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题名弥漫性大B细胞淋巴瘤预后相关lncRNA分子筛选
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作者
王庆卓
李莉娟
张连生
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机构
兰州大学第二医院血液科
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出处
《生物技术》
CAS
2023年第3期305-311,共7页
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基金
甘肃省自然科学基金项目(21JR7RA394,21JR11RA104)。
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文摘
[目的]用生信技术挖掘弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关的长链非编码RNA(lncRNA),探究其靶基因潜在的生物功能及核心靶基因。[方法]使用TCGA数据库中弥漫大B细胞淋巴瘤患者的基因表达矩阵和临床数据,以及GTEx中正常组织的表达矩阵,利用Cox回归筛选弥漫性大B细胞淋巴瘤预后相关的lncRNA。在筛选表达及预后差异显著的lncRNA后,使用LncSEA数据库预测其靶基因,并通过R包clusterProfiler进行GO和KEGG富集分析。最后,用STRING构建靶基因蛋白互作网络(PPI),并使用cytoscape筛选核心互作蛋白。[结果]得到了30个与弥漫大B细胞淋巴瘤预后显著的风险因子,其中LINC01473和SEC24B-AS1在DLBCL的表达显著高于正常对照组且预后显著;LINC01473和SEC24B-AS1的靶基因GO主要富集于转录调节复合物、DNA结合转录因子结合等生物过程;Cytoscape筛选出LINC01473和SEC24B-AS1的10个关键靶基因,包括EP300、MYC、TP53、JUN、HDAC1、SMAD4、ESR1、FOS、CEBPA和AR。[结论]LINC01473和SEC24B-AS1是弥漫性大B细胞淋巴瘤中高表达且预后显著的lncRNA,其靶基因调控通路及核心关键靶基因揭示了该疾病的生物学过程,为早期诊断治疗提供了生物标志物。
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关键词
弥漫性大B细胞淋巴瘤
长链非编码RNA
LINC01473
SEC24B-AS1
预后
蛋白互作网络
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Keywords
diffuse large B-cell lymphoma
long non-coding RNA
LINCO1473
SEC24B-ASI
prognosis
protein interaction network
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分类号
R733.1
[医药卫生—肿瘤]
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题名奥贝球铁中贝氏体亚结构的X射线衍射与计算机分析
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作者
王庆卓
吴登真
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出处
《球铁》
1991年第3期5-9,共5页
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关键词
球墨铸铁
贝氏体
结构
X射线衍射
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分类号
TG143.5
[一般工业技术—材料科学与工程]
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