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黄芩高通量转录组测序数据组装和分析 被引量：7
1
作者 王德富 成媛媛 +2 位作者 杨锋 牛二波 牛颜冰 《山西农业科学》 2016年第8期1065-1072,共8页
采用高通量测序技术对黄芩的转录组进行测序,获得了29 099 899条reads数据,拼接后得到53 353条Unigene;将所获得的Unigene与COG,GO,KEGG,Swiss-Prot,NR这5个公共数据库进行比对,结果发现,分别有10 756,21 950,8 101,20 339,29 288条Unig... 采用高通量测序技术对黄芩的转录组进行测序,获得了29 099 899条reads数据,拼接后得到53 353条Unigene;将所获得的Unigene与COG,GO,KEGG,Swiss-Prot,NR这5个公共数据库进行比对,结果发现,分别有10 756,21 950,8 101,20 339,29 288条Unigene可比对到以上5个数据库中;已注释的Unigene与COG数据库比对后按功能可分为25类;根据GO功能可分为三大类57个亚类;经过与KEGG数据库比对后按照代谢通路可分为116类;利用Get ORF软件进行ORF预测,获得长度大于300 nt的ORF共20 552个;通过SSR分析,共获得5 658个SSR标记。获得的转录组信息可为今后进行黄芩分子标记的开发和关键基因的克隆及功能分析等研究提供基础数据。 展开更多
关键词 黄芩 转录组测序 生物信息学分析
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黄瓜绿斑驳花叶病毒山西西瓜分离物外壳蛋白基因序列分析 被引量：5
2
作者 杜江 成媛媛 +1 位作者 牛二波 牛颜冰 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期142-145,148,共5页
通过病毒dsRNA分离技术、非序列依赖性PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)技术和RTPCR等手段对采自山西太谷的西瓜病样进行了检测与鉴定,确定其为黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)所侵染。... 通过病毒dsRNA分离技术、非序列依赖性PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)技术和RTPCR等手段对采自山西太谷的西瓜病样进行了检测与鉴定,确定其为黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)所侵染。为明确CGMMV西瓜分离物(CGMMV-SXTG)的分类地位,本研究进一步克隆了CGMMV-SXTG的外壳蛋白基因(coat protein,CP)全序列并进行序列分析,系统进化树分析显示该分离物与亚洲分离物亲缘关系较近,而与欧洲分离物亲缘关系较远,表明该病毒的不同分离物在分组上可能与地域有一定的关系;接着对不同分离物的CP基因核苷酸序列和氨基酸序列进行同源性比对分析,结果表明该分离物与中国山东分离物(TANG)同源性最高,分别达到99.8%和99.6%。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 序列分析 外壳蛋白基因
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锦葵脉明病毒中国蜀葵分离物cp基因序列分析 被引量：4
3
作者 杨锋 牛二波 +1 位作者 王德富 牛颜冰 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期458-462,共5页
本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)和非序列依赖性PCR扩增技术(sequence-independent amplification,SIA)对表现出条斑症状的感病蜀葵进行了病原鉴定,结果发现侵染蜀葵的病原为锦葵脉明病毒(Malva vein clearing virus,MVC... 本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)和非序列依赖性PCR扩增技术(sequence-independent amplification,SIA)对表现出条斑症状的感病蜀葵进行了病原鉴定,结果发现侵染蜀葵的病原为锦葵脉明病毒(Malva vein clearing virus,MVCV),这是锦葵脉明病毒在国内首次报道。为进一步明确锦葵脉明病毒中国蜀葵分离物(MVCV-AR)的来源及进化关系,克隆获得其外壳蛋白(coat protein,cp)基因(Gen Bank登录号为KX619649)。通过与其他MVCV分离物的核苷酸及氨基酸序列比对分析可知,MVCV-AR与Mexico的tomato分离物(FJ561293)的核苷酸同源性最高为90.5%;与来自Italy的DS-Ba-01分离物(FM 212972)的氨基酸同源性最高为98.3%。系统进化分析表明,MVCV-AR与DS-Ba-01分离物聚为一簇,形成独立的分支。 展开更多
关键词 蜀葵 锦葵脉明病毒 病原鉴定
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植物保护通论课程教学改革与实践
4
作者 牛二波 《山东农业工程学院学报》 2024年第10期118-123,共6页
植物保护通论课程的开设,为学生深入研究植物保护学知识提供了有效途径。开展实际教学活动过程中,大力开展教学改革,能够及时更新植物保护学科知识体系,引入最新的理论、技术、方法,帮助学生建立与时俱进的知识结构。此外,通过增设实地... 植物保护通论课程的开设,为学生深入研究植物保护学知识提供了有效途径。开展实际教学活动过程中,大力开展教学改革,能够及时更新植物保护学科知识体系,引入最新的理论、技术、方法,帮助学生建立与时俱进的知识结构。此外,通过增设实地考察、实验操作等实践教学环节,提升学生的实践操作技能,令学生能够熟练运用植物保护技术解决实际问题。本次研究深入分析植物保护通论课程改革的重要作用,针对该课程开展过程中暴露的问题,从教学模式、教学内容、评价体系三个维度入手,对植物保护通论课程进行大刀阔斧式地改革。在此基础上,通过明确教学目标、设计教学内容、更新教学方法、提供教学资源保障等方式,提高植物保护通论课程实践水平,以期推动植物保护学科稳定健康发展。 展开更多
关键词 植物保护通论 教学改革 课堂田间结合
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纯洁健康　适切美感──读《荧屏瞬间──叶惠贤即兴主持100例》
5
作者 杨林成 牛二波 《当代修辞学》 CSSCI 1999年第2期42-42,共1页
关键词 修辞文本 电视节目主持人 领导艺术 适切 修辞学 语言研究 尊重人才 科学实验 市场营销 主持人语言
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