛋白质亚线粒体和亚叶绿体定位的研究成为更深层次的问题,本文简要介绍国内外在蛋白质亚叶绿体和亚线粒体定位预测方面的研究进展。
关键词
亚线粒体
亚叶绿体
定位
预测
进展
Keywords
Subchloroplast
Submitochondria
Location
Prediction
Progress
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
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1
基于两层分类器的抗微生物肽种类预测
李凤敏
王
晓茜
王
星
支
《内蒙古农业大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2014
2
原文传递
2
蛋白质亚叶绿体和亚线粒体定位预测研究进展
王
星
支
李凤敏
王
晓茜
《生物信息学》
2014
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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