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辣椒TIFY基因家族的鉴定与分析
1
作者
吴媛
苏世贤
+9 位作者
尤春生
张永平
汪淘
龙茶
韦金江
江苏燕
祝洪江
王娅
珠
邓代信
李伟
《种子》
北大核心
2023年第3期1-10,共10页
TIFY基因家族是植物特有的转录因子家族,利用生物信息学共鉴定了15个辣椒TIFY基因,其氨基酸数量在153~411个之间,分布于8条染色体上,所有CaTIFYs定位于细胞核中,进化关系分析表明CaTIFY可聚类为8个组,辣椒TIFYs与番茄TIFYs的亲缘关系最...
TIFY基因家族是植物特有的转录因子家族,利用生物信息学共鉴定了15个辣椒TIFY基因,其氨基酸数量在153~411个之间,分布于8条染色体上,所有CaTIFYs定位于细胞核中,进化关系分析表明CaTIFY可聚类为8个组,辣椒TIFYs与番茄TIFYs的亲缘关系最近。叶片和花发育中CaTIFY2、CaTIFY3、CaTIFY4、CaTIFY11基因的表达量较高,果皮和胎座发育中CaTIFY2、CaTIFY3、CaTIFY4、CaTIFY7、CaTIFY11、CaTIFY12基因的相对表达量较高,种子发育过程中CaTIFY2、CaTIFY4、CaTIFY11、CaTIFY12有较高的表达量。CaTIFYs基因启动子含有多种激素和非生物胁迫响应元件,转录组数据分析显示,在非生物胁迫和激素处理后根系中CaTIFY4、CaTIFY9、CaTIFY11、CaTIFY14基因的表达量明显上调,而叶片中CaTIFY9的表达量明显下调。
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关键词
辣椒
TIFY基因家族
生物信息学
基因表达
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职称材料
题名
辣椒TIFY基因家族的鉴定与分析
1
作者
吴媛
苏世贤
尤春生
张永平
汪淘
龙茶
韦金江
江苏燕
祝洪江
王娅
珠
邓代信
李伟
机构
贵州大学农学院
贵州大学辣椒产业技术研究院
贵定县农业农村局
贵州省果树蔬菜工作站
贵州省高等学校设施蔬菜工程研究中心
出处
《种子》
北大核心
2023年第3期1-10,共10页
基金
贵州省科技支撑计划定向重点项目(黔科合支撑[2022]重点010号-2)
贵州省高等学校设施蔬菜工程研究中心平台建设项目(黔教技[2022]040号)
+3 种基金
贵州省科技成果应用及产业化计划重点项目(黔科合成果[2020]1 Z 005号)
国家自然科学基金项目(31760576)
贵州省农业科技支撑项目(黔科合支撑[2016]2548号)
农业农村部/贵州省农业农村厅贵州省朝天椒优势产业集群建设项目(农产发[2020]2号,黔农发[2020]67号)。
文摘
TIFY基因家族是植物特有的转录因子家族,利用生物信息学共鉴定了15个辣椒TIFY基因,其氨基酸数量在153~411个之间,分布于8条染色体上,所有CaTIFYs定位于细胞核中,进化关系分析表明CaTIFY可聚类为8个组,辣椒TIFYs与番茄TIFYs的亲缘关系最近。叶片和花发育中CaTIFY2、CaTIFY3、CaTIFY4、CaTIFY11基因的表达量较高,果皮和胎座发育中CaTIFY2、CaTIFY3、CaTIFY4、CaTIFY7、CaTIFY11、CaTIFY12基因的相对表达量较高,种子发育过程中CaTIFY2、CaTIFY4、CaTIFY11、CaTIFY12有较高的表达量。CaTIFYs基因启动子含有多种激素和非生物胁迫响应元件,转录组数据分析显示,在非生物胁迫和激素处理后根系中CaTIFY4、CaTIFY9、CaTIFY11、CaTIFY14基因的表达量明显上调,而叶片中CaTIFY9的表达量明显下调。
关键词
辣椒
TIFY基因家族
生物信息学
基因表达
Keywords
pepper
TIFY gene family
bioinformatics
gene expression
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
辣椒TIFY基因家族的鉴定与分析
吴媛
苏世贤
尤春生
张永平
汪淘
龙茶
韦金江
江苏燕
祝洪江
王娅
珠
邓代信
李伟
《种子》
北大核心
2023
0
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