目的:探索AURKB和TOP2A在乳头状肾细胞癌(PRCC)组织中的表达及与预后的相关性。方法:从TCGA(the cancer genome atlas)数据库下载乳头状肾细胞癌mRNA的表达数据以及乳头状肾细胞癌患者的临床数据,利用R软件的相关包进行差异分析,筛选出...目的:探索AURKB和TOP2A在乳头状肾细胞癌(PRCC)组织中的表达及与预后的相关性。方法:从TCGA(the cancer genome atlas)数据库下载乳头状肾细胞癌mRNA的表达数据以及乳头状肾细胞癌患者的临床数据,利用R软件的相关包进行差异分析,筛选出差异基因。将差异基因导入STRING和Cytoscape中得到差异基因蛋白相互作用网络以及前10个关键基因,并通过GEPIA数据库验证,得到AURKB和TOP2A。进一步绘制出AURKB及TOP2A在PRCC中的表达及与临床预后的关系。最后我们选取部分肾乳头状细胞癌手术石蜡组织标本进行了实验验证。结果:AURKB和TOP2A在乳头状肾细胞癌组织中的表达量较癌旁组织中显著提高,与预后及临床特征有明显相关性,且AURKB与TOP2A表达量越高乳头状肾细胞癌患者预后越差。结论:应用生物信息学方法发现AURKB和TOP2A可能是作为PRCC预后指标。展开更多
文摘目的:探索AURKB和TOP2A在乳头状肾细胞癌(PRCC)组织中的表达及与预后的相关性。方法:从TCGA(the cancer genome atlas)数据库下载乳头状肾细胞癌mRNA的表达数据以及乳头状肾细胞癌患者的临床数据,利用R软件的相关包进行差异分析,筛选出差异基因。将差异基因导入STRING和Cytoscape中得到差异基因蛋白相互作用网络以及前10个关键基因,并通过GEPIA数据库验证,得到AURKB和TOP2A。进一步绘制出AURKB及TOP2A在PRCC中的表达及与临床预后的关系。最后我们选取部分肾乳头状细胞癌手术石蜡组织标本进行了实验验证。结果:AURKB和TOP2A在乳头状肾细胞癌组织中的表达量较癌旁组织中显著提高,与预后及临床特征有明显相关性,且AURKB与TOP2A表达量越高乳头状肾细胞癌患者预后越差。结论:应用生物信息学方法发现AURKB和TOP2A可能是作为PRCC预后指标。
